QIAseq Pan-Cancer Multimodal HT Panel

• わずか一日で、全核酸からシークエンスライブラリー構築を実現するワークフロー
• 分子バーコード（UMI）搭載による偽陽性の排除と高感度な変異検出
• Single-Primer Extension（SPE）技術により困難な配列へのプライマーデザインを1 チューブで実現
• インデックスホッピングを最小限にするUnique Dual Indices（UDIs）を使用
• DNA およびRNA の同時プロファイルを可能とするSample to Insight ソリューション

QIAseq Multimodal Panels は、DNA およびRNA のターゲットエンリッチメント用のライブラリー調製が同一ワークフローで可能です。2つの別々のワークフローが不要なため、ライブラリー調製にかける時間を最小限にすることができ、複数バイオマーカー探索のために、貴重なサンプルを最大限に生かすことができます。

NGS の試薬、装置およびバイオインフォマティクスの進歩により、生体サンプル中の DNA と RNA の変化について効率的に調べることが可能になっています。しかしながら、従来法では抽出後の DNAと RNA を別々のワークフローでライブラリー調製する必要があり、これには次のような課題があります。

• それぞれのワークフローに対して十分な量の DNA と RNA が必要
• DNA と RNA それぞれに対して異なる技術アプローチのため、解析結果の考察が複雑
• 非効率的なサンプルおよび試薬の消費
• 所要時間が長い

現状の課題を克服するために、QIAseq Multimodal Panels は、全核酸（DNA＋RNA）から、Unique Dual Index （UDI）に対応した DNA や RNA イルミナシークエンサー用ライブラリーを一つのワークフローで構築します。さらに、低収率、低品質な生体サンプルでも使用できるよう設計されています。

QIAseq Pan-cancer Multimodal Panel のワークフロー

QIAseq Pan-cancer Multimodal Panel ワークフローにより、わずか一日でシークエンシングに使えるライブラリーを作製できます。ライブラリーのインサート長はおよそ 150 bp なので、FFPE 由来サンプルのような低品質サンプルにも高い互換性のあるワークフローとなっています。

DNA と RNA バイオマーカーのロバストな検出

QIAseq Pan-cancer Multimodal Panel を使用すると、全核酸から一つのワークフローで DNA や RNA のバイオマーカーを正確に検出できます。QIAseq Pan-cancer Multimodal Panel の DNA と RNA のバイオマーカーを同時に検出するワークフローで得られる結果の正確性は、2つの既存製品（QIAseq Targeted DNA PanelsとQIAseq Targeted RNAscan Panels）による別々のワークフローとの比較データによって示されています。

QIAseq Pan-cancer Multimodal Panel を使用すると、一つのワークフローを用いて、全核酸から下記のようにさまざまなバイオマーカーを調べることができます。全核酸は、QIAseq Pan-cancer Multimodal Panel 用に最適化されたプロトコールにより精製可能です。 この技術は、一つのサンプルからさまざまなタイプのバイオマーカーを評価する包括的ゲノムプロファイリング（comprehensive genomic profiling：CGP）に最適です。また、マルチオミックス解析や統合解析のようなバイオマーカー探索は、より深く、より有意義な考察に重要です。本製品のパネルサイズ（DNA領域の場合）は、およそ 1.4Mb です。解析ターゲットは、DNA に対して 523 遺伝子、RNA に対して 56 遺伝子、MSI について 26 マーカーです。

DNA から：

• 一塩基多型（SNV）
• 挿入と欠失（InDel）
• コピー数多型（CNV）

RNAから：

• 融合遺伝子
• エクソンスキッピング
• 遺伝子発現レベル