Flujos de trabajo de NGS

Gracias a los avances logrados con la secuenciación de última generación (Next-Generation Sequencing, NGS), la secuenciación de ARN se ha vuelto fundamental para una diversa variedad de estudios de diversos tipos de ARN. Las tecnologías actuales van más allá de examinar la expresión de ARNm e incluyen miARN de secuenciación, además de transcriptomas completos. Recientemente, se han desarrollado varias técnicas para superar desafíos clave y mejorar los resultados, por ejemplo, al reducir el ARNr y abordar conjuntos específicos de transcritos mediante secuenciación de ARN digital.

Mejore la secuenciación de ARN con la eliminación eficaz de ARNr

Durante la preparación de la genoteca de secuenciación de ARN, los ARN sumamente abundantes de bajo valor científico, como el ARNr o el ARNm de globina, pueden agotar toda la valiosa capacidad de secuenciación y poner en peligro la capacidad para obtener lecturas de expresión génica en la diana. La eliminación eficaz de ARN no deseado es un paso fundamental previo a la secuenciación de ARN.
La nueva tecnología QIAseq FastSelect rRNA Removal permite eliminar ARN no deseado en un solo paso de pipeteo de muestras de ARN de mamíferos, bacterias, plantas, e incluso levaduras. Tanto si busca eliminar ARNr citoplasmático y mitocondrial para el análisis de transcriptoma completo, como librarse de ARNm de globina para la investigación de expresión génica utilizando muestras de sangre, la nueva tecnología puede maximizar las lecturas utilizables.

Las ventajas de la secuenciación de 3’

El uso de secuenciación de ARN de 3’ ha sido decisivo en las vías de señalización celular para satisfacer la necesidad cada vez mayor de contar con soluciones de alto rendimiento que también garanticen mayor exactitud, especificidad y sensibilidad. Estas historias de usuarios explican cómo obtuvieron NGS de transcriptoma de 3' de alto rendimiento a partir de cantidades ultrabajas de ARN para el análisis de expresión génica.