Verogen ForenSeq DNA Signature Prep Kit

法医学のDNAサンプルからシークエンシングライブラリーを調製するために必要な試薬すべてのために

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ForenSeq DNA Signature Prep Kit(96)

カタログ番号 / ID.   V16000023

法医学DNAサンプルからシークエンシングライブラリーを調製するために必要な試薬すべて、Verogen MiSeq FGx Forensic Genomics Solutionの一部を含みます
反応
96
384
Verogen ForenSeq DNA Signature Prep Kit は、法医学、ヒト個人識別、父子鑑別における分子生物学的アプリケーション向けであり、疾病の診断、予防、治療を目的とはしていません。

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特徴

  • 単一の合理化されたワークフローを使用して、200個の遺伝子マーカーを調べます
  • 法医学的に関連するSNPの高密度なセットの価値あるデータにアクセスします
  • 困難なサンプルおよび重度に分解したサンプルの優れた解析
  • マルチプレックス能力により、操作効率をさらに向上
  • ケースワークのためにNational DNA Index System(NDIS)へのアップロードが承認されています

製品詳細

当社のシンプルなプレートベースのワークフローを使用して、ハンズオン操作時間が2時間足らずで最大96個のDNAサンプルについて、より包括的なDNAプロファイルを作成します。ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ケースワークのためのNational DNA Index System(NDIS)へのアップロードが承認された、最初の次世代シークエンシング(NGS)ベースのショートタンデムリピート(STR)シークエンシングケミストリーです。常染色体STR、X-STRおよびY-STR、身元情報性のあるSNP、表現型情報性のあるSNP、そして生物地理学的先祖情報性のあるSNPを含め、200個を超えるマーカーを単一の合理化されたワークフローに組み合わせることにより、キットは複数のSTR検査実行を不要とします。容易で一体化されたワークフローは、トレーニングプログラム、バリデーションの手順、技能検査、およびその他の、外部認証や認定プログラムに要求される品質保証/品質管理対策を簡易化することにより、研究室の効率を最大限に高めます。ソリューションは、現行のCEアレルコーリングに対して後方互換性があります。

パフォーマンス

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、法医学ゲノミクスアプリケーションでの使用向けに特別に設計された、完全なエンド・ツー・エンドの超並列シーケンスソリューションの一部です。ForenSeq DNA Signature Prep Kitにより、シンプルなプレートベースのワークフローでIlluminaの次世代シークエンシング(NGS)用に最大96個のDNAサンプルまで調製できます。

  • 複数のSTRキットの必要性を取り除きます
  • より広範なSNPが、他の技術では入手できない情報を提供します
  • 100 pg未満の分解したDNAまたは複雑なDNAから識別性の高いデータが得られます
  • シンプルなプレートベースのフォーマットを使用して、最大96個のライブラリーを調製します

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ケースワークおよび犯罪DNAデータベーシング用に世界中で現在使用されているすべての常染色体ショートタンデムリピート(STR)マーカーを、単一の合理化されたワークフロー内に統合し、複数のSTR検査を実行する必要性を取り除きます。常染色体STR、X-STRおよびY-STRに加えて、ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、従来のキャピラリー電気泳動(CE)法では通常入手できないマーカーセットを提供します。これらには、出生源についての有益な情報を与える一塩基多型(iiSNP)、目の色(青色、中間色、茶色)および毛髪の色(茶色、赤色、黒色、ブロンド)を推定する表現型情報性のSNP(piSNP)、生物地理学的先祖について情報性のあるSNP(aiSNP)の高密度のセットが含まれます。これらは、“容疑者がおらず”、そのままではコールドケースになりかねないケースから捜査の手がかりを見いだすのに重要なものとなり得ます。

ForenSeq DNA Signature Prep Kitで網羅される法医学的遺伝子座
特徴 マーカー数 アンプリコンサイズ(bp) DPMA DPMB
包括的な常染色体STR 27 61–467 はい はい
Y-STR 24 119–390 はい はい
X-STR 7 157–462 はい はい
SNPの同定 94 63–261 はい はい
表現型SNP 22 73–227 いいえ はい
生物地理学的アンセストリーSNP 56 67–200 いいえ はい

1つの反応で、プライマーミックスA(DPMA)は、すべての常染色体STR、X染色体STR、およびY染色体STRターゲットおよび完全なセットのiiSNPすべての検査を可能にします。プライマーミックスB(DPMB)には、aiSNPおよびpiSNPが含まれます。

ForenSeq DNA Signature Prep Kitには、次のものが含まれます。

  • DNA プライマーミックスA:58個のSTR(27個の常染色体STR、7個のXハプロタイプマーカーおよび24個のYハプロタイプマーカーを含む)および94個のiiSNPのためのプライマーペアを含みます。
  • DNA プライマーミックスB:DNA プライマーミックスA内のすべてのマーカー、さらに56個の生物地理学的aiSNPおよび22個のpiSNP(2個のaiSNPも表現型推定に使用されます)のためのプライマーペアを含みます。

ForenSeq DNA Signature Prep Kitに含まれる大部分のSNPは、アンプリコンサイズ≤ 125 bpを含み、分解したDNA抽出物の分析またはかなり阻害されているDNA抽出物の分析にさえも極めて適しています(図 “高分子量のgDNAと部分的に分解したgDNAの性能の比較”を参照)。また、ForenSeq DNA Signature Prep Kitでは、混合物内の、従来のSTRおよびCE分析では検出されないおそれのある低濃度のマイナーな構成要素を検出する能力が向上します。この向上した力は、キットに含まれる多数のマーカーによるもので、それらの多くは、高度に多型であり、Illumina MiSeq FGx機器の本来の感度と相まっています。

特徴 詳細
サンプルのタイプ gDNA、口腔スワブ、FTAカード
1サンプル当たりのヒトgDNAの推奨インプット 1 ng
1サンプル当たりのFTAカードパンチ用の推奨インプット 1.2 mm
1ラン当たりのマルチプレックスキャパシティ 8–96サンプル
短いアンプリコンの検出 ≥ 65 bp
遺伝子座のマルチプレックスキャパシティ およそ200個の遺伝子マーカーの同時解析
ライブラリー調製時間合計 7時間15分
ハンズオン操作時間 1時間45分
シークエンシング時間合計 MiSeq FGx Reagent Kitでおよそ28時間、MiSeq FGx Reagent Micro Kitでおよそ22時間

原理

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、ライブラリー調製、DNAシークエンシングプラットフォーム、法医学ゲノミクス向けに特別に設計されたデータ解析ソフトウェアを含む、完全一体型のサンプルから答えへのソリューションの一部です。単一のワークフローでおよそ200個の遺伝子マーカーを使用して、MiSeq FGx Solutionは、STRおよびSNPの最も包括的なマルチプレックスおよび、ヒト個人識別への最もわかりやすい経路を提供します。

操作手順

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、PCR試薬、インデックスアダプター、精製およびノーマライゼーション用ビーズなど、シークエンシング用のDNAライブラリーを調製するために必要なすべての試薬を含みます。1つの増幅で選択したマーカーを同時に調べます。複数の既存のキャピラリー電気泳動(CE)ベースのキットを統合するため、DNAプライマーSet A(DPMA)またはDNAプライマーSet B(DPMB)のいずれかから選択します。

アプリケーション

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、Verogen MiSeq FGx Forensic Genomics Solution、法医学ゲノミクスのアプリケーション向けに特別に設計された完全にバリデーション済みのDNAからデータまでのワークフローの一部です。

ソフトウェア

ForenSeq DNA Signature Prep Kitは、MiSeq FGx Sequencing System上でライブラリーの配列決定をし、Universal Analysis Software(UAS)でデータを分析する一体化型ワークフローの一部です。高性能でエンド・ツー・エンドのソリューションとして設計、開発、製造され、ポートフォリオ全体が充実した技術的サポートによりバックアップされています。さらに、品質管理された製造により、オールインワンライブラリー調製キットの利便性と共に再現性が保証されます。

サービス

当社は、ライブラリー調製からシークエンシング、分析まで全ワークフローにわたって優れたサポートを提供します。当社の経験豊富なチームは、お使いの装置、ソフトウェア、バリデーションプラン、および実践のガイダンスのために包括的なサービスを提供し、ワークフローを容易に操作可能にします。