RNA-seqの最適化におけるrRNA除去の重要性

QIAseq FastSelectは、ヒトと細菌の混合サンプルから高品質なRNA-seqを可能にします。

Van Andel Institute（ヴァン・アンデル研究所）のゲノミクスコアディレクターであるDr. Marie Adamsが、QIAseq FastSelect技術が、同じRNAサンプルからヒトと細菌の共発現研究用の高品質RNA-seqデータを生成するという課題を克服するのにどのように役立ったかについて説明します。

QIAseq FastSelectは、がん治療の成功への道を開くのに役立つ

「QIAseq FastSelect は、私のプロジェクトのRNAシークエンシングで驚異的な効果を発揮しました。RNAは分解しており、ほとんど使えませんでしたが、QIAseq FastSelectはこの分解したサンプルのリボソームRNAを実際に除去し、シークエンシングライブラリーを改善しました。」

Brandon Mistrella、ヒューストン大学生物学・生化学部

ヒューストン大学のがん研究者は、FFPEサンプルを扱う際に、RNAの分解に関連する問題に日常的に直面していました。また、RNAサンプルには、リボソームRNAやグロビンmRNAなどの不要なRNA種が存在するため、RNAシークエンシングがさらに複雑になりました。QIAseq FastSelectがどのように研究を変革し、FFPE RNAから有用なRNA-seqデータを取得できるようになったかお読みください。

QIAseq FastSelectにより、低品質のFFPE RNAからRNAシークエンスライブラリーを構築可能

“ワークフローは非常にシンプルで高速です。サンプルの質が悪く、量が限られていたため、得られた結果に期待していません’でした。”

Dr. Fabienne   Desmots-Loyer、 血液学研究者、CHU –  ポンシャイユ病院、レンヌ、フランス

分解レベルが高く、収量が少ないため、FFPEサンプル由来のRNAを用いての作業は困難な場合があります。2ヶ所の民間ラボから処理を断られたがんFFPEサンプルから、QIAseq FastSelectを用いて高品質のライブラリーを調製できたことを、レンヌ病院のDr. Fabienne Desmots-Loyerが説明した記事をご覧ください。

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劇的に迅速かつ簡単にrRNAを除去

他のrRNA除去方法では、数時間かかったり、複数のステップが必要だったり、断片化されていないRNAのみに作用したり、単に十分なrRNAが除去されなかったりしますが、FastSelectメソッドでは、ワークフローが劇的に高速で便利になり、FFPEや断片化したRNAサンプルでも優れた結果が得られます。

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