NGS를 사용하여 차등 발현 분석 및 새로운 발견으로 목표 달성
강력한 miRNA 특이적 분리를 위해 최적화된 반응 화학을 사용하고, QIAseq miRNA Library Kit와 반응 편향을 최소화하고 어댑터 이합체(dimer)를 제거하기 위한 독점 방법을 사용하여 라이브러리를 작성합니다. 고유 분자 색인(Unique molecular index, UMI)는 초기 단계에서 각 miRNA에 태그를 지정하여 PCR 및 염기서열 분석 편향을 제거합니다.
1차 miRNA 매핑 및 UMI 분석뿐만 아니라 2차 차등 발현 분석을 위한 데이터 분석도 제공됩니다.
- 어댑터 이합체(dimer) 및 원치 않는 RNA 종을 제거하여 최고의 충실도(fidelity)와 가장 효율적인 데이터를 생성하는 비드 기반 방법
- 통합된 UMI로 개별 miRNA 분자 정량화 가능
- 독점 파이프라인을 통한 기본 판독 매핑 및 차등 표현식 분석
당사의 고유한 NGS 데이터 분석 파이프라인을 사용하여 통계 분석을 포함한 종합적인 데이터 분석을 제공합니다.
- 원 데이터(raw data)의 포괄적인 품질 관리
- 적절한 참조 유전체에 대한 시퀀스 정렬
- 매핑된 데이터의 품질 관리
- 알려진 전사물의 정량화(ENSEMBL 및 UCSC 데이터베이스 모두 지원됨)
- 표준화(Normalization)
- 검체 그룹 간에 차등적으로 발현되는 알려진 유전자와 신규 유전자 및 전사물을 식별하기 위한 차등 유전자 발현 분석
- 통계 분석(그룹당 충분한 수의 검체가 있는 경우)
- 주성분 분석(PCA(principal component analysis) 플롯) 및 히트 맵을 포함한 무감독(unsupervised) 분석
- 감독(supervised) 분석: 각 특정 그룹 비교를 위해 그룹 간에 차등적으로 발현되는 유전자를 표시하고, 차등적으로 발현되는 유전자를 나열하고, 통계적으로 유의한 신호를 식별하기 위해 화산형 플롯(volcano plot)을 생성합니다
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