Verogen ForenSeq mtDNA Control Region Kit

• 最小量DNAインプットから最適な感度
• 最新のデータベースから小さなアンプリコンを使用した変異体検出の向上
• 重度に分解したサンプルに対する優れた解像度
• マルチプレックス能力により、操作効率をさらに向上

ForenSeq mtDNA Control Region Kitは、最小量DNAインプットおよび最適な感度で、ミトコンドリアゲノム（mtGenome）の制御域を調べるために、便利で効率的なライブラリー調製を実現します。実証済みのForenSeqケミストリーを活用することで、このキットは、CODISへの直接的アップロードのために全制御域からのコンサイスなデータセットを作り出します。マルチプレックス能力は、費用や時間をさらに負担することなく操作効率を向上させます。

ForenSeq mtDNA Control Region Kitは、業界トップのシークエンシングで強力なアッセイをつなぎ、最適な研究室効率のために使いやすいソフトウェアでシームレスに統合します。ForenSeq mtDNA Control Regionワークフローには、すべてのスループットの要件に対して完全に融通性およびスケーラビリティがあり、平日2日をかけずに、最大48個のサンプルの完全なmtDNA制御域の結果を迅速に出すことができます。ロースループット要件では、キットの48反応物は、12カ月にわたり保存が可能で、需要の高い研究室では、同様のライブラリー調製ルーチンが自動化を容易にします。

• 変異体検出最大化のための短い平均アンプリコンサイズ
• 阻害物質耐性のための最適化
• 柔軟でスケーラブルなスループット
• 最適なラボラトリー効率のための一体化ワークフロー

mtDNAの制御域の濃縮された高密度の突然変異およびmtDNA分析が使用される大部分の法医学サンプルの分解された性質が最適なプライマー設計を困難にします。ForenSeq mtDNA Control Regionキットは、極少量のインプット量に対してさえ、完全で実用的なカバレッジを生み出すために最適化されています（図 “ForenSeq mtDNA Control Regionシステムは、広範なDNAインプット量にわたって幅広いカバレッジを実現します”を参照）。

かなり分解した材料での性能を向上させるために、ForenSeq mtDNA Control Regionキットは、最近精選されたmtDNA変異体および頻度データから設計された120個を超えるプライマーを使用しており、mtDNA制御域において18個のプライマリーアンプリコンを作り出します。すべてのプライマリーアンプリコンは、150 bp未満の長さで、その多くが100 bp未満–現在市販されているmtDNAアッセイ系では最小の平均アンプリコンサイズです。すべてのアンプリコンは、ランした後のバイオインフォマティックスのトリミングの後に配列にギャップが生じることを避けるため、3 bpの最小の重複を設けています。バッファーシステムは、阻害物質に対して最適化され、頑健な増幅環境を作り出します（図 “改良したForenSeqバッファーシステムは、性能を最大化する“を参照）。

PCRベースのアッセイは、変異体検出の向上のために最新のミトコンドリア（mtDNA）データベースからの小さなアンプリコンを敷いています。タイル張りのアプローチは、特に分解したサンプル内でデータ喪失につながるおそれのある配列のギャップを防ぐためにアンプリコンを重ねています。このタイル張りプライマー設計を補足して、向上したバッファーシステムは、カルシウム、フミン酸、その他の関連PCR阻害物質に対して非常に優れた耐性を示します。

この使いやすい、自動化適合ソリューションは、多数のアプリケーションにわたるさまざまな研究設計のために共通のワークフローを提供します。プロトコールには、高品質のゲノムDNA（gDNA）から少量で複雑なサンプルまで、広範なインプット材料に対してライブラリー調製を適合させるため、2つの正規化の方法が含まれます。その一方で、インプット量の要件が低いので、ほとんどの困難なサンプルに対する可能性を拡大します。試薬キットの効率的使用と正確なリードの割り当てのために、ライブラリー調製キットと同梱のインデックスアダプターは、1つのランで最大48個のサンプルまでプールし、シークエンシングすることができます。

ミトコンドリアDNAは、核DNAが損なわれているか存在しない場合、強力な代替情報源となります。mtDNAは、毛根のない髪の毛、歯、骨、その他の難しいソースの場合に使用され、行方不明者や被災者の識別作業のルーチンになりました。以前、従来のSangerシークエンシング方法に伴う品質やスケーリングの問題から、mtDNAにはわずかな専門施設で限られた役割しかありませんでした。Verogen mtDNAワークフローは、性能、効率および使いやすさという固有の組み合わせをもたらし、どのような研究室でも、どのような規模でも、SangerシークエンシングからNGSへmtDNA分析を移行することができ、また他のNGS技術から得られた結果を向上させることもできます。

ForenSeq mtDNA Control Region Kitは、使いやすさとmtDNAデータの迅速なレビューのために、UASのForenSeq mtDNA Analysis Moduleとシームレスに組み合わせます。ソフトウェアは、制御域のシークエンシングのアウトプットを分析し、ランが完了した後1時間足らずで結果を出します。研究室は、要約された結果または詳細な結果をレビューし、明確なインタラクティブユーザーインターフェイス上で最大9個のサンプルまで比較することができます。レポートは、多数のDNAデータベースに適合します。

当社は、ライブラリー調製からシークエンシング、分析まで全ワークフローにわたって優れたサポートを提供します。当社の経験豊富なチームは、お使いの装置、ソフトウェア、バリデーションプラン、および実践のガイダンスのために包括的なサービスを提供し、ワークフローを容易に操作可能にします。