dPCR Qiacuity instrument

デジタルPCRワークフローおよび製品

QIAcuityデジタルPCRシステムは、マイクロ流体ナノプレートを用いたデジタルPCR(dPCR)プラットフォームであり、パーティショニング、サーマルサイクリング、イメージング/データ取得というdPCRに必要な一連のステップを1台の装置ですべて行うことができます。

QIAcuityの優位性

拡張性
拡張性

低スループットから高スループットまで対応する装置構成 – 1プレート、4プレート、8プレート、内蔵のサーモサイクラーは最大で2つ。

スループット
スループット
作業日に処理するサンプル数は、使用するプレート(24ウェルおよび96ウェル)および装置(1プレート、4プレート、8プレート)の構成に応じて、96サンプルから1248サンプルまで増やせます。
マルチプレックス化
マルチプレックス化

最大8つの検出チャンネル(標準の6チャンネル + 長いストークスシフト色素に使用するハイブリッドの2チャンネル) – 振幅をマルチプレックス化しQIAcuity High Multiplex Probe PCR Kitを用いると、12のターゲットの並行検出が可能です。

結果までの時間
結果までの時間

簡潔かつ迅速なプレートベースのワークフローにより、ユーザーはサンプルから2時間未満で結果を得られます。

pcr dpcr qiacuity workflow

QIAcuityでの処理の流れは?

リアルタイムPCR実験と同様に、サンプル調製では、マスターミックス、プローブ、プライマーを8、24、または96ウェルナノプレートに加え、その後サンプルを加えます。このシステムは、パーティショニング、ヒートサイクリング、イメージングを1つに統合した完全自動化装置です。サンプルから結果まで2時間未満で完了します。専用ソフトウェアのSoftware Suiteは、ターゲット配列のマイクロリットルあたりのコピー数(濃度)を示すことに加え、陽性サンプルやNTCなどの品質コントロールも解析できます。この解析は、同じローカルエリアネットワーク(LAN)内の離れた場所にあるコンピューターでも行うことができます。

エコシステムとしてのQIAcuity

QIAcuityデジタルPCRシステムを使用することは優れた基盤となりますが、このシステムではエコシステムの考え方を取り入れ、デジタルPCR反応を真の成功に導くため、対応する付属品、キット、アッセイを幅広く用意しています。

遺伝子発現の解析、希少突然変異の検出、微生物の定量では戦略が異なります。実利のある洞察を戦略から得るため、適切なツールを探すのに苦労する必要はありません。QIAcuityエコシステムで利用できる多岐にわたるオプションを探索すれば、目的のアプリケーションに合わせてデジタルPCRをカスタマイズできます。

QIAcuity_DX
QIAcuityDxで臨床PCRのワークフローを効率化

QIAcuityDxは、IVDアプリケーションに特化しています。この全自動システムでは、手作業の時間が減り、重要な遺伝子変異を確実に検出・定量することで、診断の正確性と操作効率が向上します。QIAcuityDxのユーティリティモード、IVD医療機器消耗品、試薬、ソフトウェアを使用することで、ユーザー独自のアッセイメニュー*を簡単に開発できます。

デジタルPCRでマルチプレックス化をする理由
デジタルPCRでマルチプレックス化をする理由
多数のターゲットを同時に解析することで、時間と試薬を節約し、エラーを減らせるからです。しかも、想像するほど難しくもありません。
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お探しのdPCRアッセイが見つかりませんか?
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心配ありません。GeneGlobeの事前設計済みのアッセイを利用すれば、微生物と突然変異の検出、遺伝子発現解析で、何千種類ものターゲットを見つけられます。あるいは、ユーザー独自のアッセイを設計することも可能です。
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専門家によるカスタムアッセイ設計
専門家によるカスタムアッセイ設計
大変な作業はすべて当社にお任せください。突然変異検出、CNV解析、遺伝子発現、および種の検出のために専門家が設計したシングルプレックスまたはマルチプレックスのdPCRおよびPCRカスタムアッセイを手に入れましょう。
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QIAgilityでフロントエンドを自動化
QIAgilityでフロントエンドを自動化
dPCR分析のためのQIAcuity Nanoplatesのセットアップ時に起こり得るピペッティングミスをなくすため、QIAgility液体分注装置を使用したナノプレートセットアップのフロントエンド自動化の方法を開発しました。
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QIAcuityデジタルPCRシステムの選び方

各装置は、ナノプレート、キット、アッセイとともに、柔軟なスループットとマルチプレックス化を備えた、高いパフォーマンスとデータ品質を提供します。適切な質問をして、ニーズを評価してください。

  • どのアプリケーションを最も頻繁に実行しますか?
  • どの計測オプションが研究規模に最も適していますか?
  • 初期投資以外の製品ケア費用はいくらですか?

決定を下す際の包括的な製品ケアに関する詳細なガイダンスについては、QIAcuity サービスパンフレットをダウンロードしてください。

出版物

QIAcuit ydPCR製品を特集する記事のリストをご覧ください。

科学文献
dPCR実験の設定方法に関するガイドラインはありますか?

デジタルPCR 実験の設定方法に関する詳細なガイドラインとステップごとのチュートリアルについては、 QIAcuity アプリケーションガイド をご参照ください。また、デジタルPCR実験の結果を設定および報告する際の 追加の考慮事項については、 デジタルMIQEガイドライン とその 更新 (Huggett JF et al、2013、2020)をご参照ください。

プレートの誤った取り扱いは結果に影響をもたらしますか?
QIAcuityは、ホイルで覆われたプレートの底部から放出された蛍光を読み取ります。最良の結果を得るには、ホイルを清潔に保ち、引っかき傷などの損傷を避ける必要があります。また、プレート側面のバーコードを清潔で無傷に保ちます。プレートを扱うときは必ず手袋を着用し、プレートに力を加えないでください。プレートを安全に取り扱うために、プレートをナノプレートトレイに入れてください。
dPCRデータをどのように分析しますか?
dPCRシステムソフトウェアでは第1レベル分析と第2レベル分析が提供されます。第1レベル分析には、濃度ダイアグラム、対象ウェルにおけるパーティションの図、もしくはターゲットチャンネルとリファレンスチャンネルを比較するヒートマップが含まれます。ヒストグラムや散布図を使って、閾値の設定を変更できます。第2レベル分析では、アプリケーションの目的(変異検出、遺伝子発現分析など)に応じて、PCRデータを分析できます。
dPCR実験のサンプル投入量について特別な考慮事項はありますか?

大量のgDNAでは、 EvaGreenのバックグラウンド蛍光が増加します。 通常、 ほとんどの分析では 100 ngで十分です。

研究対象の生物の一倍体ゲノムサイズがわかっている場合、gDNAの入力質量と 生じるコピー数(シングルコピー遺伝子の場合)との相関関係は、次の式を使用して簡単に計算できます: 

 

ゲノムのサイズ(bp)x 単一塩基対の平均重量(1.096 x 10–21 g/bp)

 

 dPCRでは、コピー/パーティションの平均数は5を超えてはならず、理想的には0.5–3の範囲です。実験開始前に、インプットコピー数 を決定できないと仮定します。その場合は、未知のテンプレートを2–4倍希釈して使用して 初期タイトレーション実験を行い、その後の分析に最適な範囲を決定することをお勧めします。より詳細なサンプル調製ガイダンスについては、弊社の QIAcuity アプリケーションガイド をご参照ください。

デジタルPCRのプライマーはどのように設計するのですか?
デジタルPCRのプライマー設計は、qPCRのプライマー設計と似ています。ターゲットマッチング、塩基組成、アンプリコン長、融解温度、二次構造、自己および相互相補性(セルフアニーリング)、交差反応性に注意を払う必要があります。一つ異なるのは、バックグラウンドノイズから特定のシグナルをより適切に分離できるように、dPCR用のプライマーはqPCRよりも高濃度で使用することが多いことです。
dPCR実験ではいつ制限酵素消化を実行する必要がありますか?
QIAcuity dPCRアプリケーションの大部分では、テンプレートDNAがQIAcuityナノプレートリアクションチャンバー全体に均一に分布します。PCR産物や高度に断片化したDNA(FFPE DNA、循環セルフリーDNA)、相補的DNA(cDNA)、gBlocksなどをテンプレートとして使用するQIAcuity反応では、PCRシグナルの均一な分布が観察されます。しかし、20 kbを超えるDNA分子やプラスミドは不均一に分割されるため、テンプレート濃度の過剰定量につながります。QIAcuity反応ミックスに制限酵素を直接加えることにより、大きなテンプレートを小さなサイズに断片化でき、その結果、テンプレートの分布が均一になり、正確な定量が可能になります。これは、遺伝子の複数のコピーがタンデムに結合している可能性があるコピー数多型(CNV)分析において特に重要です。反応ミックスに制限酵素を追加する場合、酵素がアンプリコンシーケンス内で切断しないことをユーザーは確認する必要があります。マスターミックスに制限酵素を含め、テンプレート添加後、室温で10分間インキュベートすることをお勧めします。
どの色素を使用できますか?
 QIAcuity dPCR 装置は、 FAM、 EvaGreen、VIC、HEX、 TAMRA、 ROX 、 Cy5 などの色素を検出できます。
dPCRの前にDNAを調製する方法は?
反応混合物に使用するすべてのDNAサンプルは、同様の質と量でなければなりません。これは、UV分光光度法を使用して簡単に評価できます。平均長が20 kb以上のDNAサンプル(シリカメンブレンを備えたスピンカラムで精製したゲノムDNAなど)は、分割前に制限消化によって断片化する必要があります。より大きなDNAの酵素的断片化によって、QIAcuity Nanoplate全体にテンプレートが均一に分布し、正確で高精度の定量が可能になります。

*FDAの「医療機器、実験室で開発された検査」に関する最終規則(2024年5月6日)および「施設内アッセイ」に関するEUの規制要件(規制(EU) 2017/746 -IVDR- Art. 5(5))

QIAcuityは、分子生物学アプリケーション向けに設計されています。本製品を疾病の診断、予防、治療に使用することはできません。そのため、本製品の臨床用途(診断、予後、治療、または血液バンク)での性能特性は不明です。

QIAcuityDx dPCRシステムは、自動マルチプレックス定量dPCRテクノロジーを用いた体外診断に使用し、病理学的状態に関する診断情報を提供することを目的とします。

QIAcuityおよびQIAcuityDx dPCR装置はBio-Rad Laboratories, Incから許諾を得て販売しています。ただし、小児科用途での使用権は含まれておりません。