two scientists in a laboratory working on computer screens
Secuenciación de última generación

Soluciones de NGS para la vigilancia genómica de SARS-CoV-2

En la carrera contra las nuevas variantes de virus, cada hora y cada minuto importan

El último giro de la pandemia de la COVID-19 es el alarmante surgimiento de nuevas variantes preocupantes (Variants of Concern, VOC) del SARS-CoV-2, como las variantes Alfa, Beta, Gama, Delta, Mu y Omicron. Estas nuevas variantes son capaces de eludir la respuesta inmunitaria, por lo que la eficacia de la vacuna podría reducirse. Este es el verdadero reto. Los laboratorios están sometidos, por lo tanto, a la presión de secuenciar las muestras lo más rápido posible para identificar nuevas variantes del SARS-CoV-2 y detectar las existentes entre la población. Para ayudarle a impulsar las tareas de vigilancia genómica del SARS-CoV-2, hemos desarrollado dos soluciones personalizadas para la amplificación vírica y la preparación de genotecas de NGS.

NGS solutions for Omicron bubble

Consiga la solución de vigilancia genómica más adecuada para sus necesidades

Cuanto más rápido secuencie las muestras, más rápido conseguirá una imagen completa de las variantes circulantes, lo que le permitirá ir un paso por delante. Descubra cómo pueden ayudarle nuestras soluciones de vigilancia genómica.

Product Kitbox
Nuevo QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit

Impulse la vigilancia genómica del SARS-CoV-2 con una solución de NGS de alto rendimiento un 50 % más rápida. El alto rendimiento del QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit garantiza una cobertura superior con un flujo de trabajo automatizable de 4 horas y una reducción del 50 % en el uso de plásticos.

¡Novedad! QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit

El QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit funciona para aumentar aún más la cobertura genómica a la vez que simplifica el flujo de trabajo cuando se combina con el QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit.

Las soluciones de QIAseq proporcionan las siguientes ventajas:

  • Un flujo de trabajo sencillo: No es necesario normalizar y cuantificar antes de la amplificación de la genoteca
  • Mayor uniformidad y cobertura genómica: Cobertura superior al 95 % incluso con un número de copias del genoma vírico extremadamente bajo
  • Un requisito de lectura más bajo: Reducción de 4 veces el número de agregados recomendados por muestra, que reduce los costes de secuenciación y permite una mayor multiplexación

Solo por tiempo limitado, obtenga el QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit sin cargo adicional cuando adquiera el QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit. Se aplican términos y condiciones.

Mejore su flujo de trabajo con nuestra ayuda
Póngase en contacto con su representante de ventas local de QIAGEN para aprovechar la oferta del QIAseq DIRECT
SARS-CoV-2 Enhancer Kit.
Informe: Identificación de variantes preocupantes en muestras reales de COVID

Conozca cómo Nicolò Musso y su equipo de la Universidad de Catania analizaron 250 muestras positivas para la COVID de diferente calidad de ARN con el QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit y detectaron muchas de las variantes preocupantes que circulaban en la población local en ese momento, incluidas las variantes Alfa, Gamma y Delta.

Coronavirus poster
Corona virus, COVID-19, virus with antibodies
Variantes, vigilancia y eficacia de las vacunas: Giros de la pandemia de COVID-19
A medida que la pandemia de COVID-19 sigue evolucionando con la aparición de la variante Omicron, analice cómo la NGS, en particular la secuenciación del genoma completo, se está utilizando para determinar la prevalencia de las variantes circulantes. Nuestra entrada en el blog se centra en la detección de variantes del SARS-CoV-2, muestras de aguas residuales, mutaciones para las que la vacuna podría no ser suficiente y mucho más.
¿Por qué escoger el QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit?

Utilice nuestra solución de NGS ultrarrápida, de alto rendimiento y sencilla si desea maximizar la eficacia, impulsar sus capacidades de secuenciación y garantizar la máxima cobertura para acelerar la detección de variantes.

4 horas
de flujos de trabajo de preparación y enriquecimiento de genotecas que le permiten pasar del ARN purificado a la secuenciación, sin necesidad de fragmentación, marcado o ligadura.
~250 pb
de amplicones generados para una uniformidad superior, una mejor cobertura del genoma del SARS-CoV-2 y un mejor rendimiento de la secuenciación en comparación con las opciones basadas en amplicones más utilizadas del sector.
Hasta 768
muestras pueden multiplexarse para mejorar la escalabilidad y la eficacia.
50 %
de reducción en el uso de plásticos.
QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel

Acelere la detección de variantes del SARS-CoV-2 y la vigilancia genómica en tiempo real con nuestro flujo de trabajo adaptable y de un único día, que es más rápido y tiene menos requisitos de entrada que las soluciones de Hybrid Capture. A partir de una serie de diseños de ARTIC V3 optimizados y de disponibilidad pública, el QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel proporciona un enriquecimiento dirigido del genoma vírico completo, lo que le permite:

  • Alcanzar un alto nivel de cobertura, incluso en los casos de número de copias bajo por pérdidas del cebador y efectos de dímeros del cebador
  • Multiplexar hasta 384 muestras en una sola ejecución en las plataformas Illumina de alto rendimiento
  • Visualizar y realizar seguimientos de la divergencia filogénica con flujos de trabajo de análisis bioinformáticos integrados
La mejor combinación para una adaptabilidad mejorada

Combine el QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel con el QIAseq FX DNA Library UDI Kit para multiplexar hasta 384 muestras en una sola ejecución.

QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel
QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel
Preparación de genotecas de genoma completo dirigidas de SARS-CoV-2 para la vigilancia genómica y la detección de variantes
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QIAseq FX DNA Library UDI Kit
QIAseq FX DNA Library UDI Kit
Preparación de genotecas de Hybrid Capture y genoma completo de todas las enzimas para instrumentos Illumina con el mínimo sesgo
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Comience con un kit de prueba

QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel Kit

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QIAseq FX DNA Library UDI Kit

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Automatice y agilice la preparación de genotecas
¿Qué ventajas proporciona la automatización de la preparación de genotecas de NGS a su laboratorio?
Genomics, QIAseq NGS Solutions, Dr. Mette Christiansen, Aarhus University hospital, COVID-1
Secuenciación de mutaciones de COVID-19 posterior al salto de la barrera interespecífica

En noviembre de 2020, se creyó que más de 200 personas en Dinamarca se contagiaron de la COVID-19 a través del contacto con visones. Mientras tanto, el virus había ido mutando entre las distintas especies animales y dando lugar a un puñado de variantes. La Dra. Mette Christiansen, Head of the Diagnostic NGS Core Facility, Molecular Medicine (MOMA) en el Aarhus University Hospital, analiza cómo se obtuvo una panorámica clara de las variantes en circulación gracias a la secuenciación de los casos positivos. Descubra cómo facilitaron esta labor las tecnologías de NGS de QIAGEN.

Publicaciones

Infección aguda por la variante alfa del SARS-CoV-2 que ocasiona insuficiencia placentaria y sufrimiento fetal

Explore cómo la secuenciación del genoma completo del SARS-CoV-2 mediante el QIAseq Direct SARS-CoV-2 Kit fue útil para identificar una cepa mutada de la variante alfa del SARS-CoV-2 en un estudio sobre las relaciones entre la infección aguda por la variante alfa del SARS-CoV-2 y la insuficiencia placentaria y el sufrimiento fetal.

Referencia: Dumont, S., Balduyck, J., Reynders, M., Vanwalleghem, L. and Lebbe, B. (2021) Acute SARS-CoV-2 alpha variant infection leading to placental insufficiency and fetal distress.

La tecnología de QIAseq ha demostrado estar entre las más eficaces para la secuenciación del genoma completo del SARS-CoV-2

Según un estudio reciente, en el que se evaluaban distintos métodos de secuenciación del genoma completo del SARS-CoV-2, el QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel multiplica la capacidad de amplificación preferencial del genoma del SARS-CoV-2 por 100 y garantiza una cobertura óptima.

Referencia: Liu et al. (2020) A benchmarking study of SARS-CoV-2 whole-genome sequencing protocols using COVID-19 patient samples.

Seguimiento de mutaciones en el ARN del SARS-CoV-2 con la tecnología QIAseq

Descubra cómo el QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel ha contribuido a proporcionar una visión detallada sobre la acumulación de mutaciones en el genoma del SARS-CoV-2 en este estudio llevado a cabo en Indonesia.

Referencia: Maitra, A. et al. (2020) Mutations in SARS-CoV-2 viral RNA identified in Eastern India: Possible implications for the ongoing outbreak in India and impact on viral structure and host susceptibility

La expresión alterada de microARN en pacientes con COVID-19 permite identificar la infección por SARS-CoV-2

Lea cómo el QIAseq miRNA Library Kit y el QIAseq miRNA NGS 48 Index IL ayudaron a determinar la expresión alterada de miARN en pacientes con COVID-19, lo que condujo al desarrollo de características distintivas fiables de biomarcadores de miRNA de la COVID-19.

Referencia: Farr, R. et al. (2021) Altered microRNA expression in COVID-19 patients enables identification of SARS-CoV-2 infection

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El objetivo es aumentar la secuenciación del virus y proporcionar vigilancia, seguimiento y pruebas continuas
Director-General, Organización Mundial de la Salud

Consulte nuestros seminarios web

Más allá de la vigilancia del SARS-CoV-2: ¿Cómo puede la secuenciación de última generación apoyar la epidemiología basada en las aguas residuales?
Más allá de la vigilancia del SARS-CoV-2: ¿Cómo puede la secuenciación de última generación apoyar la epidemiología basada en las aguas residuales?
Orador: Davida Smyth, Ph.D., profesora titular de microbiología de la Universidad de Texas A&M en San Antonio, Texas
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Impulse las tareas de vigilancia genómica del SARS-CoV-2 con una nueva solución de NGS de alto rendimiento
Impulse las tareas de vigilancia genómica del SARS-CoV-2 con una nueva solución de NGS de alto rendimiento
Oradores: Ldo. Brian Dugan, Associate Director, Global Product Management, Genomics, QIAGEN y Dr. Fernando Spilki, Feevale University, Novo Hamburgo, Brasil
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Vigilancia genómica de alto rendimiento en las cepas B.1.1.7 y B.1.351 del SARS-CoV-2
Vigilancia genómica de alto rendimiento en las cepas B.1.1.7 y B.1.351 del SARS-CoV-2
Oradores: Brian Dugan, M.S., Director Asociado, Gestión Global de Productos, Genómica, QIAGEN y Shawn Prince, B.S., Científico Sénior de Aplicaciones de Campo, Bioinformática, QIAGEN
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Obtenga más información sobre los datos metatranscriptómicos del SARS-CoV-2
Descubra cómo nuestras soluciones de NGS pueden aumentar la sensibilidad de secuenciación de ARN en investigaciones metatranscriptómicas del SARS-CoV-2.

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SARS-CoV-2 Whole Genome Sequencing Services
SARS-CoV-2 Whole Genome Sequencing Services
Agilice las tareas de vigilancia genómica de SARS-CoV-2 aprovechando nuestras soluciones integrales SARS-CoV-2 Whole Genome Sequencing Services. Amplíe sus recursos internos con los servicios personalizados y la experiencia que espera de QIAGEN.
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Analice los datos de secuenciación de SARS-CoV-2 de forma sencilla
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Interprete correctamente los datos de secuenciación de SARS-CoV-2 a través de soluciones bioinformáticas integradas. La solución QIAGEN CLC Genomics Workbench es fácil de usar e intuitiva y posibilita la visualización y comparación de varias lecturas y variantes de forma simultánea. El nuevo QIAGEN CoV-2 Insights Service ofrece una infraestructura de nube de bajo coste y muy adaptable para el procesamiento distribuido, el análisis y la elaboración de informes de variantes y estirpes de SARS-CoV-2. Acelere la obtención de información importante, desde análisis filogenéticos hasta estudios metagenómicos, con nuestras soluciones bioinformáticas integradas para la vigilancia genómica de SARS-CoV-2.
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