QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit

安定化した血液から細胞内RNA(miRNAを含む)の自動精製

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QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit (96)

Cat. No. / ID:   762635

For 96 preps: 2 Reagent Cartridges, Enzyme Racks, accessories, and RNase-free buffers
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記載のQIAGEN製品は研究用です。疾病の診断、治療または予防の目的には使用することはできません。
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特徴

  • RNAの収量と純度を増大
  • miRNAを効率的に同時精製
  • 画期的な試薬充填済みカートリッジで使いやすく安全なプロセス
  • 標準化された調製法で高い再現性
  • バーコードによりサンプルや試薬の使用履歴トラッキングが可能

製品詳細

QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kitは、QIAsymphony SP上で細胞RNAの完全自動精製を実現します。新しく改善されたキットはmiRNAを含む高品質なRNAを精製します。サンプル採取と安定化用にパクスジーンRNA採血管(日本ベクトン・ディッキンソン株式会社より入手可能、cat. no. 762165)を使用すると、本システムは採血と安定化から実証済みの磁性粒子テクノロジーを用いた高品質RNA精製まで、プレアナリティカルのトータルソリューションを実現します。

パフォーマンス

全自動でのPAXgene Blood RNA 法はマニュアルでのPAXgene Blood RNA 法に相当するRNA収量を実現します。2.5 mlの健常なヒトの全血(4.6 x 106 ~1.1 x 107 白血球/ml)から分離されるRNAの一般的な収量は、すべてのPAXgene Blood RNA Kitsで処理した検体の95%以上で3 µg 以上です。PAXgene Blood RNAの自動調製は様々なドナー検体から豊富なsmall RNA種を含む高品質RNA精製を実現します(図“ 様々なドナーからの高品質RNA”)。収量はドナー依存性が高いため、個人個人での収量は変動します。また、DNase処理が含まれているので、ゲノムDNAの混入は最小限に抑えられます。精製したRNA はリアルタイム定量RT-PCRのようなダウンストリームアプリケーションに直接使用できます。

図参照

原理

QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kitは、QIAsymphony SP上で細胞RNA精製の完全自動化を実現します。サンプル採取と安定化用にパクスジーンRNA採血管(日本ベクトンキディッキンソン株式会社より入手可能、cat. no. 762165)を使用すると、本システムは採血と安定化から実証済みの磁性粒子テクノロジーを用いた高品質RNA精製まで、プレアナリティカルのトータルソリューションを実現します。画期的な充填済みカートリッジはマニュアルでの作業時間の大幅な削減を実現し、さらにバーコードによる試薬の使用履歴のトラッキングもできます。

操作手順

QIAsymphony PAXgene Blood RNA調製はパクスジーンRNA採血管に血液を採取(2.5 ml)することから開始します。サンプルは室温で保存あるいは輸送できます。精製法は、まず遠心操作によりパクスジーンRNA採血管の内容物をペレット化します。ペレットを再懸濁した後、チューブをQIAsymphony SPに移します。試薬カートリッジおよびプラスチック容器の設置は専用ソフトウェアにより指示、チェックされます。その後、QIAsymphony SPによるRNAの自動精製が開始します。DNase処理が含まれているのでゲノムDNAの混入は最小限に抑えられます(図“ QIAsymphony PAXgene Blood RNA操作”)。適応性が高く標準化された調製法はQIAsymphony SPのオンボード対策との組み合わせでサンプル間のクロスコンタミが最小限に抑えられるようにデザインされています(図“ クロスコンタミに対するオンボード対策”)。精製後、溶出液の最終熱処理によりダウンストリームアプリケーションでのパフォーマンスが高まります。所要時間は24サンプルで2.5時間、実際のマニュアルでの作業時間は最大25~30分です。
図参照

アプリケーション

QIAsymphony PAXgene Blood RNA KitとQIAsymphony SPを用いて精製したRNAは高純度で、次のような様々な高感度ダウンストリームアプリケーションに直ちに使用できます:

  • RT-PCRおよびリアルタイム定量RT-PCR
  • 発現アレイおよび発現チップ解析
  • cDNA合成
  • RNase および S1 nuclease protection
  • ノーザン、ドット、スロットブロット解析

裏付けデータと数値

Specifications

FeaturesSpecifications
ApplicationsJAQuantitative, real-time RT-PCR, expression array and chip analysis, next-generation sequencing, cDNA synthesis, RNase and S1 nuclease protection, northern, dot, and slot blot analysis, primer extension
Time per run72 samples in 6 h 15 min
ProcessingAutomated on the QIAsymphony
FormatMagnetic beads
Sample amount2.5 ml
Yield8–16 µg
Main sample typeWhole blood
Elution volume80 µl or 120 µl or 200 µl
TechnologyMagnetic particles technology

リソース

パンフレット (2)
For collection, transport, and storage of whole blood and stabilization and purification of intracellular RNA

 

For collection of stable blood samples and purification of high-quality RNA for demanding downstream applications

 

MSDS (1)
Download Safety Data Sheets for QIAGEN product components.
Labware Files and Documents (1)
For use with the QIAsymphony SP/AS instruments (software version 4.0)
実験器具関連資料 (1)
For use with software version 4.0
キットハンドブック (1)
アプリケーション/プロトコール (1)
For purification of total RNA, including miRNA, from human whole blood stabilized in PAXgene Blood RNA Tubes using the QIAsymphony SP and QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit.

 

Application Notes (1)
Typical total RNA yields from PAXgene Blood RNA Tubes processed with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit
サイエンティフィック・ポスター (1)
Certificates of Analysis (1)

FAQ

How should the samples be stored before purification of RNA with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Protocol?

Room temperature storage of the filled PAXgene Blood RNA Tubes for up to three days has no effect on the RNA profile. For longer storage they should be stored at –20°C or –70°C.

FAQ ID -2984
What are the expected yields of RNA from PAXgene Blood RNA Tubes using the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit?
RNA yields isolated from 2.5 ml healthy, human, whole blood (4.8 x 106 –1.1 x 107 leukocytes/ml) are specified to ≥3 µg for >95% of the samples processed (see Technical Note for the QIAsymphony PAXgene Blood RNA System ). Since yields are highly donor-dependent, individual yields may vary. Mean yields in the range of 8-10µg per tube or higher. 
FAQ ID - 3475
Do you have stability data for RNA isolated with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit?
Stability data are not yet available. A study is ongoing.
FAQ ID -2983
Why is the final heat denaturation step so important with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA protocol?
Denaturation of the eluate is essential for maximum efficiency in downstream applications, such as RT-PCR, other amplification reactions, or cDNA synthesis. It is not necessary to denature samples more than once; samples remain denatured after freezing and thawing.
FAQ ID -2987
What elution formats can be used for the QIAsymphony PAXgene Blood RNA protocol?
We recommend using Elution Microtubes CL, racked (provided) for elution. Alternatively, 2 ml Sarstedt tubes can be used. Other elution formats will be supported in the future, so please refer to the current labware list.
FAQ ID -2986
Is it possible to isolate genomic DNA or viral nucleic acids with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA protocol?
The product is not for the isolation of genomic DNA or viral nucleic acids from human whole blood.
FAQ ID - 3476
What is the maximum number of batches for the QIAsymphony PAXgene Blood RNA protocol for a single run?
Due to limited plastic consumables on board the instrument, the number of batches for the QIAsymphony PAXgene Blood RNA protocol is limited to three at one time. Therefore up to 72 samples can be processed in a single run. 
FAQ ID -2498
Do the samples require pretreatment before loading onto the instrument with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Protocol?
 Yes, samples with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Protocol have to be incubated at least 2 hours at room temperature (18– 22°C). Incubation of the PAXgene Blood RNA Tube overnight may increase yields slightly in some cases. Room temperature storage for up to 3 days may have no effect on the RNA profile. During the preparation of the RNA the manual pretreatment consists of a centrifugation and a pellet resuspension step (see the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit Handbook).
FAQ ID -2982
Can the QIAsymphony PAXgene Blood RNA System be used for diagnostic or prognostic procedures?
No. The QIAsymphony PAXgene Blood RNA System is ’For Research Use Only’. Not for use in diagnostic procedures. No claim or representation is intended to provide information for the diagnosis, prevention, or treatment of a disease. The performance characteristics of this product have not been fully established.
FAQ ID -2496
Which sample types can be processed using the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Protocol?
The QIAsymphony PAXgene Blood RNA Protocol uses 2.5 ml whole human blood collected in PAXgene Blood RNA Tubes.
FAQ ID -2981
How many samples can be processed with the QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit?
The QIAsymphony PAXgene Blood RNA Kit can be used for 96 RNA isolations.
FAQ ID -2497