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Cat. No. / ID: 334375
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QIAseq FastSelect RNA Removal Kits は、全トランスクリプトーム解析や血液サンプルからの遺伝子発現解析における不要なRNAを除去する画期的な技術です。RNAに含まれるrRNAおよびグロビンmRNAを確実に除去し、効率的なRNA-seqを実現します。QIAseq FastSelect –rRNA HMR は細胞質およびミトコンドリアのrRNA除去し、QIAseq FastSelect –rRNA/Globin は、血液サンプルからのrRNAおよびグロビンmRNAを除去できます。また、血液由来のmRNAからグロビンmRNAを除去する場合、QIAseq FastSelect –Globin をご使用ください。
新鮮なサンプルから分解の進んだFFPEサンプルまで対応可能なストランド特異的RNAライブラリーの調製キットはこちら、QIAseq Stranded RNA Library Kits
QIAseq FastSelect RNA Removal Kitのカスタムデザインをご希望の場合は、こちら
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は、rRNA を高効率に除去可能です。従来法と比較して、優れた性能を発揮することが実証されています。また、旧バージョンと比較し、除去効率も更にアップしました。
参照データ:
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は 14 分かつ 1 ステップで rRNA を除去
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は細胞質およびミトコンドリアの rRNA ターゲットを除去可能
QIAseq FastSelect –Globin Kit は成人、胎児、胚のグロビン mRNA を網羅的に除去
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は rRNA 除去効率が旧バージョンのキットより大幅に向上
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit の遺伝子発現結果は旧バージョンのキットと高い相関性(RPKM>0.3)
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は rRNA 除去後も発現遺伝子のプロファイルを維持(RPKM>0.3)
QIAseq FastSelect は、幅広い RNA 量に対応し、FFPE を含む多様な種類のサンプルから抽出した RNA に対して信頼性の高い rRNA 除去が可能で、再現性の高い遺伝子発現結果を示します。
参照データ:
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit はヒト、マウス、ラットなどの多様な哺乳類サンプルからミトコンドリアと細胞質 rRNA を同一キットで除去可能
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は再現性の高いマッピング率を実現
QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit は幅広い RNA 量に対応し高い再現性を実現:RNA 量に関わらず、効率的にかつ再現性高く rRNA とグロビン mRNA を除去
QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit は幅広い RNA 量に対応し高い再現性を実現:RNA 量に関わらず、再現性の高いマッピング率を示す
QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit は幅広い RNA 量に対応し再現性高く遺伝子発現解析が可能
QIAseq FastSelect –rRNA HMR は FFPE および分解 RNA サンプルに対応
QIAseq FastSelect –rRNA HMR は FFPE および分解 RNA サンプルに対応: rRNA の除去によりエクソンマッピング率が向上
QIAseq FastSelect –rRNA HMR は FFPE および分解 RNA サンプルに対応: 遺伝子発現結果
QIAseq FastSelect –rRNA HMR:FFPE RNA サンプルでロバストな性能を発揮
QIAseq FastSelect –rRNA HMR:FFPE RNA サンプルでロバストな性能を発揮:遺伝子発現結果
生物学的には重要ではない高発現の RNA 転写産物を除去すると、NGS のデータの有効活用が可能で、高感度かつハイスループットなシークエンスが可能になります。しかしながら、FFPE サンプルのような分解 RNA サンプルから不要な RNA を除去することは、非常に困難です。
QIAseq FastSelectは、細胞質とミトコンドリアの rRNA やトータル RNA からのグロビン mRNA を、NGS RNA ライブラリー調製中に迅速かつ効率よく除去するように設計されています。QIAseq FastSelect は、お客様がご使用のstranded RNA-seq library kits を含む様々なライブラリー調製ワークフローにシームレスに組み込むことが可能で、わずか 14 分 1 ステップで不要な RNA を除去します。RNA 熱断片化(ライブラリー調製キットとサンプルの状態によって条件は異なります)の前に、QIAseq FastSelect 除去試薬とライブラリー調製バッファーを トータル RNA に混合します。断片化の後、反応温度を段階的に室温まで下げ、残りのライブラリー調製ステップを完了することが可能で、トータル RNAサンプルのいかなる濃縮ステップも不要です。QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は、1 ng から1 µg までの幅広い RNA 量に対して高い性能を発揮します。QIAseq FastSelect は、多様な生物種サンプル由来のインタクトな高品質サンプルからの RNA のみならず、FFPE(ホルマリン固定パラフィン包埋)サンプル等、分解した RNA にも使用でき、ダウンストリームアプリケーションで確実に rRNA を除去し、高い再現性が得られます。
一般的な RNA 除去法や濃縮方法は、ライブラリー調製前に、サンプルの前処理として行います。また、その除去原理としては、不要な RNA をハイブリッドキャプチャーしたり、酵素的に除去したりします。このような原理に基づく除去方法のワークフローには、25 ステップ以上あり、完了に 2 時間程度かかるのが一般的です。一方、当社独自の QIAseq FastSelect は、QIAGEN、Illumina、KAPA、NEB stranded RNA-seq library kits を含む様々なライブラリー調製キットに対応しており、わずか 14 分 1 ステップで rRNA を除去します (図 QIAseq FastSelect Kit のワークフロー)。
作業ステップとしては、RNA サンプルに QIAseq FastSelect 試薬( rRNA Removal や Globin Removal )を添加し必要に応じて熱処理による断片化処理を行った後、14 分間で 75℃ から25 ℃ まで反応温度を段階的に下げるステップのみで、速やかに残りのライブラリー調製ステップを行うことができます。QIAseq FastSelect は RNA 断片化実施の有無にかかわらず使用可能なため、分解された RNA、あるいは高品質 RNA でもライブラリー調製ワークフローに組み込んで使用できます。
QIAseq FastSelect は、高品質な RNA、あるいは FFPE 由来の分解 RNA から不要な RNA を迅速かつ高効率に除去します。QIAseq FastSelect –rRNA HMR および QIAseq FastSelect –Globin Kit は、お客様のアプリケーションにあわせたサイズをご用意しています。