NGS-seq
Secuenciación de última generación

Desentrañe la complejidad de los genomas gracias a las soluciones de secuenciación de ADN

Independientemente de si su objetivo es detectar variantes de ADN o identificar fusiones de ARN nuevas o conocidas, los flujos de trabajo complejos, los tiempos de espera largos y las muestras limitadas pueden obstaculizar el avance, aumentar los costes y retrasar la obtención de los datos que le permitan trabajar. Nuestras tecnologías de secuenciación de ADN de alto rendimiento están optimizadas para que estos retos no le supongan un problema. Así, podrá secuenciar regiones de alto contenido GC con fiabilidad, identificar variantes de baja frecuencia con precisión y sacar el máximo partido de cada muestra, incluso de aquellas de menor calidad o cantidad. Si necesita un panel personalizado, nuestros expertos le asesorarán en el diseño inteligente de paneles.

Información genómica impulsada por QIAseq

Las soluciones de QIAseq se basan en las siguientes metodologías innovadoras para minimizar el sesgo y maximizar la cobertura genómica, la uniformidad y la precisión.

QIAseq Tumor Mutational Burden Panels
Redefina la secuenciación de amplicones: Detecte la variante más importante mediante la secuenciación de ADN diana

Los sesgos en genotecas, falsos positivos y resultados duplicados de PCR pueden perjudicar la calidad de los datos de secuenciación diana. Mejore la precisión y la fiabilidad de su flujo de trabajo gracias al enfoque de secuenciación del ADN digital.

Nuestros paneles de secuenciación del ADN diana, compatibles con distintas plataformas y elaborados por expertos del sector utilizan índices moleculares únicos para garantizar una cobertura óptima de:

  • Regiones genómicas con alto contenido GC
  • Regiones de exones de genes
  • Puntos de acceso
  • SNP
  • Regiones promotoras y de intrones
¿Mutaciones de baja frecuencia o errores?

La secuenciación de ADN diana mediante paneles es un enfoque muy potente para detectar variantes de baja frecuencia. Sin embargo, una de sus desventajas es que todos los fragmentos de ADN son exactamente iguales, por lo que es prácticamente imposible detectar los errores de secuenciación y las moléculas de ADN únicas. Por ello, capacidad de detectar variantes de ADN de baja frecuencia de forma fiable es limitada. Sin embargo, esto no ocurre con QIAseq. Todos los paneles personalizados y de catálogo contienen índices moleculares únicos, lo que permite marcar las moléculas de ADN originales y eliminar las lecturas con fallo debido a errores de lectura de la máquina, polimerasa y PCR.

Next-generation sequencing
Next-generation sequencing
Llegue a las regiones más inaccesibles del genoma

Los productos QIAseq incluyen enzimología y tampones de secuenciación de amplicones, lo que le permite alcanzar las regiones más inaccesibles del genoma. La combinación química que se emplea en el flujo de trabajo y los paneles de ADN diana de QIAseq es compatible con las regiones genómicas normales y con niveles altos de GC. Consiga una cobertura del 100 % de los genes con alto contenido en GC, como CEBPA y CCND1, gracias a la metodología de microarrays.

Métricas de secuenciación excepcionales

Uniformidad: Los paneles estándar suelen alcanzar una uniformidad de alrededor del 99,5 % con una media de cobertura de 0,2x y del 96 % en una media de cobertura de 0,5x.

Sensibilidad: Consiga una mayor fiabilidad en la detección de variantes de ADN de baja frecuencia. Los paneles estándar funcionan con una sensibilidad de en torno al 90 % para 1 % de NA12878 SNP y un indel en una región de codificación típica con menos de 15 falsos positivos por región de megabase.

Mayor multiplexado: Las soluciones de otros fabricantes ofrecen multiplexados de 96 muestras. QIAseq va más allá: permite multiplexar 384 muestras mediante índices específicos de QIAseq.

Historia de éxito destacada

Dr. Fergus J Couch
«Los paneles QIAseq consiguen llegar a las regiones más inaccesibles del genoma gracias a la estrategia de diseño de expansión del de cebador único. Pueden procesarse hasta 1500 muestras por secuenciación de forma simultánea».

Dr. Fergus Couch, Mayo Clinic

 

Estrategia de expansión de cebador único frente a la de amplicón de doble cebador
A través de esta comparación exhaustiva de los métodos de secuenciación dirigida, se analiza por qué el método de expansión de cebador único (SPE) es más eficaz.
Resuelva los problemas que supone el diseño de paneles

¿Le frustran las decisiones complicadas en lo que respecta al contenido del diseño de paneles de NGS? ¿Le preocupa el alto contenido GC? En lo que respecta al diseño de paneles, le podemos asegurar que los paneles personalizados cumplan los siguientes criterios para que se dirijan mejor a la región de interés:

  • Cobertura máxima
  • Sesgo mínimo
  • Uniformidad
Woman in front of business plan
QIAseq BioX
Solución unificada y única para análisis de datos y NGS

Combina la precisión de nuestros paneles de ADN de QIAseq con herramientas de bioinformática intuitivas. Ahora, los paneles de ADN de QIAseq incluyen licencias de suscripción para CLC Genomics Workbench y QIAGEN Clinical Insight (QCI)-Interpret para el software de QIAseq, por lo que será muy sencillo pasar de la generación de datos a la obtención de grandes cantidades de información de forma fácil y rápida.

Reduzca las mezclas de muestras y maximice el rendimiento de secuenciación

El índice doble único (UDI) proporciona los niveles más elevados de seguridad en los procesos y garantiza la fiabilidad de los datos de secuenciación, ya que reducen los saltos entre índices y la asignación errónea de lecturas. El índice doble único permite maximizar el rendimiento de la secuenciación para reducir los costes de secuenciación por muestra. Gracias a la combinación de los enfoques de índice molecular único e índice doble único, los paneles dirigidos de QIAseq proporcionan un nivel de precisión sin precedentes.
De la muestra a la información sobre la enfermedad en tiempo récord

Un proceso de secuenciación exomático optimizado con tiempos de espera reducidos que le llevará desde la muestra hasta la interpretación y clasificación de variantes estandarizadas.

Secuenciación de exomas ampliable y automatizable con un flujo de trabajo de un único día

¿Está examinando un exoma para identificar las variantes que causan determinada enfermedad, pero le preocupa la uniformidad de la cobertura debido a la composición de GC?

Detecte variantes patogénicas con fiabilidad, facilidad y eficacia gracias a nuestros flujos de trabajo ampliables, compatibles con la automatización y de un único día. Gracias a la tecnología de captura híbrida, los QIAseq Human Exome Kits garantizan lo siguiente:

  • Detección de variantes de alta sensibilidad en dianas de más de 500 genes
  • Reducción de los costes de secuenciación de hasta un 50 % por muestra
  • Reducción del 40 % del tiempo de espera general desde el análisis de la muestra hasta la obtención de los datos

La integración sencilla con QIAGEN CLC Genomics Workbench posibilita la detección rápida de variantes. Por otra parte, el software QCI Translational garantiza una interpretación precisa de las variantes y la obtención de datos específicos de cada enfermedad, sin la carga que supone el procesamiento manual.

Obtenga una panorámica completa del genoma

La secuenciación de captura híbrida y de genoma completo proporcionan una imagen holística de todo el genoma, y permiten obtener más información que a partir de otras metodologías. Sin embargo, estos procesos pueden suponer un alto coste y mucho tiempo. Gracias a las soluciones de QIAseq, estas metodologías son más accesibles, ya que permiten maximizar la calidad de los datos de cada muestra.

Las soluciones de QIAseq proporcionan las siguientes ventajas:

  • Combinaciones avanzadas de sustancias químicas para muestras de apenas picogramas y protocolos ágiles y automatizables
  • Fragmentación enzimática de ADN sin que sea necesario recurrir a equipos mecánicos para esta tarea, que a veces resultan costosos
  • Mayor eficacia en las ligaduras para un rendimiento y una tasa de conversión más altos, ya que evita la formación de dímeros adaptadores
  • Representación de G/C uniforme a partir de cualquier tipo de organismo
  • Formatos de kit cómodos que incluyen adaptadores de doble código de barra
QIAseq FX Library
Historia de éxito destacada

Dr. Egbert Schulze, de la Endocrinology and Nuclear Medicine Community Practice de Heidelberg, analiza cómo el flujo de trabajo totalmente enzimático de QIAseq FX posibilita una cobertura uniforme y le ha permitido obtener resultados de secuenciación fiables en su investigación.

Descifrado de la diversidad microbiana

Los datos metagenómicos se emplean para examinar las especies que se encuentran en los microbiomas naturales o sanos, cuantificar la abundancia de genes resistentes a los antibióticos o virulentos, o comprender las causas, efectos y posibles tratamientos de una amplia variedad de enfermedades. Las soluciones de NGS de QIAseq, que abarcan desde la secuenciación de amplicones de PCR hasta los análisis metagenómicos completos, están diseñadas para desentrañar la complejidad genómica de cada una de sus muestras.

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¡Forme parte de la revolución genómica! Asóciese con QIAGEN y disfrute de las ventajas de trabajar con una empresa con más de 20 años de experiencia en soluciones Sample to Insight. Nuestras soluciones genómicas para empresas simplifican la detección de biomarcadores, en todo el proceso, desde el diseño de paneles hasta el análisis y más allá, para impulsar su investigación.

Todas estas fotos se tomaron antes de la COVID-19