dPCR vs qPCR

dPCR과 qPCR 기술을 비교할 때 주요 차이점은 정밀도입니다. 두 기술 모두 높은 민감도의 신뢰성 있는 핵산 검출 및 정량화를 제공하지만, 두 기술 간의 주요 차이점은 아날로그 대 디지털 라디오 비유를 사용하여 가장 잘 설명할 수 있다고 영국 국립 계측 연구소(National Measurement Laboratory)의 수석 과학자인 Jim Huggett 박사는 말합니다. "아날로그 라디오를 사용하는 경우 간섭을 최소화하면서 원하는 방송국을 얻을 수 있도록 먼저 다이얼을 미세 조정해야 합니다. 여전히 품질은 수신에 따라 달라지며 신호는 정전기로 인한 간섭을 받기 쉽습니다. 이것이 qPCR입니다. 신뢰성은 있지만, 좋은 결과를 얻으려면 최적화가 필요하며 그런 경우에도 배경 소음과 싸워야 합니다. 디지털 라디오를 사용하면 방송국을 호출하여 방송국이 있으면 분명한 신호가 있고 그렇지 않으면 신호가 없습니다. 이것이 dPCR과 같으며 정밀한 2진 결과를 제공합니다. dPCR은 말 그대로 DNA 분자의 존재 여부를 계수합니다. 낮은 오류율과 결과 명확성으로 엄청나게 높은 수준의 정밀도를 제공합니다. 디지털 PCR은 더 작은 양적 차이를 측정하는 데 매우 적합합니다."

언제 qPCR를, 언제 dPCR 을 사용해야 할까요?

핵산 정량화를 포함하는 분자 생물학이나 유전체학 연구에 있어 과학자들은 종종 그들 자신이 갈림길에 서 있다는 것을 발견합니다. 연구 목적을 효율적으로 성취하기 위해 어느 정량화 기법을 선택해야 할까요 – 보다 정밀하고 강력한 디지털 PCR(dPCR) 아니면 보다 표준화되어 있고 친숙한 정량적 real-time PCR (qPCR). 두 기술은 유사하지만, 공정에 따라 선택을 결정하는 이점과 제한 사항이 있습니다.

공정 격자는 일부 공통 공정에 대한 각 기술의 적합성 수준을 나타냅니다.

미세방울 디지털 PCR(Droplet Digital PCR, ddPCR)은 초기 디지털 PCR 형태 중 하나로, 이미 위의 응용 분야 대부분에서 qPCR보다 더 많은 이점을 제공할 수 있었습니다. ddPCR vs qPCR에서 qPCR은 넓은 동적 범위가 필요한 응용 분야에 적합한 반면, ddPCR은 더 높은 정밀도 또는 분할 풍부도 분석이 필요한 응용 분야에 적합합니다.

ddPCR에서 나노플레이트 dPCR로 발전하면서 이 기술의 범위가 확장되어 더 많은 응용 분야가 포함되었습니다. 나노플레이트 dPCR 워크플로우는 모든 검체 분획의 동시 판독, 프런트 엔드 자동화, qPCR과 같은 간편한 플레이트 설정 덕분에 훨씬 더 빠릅니다. 이러한 빠른 속도로 인해 스크리닝 및 처리량이 많은 응용 분야에 적합하며 정밀도, 정확도, 민감도가 손상되지 않습니다.