Enzymes, NGS, Two female scientists both Caucasian discussing results one holing a test-tube with blue liquid in a laboratory setting
分子生物学のための酵素

クローニングおよびDNA組換え

クローニング技術とDNA組換え技術は、健康や疾患における遺伝子と細胞の働きについて多くの洞察をもたらしてきました。現在、クローニング技術とアプリケーションは、コンビナトリアルライブラリーのハイスループットアセンブリやエピジェネティック修飾のマッピングなどの革新的なアプリケーションにより、さらに進化しています。

テンプレートDNAを適切なプラスミドベクターにクローニングする前に、末端修飾が必要になる場合があります。クローニング用に同定したDNAは通常、制限酵素消化またはPCR増幅によってソースから分離されます。 Klenow Fragment、T4 DNAポリメラーゼ、T4ポリヌクレオチドキナーゼなどの特殊な酵素は、3’または5’末端を修飾し、DNA断片とベクターの共有結合を改善します。

次のクローニングステップは、ベクターとインサートの末端をアニーリングするのに適した酵素を用いたライゲーションです。

テーリングは通常、TAクローニングに使用するT-ベクターの調製や、TAクローニングに使用するハイフィデリティポリメラーゼ(Taqではない)によって生成したPCR産物をAテーリングするために行われます。Taq DNAポリメラーゼ(Taq)による増幅産物は、すでにA-テーリングされています。

酵素 末端修飾

5’→3’末端フィル 3’→5’末端フィル  クローニングのためのA-テーリング 末端5’リン酸化

P7060L Klenow Fragment
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✔ はい ✔ はい ✘ いいえ ✘ いいえ

P7080LT4 DNA Polymerase*

✔ はい ✔ はい ✘ いいえ ✘ いいえ

P7010 Klenow(3’→5’ exo-)

✘ いいえ ✘ いいえ ✔ はい ✘ いいえ

Y9040LT4 Polynucleotide Kinase

✘ いいえ ✘ いいえ ✘ いいえ ✔ はい

Y9140† End Repair Mix

✔ はい ✔ はい ✘ いいえ ✔ はい
酵素 ライゲーション

粘着姓付着末端のライゲーション 平滑末端のライゲーション ニックシーリング

L6090L E. coli DNAリガーゼ
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✔ はい ✘ いいえ ✔ はい

L6010L T3 DNA Ligase
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✔ Yes A/T > G/C [1.0 M NaCl] ✔ はい ✔ はい

L6030 T4 DNA Ligase
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✔ はい ✔ はい ✔ はい
EN11 T4 DNA Ligase
BLIRT
✔ はい ✔ はい ✔ はい

L6020L T7 DNA Ligase
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✔ はい ✘ いいえ ✔ はい
EN13 Tth DNA Ligase* ✔ はい ✘ いいえ ✔ はい

L6060L Taq DNA Ligase
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✘ いいえ ✘ いいえ ✔ はい

シークエンシングおよびライゲーション非依存性クローニング(SLIC)はエキソヌクレアーゼの酵素活性を利用します:

次世代シークエンシングを目的とするライブラリは、断片化したDNAからスタートします。酵素の作用により、クローニングステップが完了します。

DNAライブラリー調整に必要なすべての酵素成分をアダプターで、「自家製」ライブラリー作成キットにアセンブリできます。

遺伝子合成は、長い相補的オーバーラップ領域を持つオリゴデオキシヌクレオチドの結合に基づいています。

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