SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス

コロナウイルスのメタトランスクリプトミクス研究に重要な宿主と微生物叢の相互作用の解明

宿主と微生物叢の間の複雑な相互作用を読み解くことで、宿主、微生物叢、ウイルス、および関連するパスウェイに関する洞察を解き明かすことができます。’SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス研究で、鼻咽頭組織や肺組織など、ヒトや細菌の混合サンプルを用いる場合、宿主と細菌のrRNAは多量の不必要なリードを生み、目的とする遺伝子の高感度解析を阻害する可能性があります。

SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス解析におけるRNA-seqの感度向上

効果的なrRNA除去は、RNA-seqで有効なリードを得るために重要です。ユニークな遺伝子発現のリードを最大化するには、QIAseq FastSelect –rRNA HMR KitsとQIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kitsを別々に、または組み合わせて使用すると、ウイルスRNAを保持しつつ、宿主と細菌のrRNAをほんの1時間で95％以上除去することが可能になります。さらに、低レベル発現のRNA分子を、より高感度かつ複雑な転写産物情報を保って十分なカバレッジで検出するためには、QIAseq Stranded Total RNA Lib Kitを用いたストランド特異的なライブラリー調製をお勧めします。

SARS-CoV-2メタトランスクリプトミクス研究を促進するために、特異性と効率性を兼ね備えたQIAseqワークフローを是非お試し下さい。