QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kits

1 ステップで簡便かつ迅速に、ヒト、マウス、ラット、
その他哺乳類のrRNA および / またはグロビンmRNA 除去

S_1084_5_GEN_V2

✓ オンライン注文による24時間年中無休の自動処理システム

✓ 知識豊富で専門的な製品&テクニカルサポート

✓ 迅速で信頼性の高い(再)注文

QIAseq FastSelect -Globin Kit (8)

Cat. No. / ID:   334375

Trial size kit includes QIAseq FastSelect reagent for globin mRNA removal; sufficient for 8 reactions from human, mouse and rat samples
For
Globin mRNA removal
rRNA removal
rRNA/Globin mRNA removal
Samples
8
24
96
384
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kitsは分子生物学的アプリケーション用であり、疾病の診断、予防、あるいは治療に使用することはできません。

✓ オンライン注文による24時間年中無休の自動処理システム

✓ 知識豊富で専門的な製品&テクニカルサポート

✓ 迅速で信頼性の高い(再)注文

特徴

  • QIAGEN、Illumina、NEB、KAPA RNA stranded library kit を含む様々なライブラリー試薬に対応
  • 1 つの試薬でヒト、マウス、ラットおよびその他哺乳類に対応
  • 1 ステップ、14分でrRNAおよび / またはグロビンmRNAを高効率に除去
  • わずか1 回のピペッティング-QIAseq FastSelect試薬とRNAを混合し、インキュベートするのみ
  • 追加のビーズ洗浄やライブラリー調製プロトコールの最適化は不要

製品詳細

QIAseq FastSelect RNA Removal Kits は、全トランスクリプトーム解析や血液サンプルからの遺伝子発現解析における不要なRNAを除去する画期的な技術です。RNAに含まれるrRNAおよびグロビンmRNAを確実に除去し、効率的なRNA-seqを実現します。QIAseq FastSelect –rRNA HMR は細胞質およびミトコンドリアのrRNA除去し、QIAseq FastSelect –rRNA/Globin は、血液サンプルからのrRNAおよびグロビンmRNAを除去できます。また、血液由来のmRNAからグロビンmRNAを除去する場合、QIAseq FastSelect –Globin をご使用ください。

新鮮なサンプルから分解の進んだFFPEサンプルまで対応可能なストランド特異的RNAライブラリーの調製キットはこちら、QIAseq Stranded RNA Library Kits 

QIAseq FastSelect RNA Removal Kitのカスタムデザインをご希望の場合は、こちら

パフォーマンス

QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は、rRNA を高効率に除去可能です。従来法と比較して、優れた性能を発揮することが実証されています。また、旧バージョンと比較し、除去効率も更にアップしました。
参照データ:
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は 14 分かつ 1 ステップで rRNA を除去
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は細胞質およびミトコンドリアの rRNA ターゲットを除去可能
 QIAseq FastSelect –Globin Kit は成人、胎児、胚のグロビン mRNA を網羅的に除去
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は rRNA 除去効率が旧バージョンのキットより大幅に向上
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit の遺伝子発現結果は旧バージョンのキットと高い相関性(RPKM>0.3)
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は rRNA 除去後も発現遺伝子のプロファイルを維持(RPKM>0.3)

幅広い RNA 量から多様なサンプルに対応可能で、ロバストな性能を発揮

QIAseq FastSelect は、幅広い RNA 量に対応し、FFPE を含む多様な種類のサンプルから抽出した RNA に対して信頼性の高い rRNA 除去が可能で、再現性の高い遺伝子発現結果を示します。
参照データ:
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit はヒト、マウス、ラットなどの多様な哺乳類サンプルからミトコンドリアと細胞質 rRNA を同一キットで除去可能
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は再現性の高いマッピング率を実現
 QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit は幅広い RNA 量に対応し高い再現性を実現:RNA 量に関わらず、効率的にかつ再現性高く rRNA とグロビン mRNA を除去
 QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit は幅広い RNA 量に対応し高い再現性を実現:RNA 量に関わらず、再現性の高いマッピング率を示す
 QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit は幅広い RNA 量に対応し再現性高く遺伝子発現解析が可能
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR は FFPE および分解 RNA サンプルに対応
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR は FFPE および分解 RNA サンプルに対応: rRNA の除去によりエクソンマッピング率が向上
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR は FFPE および分解 RNA サンプルに対応: 遺伝子発現結果
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR:FFPE RNA サンプルでロバストな性能を発揮
 QIAseq FastSelect –rRNA HMR:FFPE RNA サンプルでロバストな性能を発揮:遺伝子発現結果

図参照
QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit removes rRNA with 1 step in 14 minutesQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit removes rRNA with 1 step in 14 minutesQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit has comprehensive coverage to remove cytoplasmic and mitochondrial rRNA targetsQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit has comprehensive coverage to remove cytoplasmic and mitochondrial rRNA targetsQIAseq FastSelect –Globin Kit has comprehensive coverage to remove adult, fetal and embryonic globin mRNAQIAseq FastSelect –Globin Kit has comprehensive coverage to remove adult, fetal and embryonic globin mRNAQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit provides greater rRNA removal than previous kit versionsQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit provides greater rRNA removal than previous kit versionsQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit shows comparable gene expression results with previous kit versionsQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit shows comparable gene expression results with previous kit versionsQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit maintains the expression profile: detection of expressed genes (RPKM >0.3)QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit maintains the expression profile: detection of expressed genes (RPKM >0.3)QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit is a single solution that removes mitochondrial and cytoplasmic rRNA from human, mouse, rat and other mammalian samplesQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit is a single solution that removes mitochondrial and cytoplasmic rRNA from human, mouse, rat and other mammalian samplesQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit provides consistent distribution of read mapping between replicatesQIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit provides consistent distribution of read mapping between replicatesQIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit shows consistent results over a broad range of RNA input: highly efficient and reproducible removal of rRNA and globin mRNA, regardless of RNA inputQIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit shows consistent results over a broad range of RNA input: highly efficient and reproducible removal of rRNA and globin mRNA, regardless of RNA inputQIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit shows consistent results over a broad range of RNA input: highly consistent breakdown of mapped reads, regardless of RNA inputQIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit shows consistent results over a broad range of RNA input: highly consistent breakdown of mapped reads, regardless of RNA inputQIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit shows consistent results over a broad range of RNA input: gene expression resultsQIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit shows consistent results over a broad range of RNA input: gene expression resultsQIAseq FastSelect –rRNA HMR works with FFPE and degraded RNA samplesQIAseq FastSelect –rRNA HMR works with FFPE and degraded RNA samplesQIAseq FastSelect –rRNA HMR works with FFPE and degraded RNA samples: removal of rRNA leads to increased exon mappingQIAseq FastSelect –rRNA HMR works with FFPE and degraded RNA samples: removal of rRNA leads to increased exon mappingQIAseq FastSelect –rRNA HMR works with FFPE and degraded RNA samples: gene expression resultsQIAseq FastSelect –rRNA HMR works with FFPE and degraded RNA samples: gene expression resultsQIAseq FastSelect –rRNA HMR: robust performance with FFPE RNA samplesQIAseq FastSelect –rRNA HMR: robust performance with FFPE RNA samplesQIAseq FastSelect –rRNA HMR: robust performance with FFPE RNA samples: gene expression resultsQIAseq FastSelect –rRNA HMR: robust performance with FFPE RNA samples: gene expression results

原理

生物学的には重要ではない高発現の RNA 転写産物を除去すると、NGS のデータの有効活用が可能で、高感度かつハイスループットなシークエンスが可能になります。しかしながら、FFPE サンプルのような分解 RNA サンプルから不要な RNA を除去することは、非常に困難です。

QIAseq FastSelectは、細胞質とミトコンドリアの rRNA やトータル RNA からのグロビン mRNA を、NGS RNA ライブラリー調製中に迅速かつ効率よく除去するように設計されています。QIAseq FastSelect は、お客様がご使用のstranded RNA-seq library kits を含む様々なライブラリー調製ワークフローにシームレスに組み込むことが可能で、わずか 14 分 1 ステップで不要な RNA を除去します。RNA 熱断片化(ライブラリー調製キットとサンプルの状態によって条件は異なります)の前に、QIAseq FastSelect 除去試薬とライブラリー調製バッファーを トータル RNA に混合します。断片化の後、反応温度を段階的に室温まで下げ、残りのライブラリー調製ステップを完了することが可能で、トータル RNAサンプルのいかなる濃縮ステップも不要です。QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kit は、1 ng から1 µg までの幅広い RNA 量に対して高い性能を発揮します。QIAseq FastSelect は、多様な生物種サンプル由来のインタクトな高品質サンプルからの RNA のみならず、FFPE(ホルマリン固定パラフィン包埋)サンプル等、分解した RNA にも使用でき、ダウンストリームアプリケーションで確実に rRNA を除去し、高い再現性が得られます。

操作手順

一般的な RNA 除去法や濃縮方法は、ライブラリー調製前に、サンプルの前処理として行います。また、その除去原理としては、不要な RNA をハイブリッドキャプチャーしたり、酵素的に除去したりします。このような原理に基づく除去方法のワークフローには、25 ステップ以上あり、完了に 2 時間程度かかるのが一般的です。一方、当社独自の QIAseq FastSelect は、QIAGEN、Illumina、KAPA、NEB stranded RNA-seq library kits を含む様々なライブラリー調製キットに対応しており、わずか 14 分 1 ステップで rRNA を除去します (図  QIAseq FastSelect Kit のワークフロー)。

作業ステップとしては、RNA サンプルに QIAseq FastSelect 試薬( rRNA Removal や Globin Removal )を添加し必要に応じて熱処理による断片化処理を行った後、14 分間で 75℃ から25 ℃ まで反応温度を段階的に下げるステップのみで、速やかに残りのライブラリー調製ステップを行うことができます。QIAseq FastSelect は RNA 断片化実施の有無にかかわらず使用可能なため、分解された RNA、あるいは高品質 RNA でもライブラリー調製ワークフローに組み込んで使用できます。

図参照
QIAseq FastSelect Kit のワークフローQIAseq FastSelect Kit のワークフロー

アプリケーション

QIAseq FastSelect は、高品質な RNA、あるいは FFPE 由来の分解 RNA から不要な RNA を迅速かつ高効率に除去します。QIAseq FastSelect –rRNA HMR および QIAseq FastSelect –Globin Kit は、お客様のアプリケーションにあわせたサイズをご用意しています。

裏付けデータと数値

リソース

パンフレット (2)
Presentation describing the underestimated role of rRNA removal from FFPE and liquid biopsy samples
キットハンドブック (2)
Certificates of Analysis (1)