Qproteome Cell Compartment Kit

Pour le fractionnement de protéines selon la localisation cellulaire

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Qproteome Cell Compartment Kit

Cat. No. / ID:   37502

Pour 10 fractionnements sous-cellulaires maximum : tampon d’extraction, solution d’inhibiteur de la protéase, Benzonase®.
471,00 CHF
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This product contains substances regulated under REACH (EC 1907/2006 Annex XIV). The use of this product in the EU is permitted subject to an exemption (Article 56(3)). Please refer to the REACH notification and the SDS of this product, both of which can be found in the “Resources” section of this page, for more information.
Le Qproteome Cell Compartment Kit est destiné aux applications de biologie moléculaire. Ce produit n’est pas conçu pour le diagnostic, la prévention ou le traitement des maladies.

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Détails produit

Les cellules eucaryotes sont des systèmes hautement structurés, complexes et bien organisés. Le kit de compartiment cellulaire est conçu pour un fractionnement sous-cellulaire rapide et facile des cellules eucaryotes et tissus intacts. Grâce à l’ajout consécutif de différents tampons d’extraction à un culot cellulaire, il est possible d’isoler les protéines de façon sélective dans les différents compartiments cellulaires.

Performances

Le Qproteome Cell Compartment Kit permet la localisation simple et efficace de protéines de marqueur propres à un compartiment cellulaire à partir de cellules isolées (voir les illustrations  Séparation spécifique de protéines de marqueur et  Localisation de protéines dans des cellules dans diverses conditions de croissance) ou à partir d’échantillons de tissus (voir l’illustration  Localisation de protéines dans des échantillons de tissus).
Voir les illustrations

Principe

Le kit contient 4 tampons d’extraction, ce qui permet l’isolement séquentiel des protéines associées au cytosol, aux membranes, au noyau et au cytosquelette à partir de lysats cellulaires ou de tissus.

Procédure

Les 4 tampons d’extraction sont ajoutés consécutivement à un culot cellulaire puis les fractions correspondantes sont isolées par centrifugation (voir le schéma).

Dans un autre protocole pour les tissus, les échantillons sont simultanément homogénéisés et désintégrés à l’aide du TissueRuptor avant d’être traités comme le culot cellulaire.

Applications

Le fractionnement sous-cellulaire de protéines peut être utilisé pour l’enrichissement d’espèces peu abondantes ; pour définir la localisation sous-cellulaire d’enzymes, de protéines régulatrices et de protéines structurales ; et pour surveiller la redistribution compartimentée des biomolécules dans des conditions de base et de stimulation.

Données et illustrations utiles

Specifications

FeaturesSpecifications
ApplicationsFRSDS-PAGE, spectrométrie de masse
Fractions isolatedQuatre fractions
Start materialLysat cellulaire
Sample size~ 5 × 10e6 cellules
Binding capacity/yieldVariable
SpeciesEucaryotes

Ressources

Safety Data Sheets (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
Kit Handbooks (2)
For the subcellular fractionation of proteomic
samples
Quick-Start Protocols (1)
Certificates of Analysis (1)

FAQ

Which Qproteome or Protein Fractionation Kits from QIAGEN are compatible with tissue samples?

The Qproteome Cell Compartment Kit, the Qproteome Nuclear Protein Kit, the Qproteome Mitochondria Isolation Kit, and the PhosphoProtein Purification Kit are compatible with tissue samples. The respective protocol can be found in the respective handbook.

The Qproteome Mammalian Protein Prep Kit is also compatible with tissue, there is the QIAGEN Supplementary Protocol: Purification of protein from animal tissues using the Qproteome Mammalian Protein Prep Kit and the TissueRuptor™ available. For all these protocols the TissueRuptor is used.

 

 

 

FAQ ID -755
Do the Buffers CE1 - CE4 of the Qproteome Cell Compartment Kit contain DTT or any reducing agent?
No, none of the buffers of the Qproteome Cell Compartment Kit contain reducing agents.
FAQ ID -824
Will acetone precipitation recommended in the Qproteome Protocols denature Protein?
Acetone precipitation recommended in the protocols for the Qproteome Protein Fractionation Kits leaves most proteins in a native state. Some proteins may partially denature when precipitating with acetone.
FAQ ID -807
Is it possible to perform immunoprecipitation (IP) directly on protein fractions from the Qproteome Cell Compartment Kit?

We have not tested immunoprecipitation on protein fractions from the Qproteome Cell Compartment Kit. However, since Buffers CE1, CE2 and CE3 are native buffers, we would expect that they would work for this application. It might be a good idea to dilute the fractions 1:1 with a buffer already tested for immunoprecipitation to adjust to IP conditions. Buffer CE4 is strongly denaturing, so the final protein fraction 4 may not be used for immunoprecipitation.

 

FAQ ID -855
How do I perform an Acetone Precipitation for concentrating and desalting protein samples?

The following protocol is suitable for concentrating and desalting protein samples for downstream applications such as 2D-PAGE:

  • Add four volumes of ice-cold 100% acetone to the protein fraction and incubate for 15 minutes on ice
  • Centrifuge for 10 minutes at 12,000 x g in a pre-cooled microcentrifuge at 4°C
  • Discard the supernatant and air dry the pellet
  • Resuspend the pellet in an appropriate sample buffer required for the downstream application

You will find this protocol also in the handbooks for QIAGEN's QProteome Protein Fractionation Kits.

FAQ ID -1035
Which fraction will contain endosomal, microsomal and lysosomal proteins using the Qproteome Cell Compartment Kit?
Endosomal, microsomal and lysosomal proteins will be present in membrane protein fraction 2, as organelles remain intact after addition of Buffer CE1 during the first fractionation step with the Qproteome Cell Compartment Kit.
FAQ ID -808
Which fraction will contain soluble mitochondrial proteins using the Qproteome Cell Compartment Kit?
Soluble mitochondrial proteins will be present in membrane protein fraction 2 when using the Qproteome Cell Compartment Kit.
FAQ ID -839