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特点
- 使用单一精简工作流程检测 200 个遗传标记基因
- 通过法医相关 SNP 的稠密集获取有价值的数据
- 对高难度和严重降解的样本进行出色的分析
- 多重能力进一步提高了工作效率
- 获准上传到美国国家 DNA 索引系统（National DNA Index System，NDIS）用于案件工作
产品详情
使用我们基于微孔板的简单工作流程，只需不到两小时的手动操作时间，就能为多达 96 份 DNA 样本生成更全面的 DNA 图谱。ForenSeq DNA Signature Prep Kit 是首款基于下一代测序（Next-Generation Sequencing，NGS）的短串联重复序列（Short Tandem Repeat，STR）测序化学试剂，已获准上传到美国国家 DNA 索引系统（National DNA Index System，NDIS）用于案件工作。该试剂盒将 200 多种标记基因（包括常染色体、X-STR 和 Y-STR、身份信息、表型信息和生物地理祖先信息 SNP）合并到单一的精简工作流程中，因此无需运行多次 STR 检测。简便的集成式工作流程简化了培训计划、验证程序、熟练度测试以及外部认证和认可计划要求的其他质量保证/质量控制措施，从而最大限度地提高了实验室效率。该解决方案向后兼容当前的 CE 等位基因检出。
绩效
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 是专为法医基因组学应用而设计的完整端到端大规模并行测序解决方案的组成部分。ForenSeq DNA Signature Prep Kit 允许实验室利用基于微孔板的简单工作流程为 Illumina 下一代测序（Next-Generation Sequencing，NGS）制备多达 96 份 DNA 样本。
- 无需多个 STR 试剂盒
- 更大范围的 SNP 可提供其他技术无法提供的信息
- 从不到 100 pg 的降解或复杂 DNA 中获取易辨别的数据
- 使用基于微孔板的简单格式同时制备多达 96 个文库
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 将目前世界各地用于案件工作和犯罪 DNA 数据库建立的所有常染色体短串联重复序列（Short Tandem Repeat，STR）标记基因合并到单一的精简工作流程中，无需运行多次 STR 检测。除了常染色体、X-STR 和 Y-STR 外，ForenSeq DNA Signature Prep Kit 还提供传统毛细管电泳（Capillary Electrophoresis，CE）方法通常无法提供的标记基因集。其中包括可提供来源归属信息的身份信息单核苷酸多态性（identity-informative Single Nucleotide Polymorphism，iiSNP）、可提供眼睛颜色（蓝色、中间色、棕色）和头发颜色（棕色、红色、黑色、金色）估计值的表型信息 SNP (piSNP) 以及生物地理祖先信息 SNP (aiSNP) 的稠密集。这些对于从“无嫌疑人”案件中发现调查线索至关重要，否则这些案件可能已成为悬案。
| 特点 | 标记基因数量 | 扩增子大小 (bp) | DPMA | DPMB |
|---|---|---|---|---|
| 全球常染色体 STR | 27 | 61–467 | 是 | 是 |
| Y-STR | 24 | 119–390 | 是 | 是 |
| X-STR | 7 | 157–462 | 是 | 是 |
| 身份 SNP | 94 | 63–261 | 是 | 是 |
| 表型 SNP | 22 | 73–227 | 否 | 是 |
| 生物地理祖先 SNP | 56 | 67–200 | 否 | 是 |
在单次反应中，引物混合液 A (DPMA) 可检测所有常染色体、X 染色体和 Y 染色体 STR 靶标和完整的 iiSNP 集。引物混合液 B (DPMB) 包括 aiSNP 和 piSNP。
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 包括：
- DNA 引物混合液 A：包含 58 种 STR（包括 27 种常染色体 STR、7 种 X 和 24 种 Y 单倍型标记基因）和 94 种 iiSNP 的引物对。
- DNA 引物混合液 B：包含 DNA 引物混合液 A 中的所有标记基因，以及 56 种生物地理 aiSNP 和 22 种 piSNP 的引物对（其中 2 种 aiSNP 也用于表型估计）
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 中包含的大多数 SNP 都含有 ≤ 125 bp 大小的扩增子，因此极其适用于分析降解 DNA 甚至受到高度抑制的 DNA 提取物（见“高分子量 gDNA 和部分降解 gDNA 的性能比较”图）。ForenSeq DNA Signature Prep Kit 还表现出能更有效地检测混合物中的低水平次要成分，使用传统的 STR 和 CE 分析可能无法检测到这些成分。这种能力提升得益于试剂盒中包含的大量标记基因（其中许多具有高多态性）以及 Illumina MiSeq FGx 仪器所固有的灵敏度。
| 特点 | 详细信息 |
| 样本类型 | gDNA、口腔拭子、FTA 卡 |
| 每个样本的人类 gDNA 推荐输入量 | 1 ng |
| 每个样本 FTA 卡打孔的推荐输入量 | 1.2 mm |
| 每次运行的多重处理能力 | 8 至 96 个样本 |
| 短扩增子检测 | ≥ 65 bp |
| 位点多重处理能力 | 同时分析约 200 个遗传标记基因 |
| 文库制备总时间 | 7 小时 15 分钟 |
| 手动操作时间 | 1 小时 45 分钟 |
| 总测序时间 | 使用 MiSeq FGx Reagent Kit 约 28 小时；使用 MiSeq FGx Reagent Micro Kit 约 22 小时 |
原理
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 是全集成样本到答案解决方案的组成部分，后者包括文库制备、DNA 测序平台和专为法医基因组学设计的数据分析软件。MiSeq FGx Solution 在单一工作流程中包含了约 200 个遗传标记基因，提供了最全面的多重 STR 和 SNP，是最简单明了的人类身份鉴定途径。
程序
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 包括制备测序用 DNA 文库所需的所有试剂，包括 PCR 试剂、index接头以及纯化和均一化磁珠。在一次扩增中同时检测您选择的标记基因。可选择 DNA 引物集 A (DPMA) 或 DNA 引物集 B (DPMB)，以合并现有的多个基于毛细管电泳（Capillary Electrophoresis，CE）的试剂盒。
应用
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 是 Verogen MiSeq FGx Forensic Genomics Solution 的组成部分，后者是专为法医基因组学应用而设计并经过全面验证的 DNA 到数据完整工作流程。
软件
ForenSeq DNA Signature Prep Kit 是集成工作流程的组成部分，后者在 MiSeq FGx Sequencing System 上对文库进行测序，然后在 Universal Analysis Software (UAS) 中分析数据。整个产品组合都是作为针对法医样本的高性能端到端解决方案进行设计、开发和制造，并有大范围的技术支持作为后盾。此外，实施质量控制的生产确保了可以方便地使用一体化文库制备试剂盒实现可重现性。
服务
我们为从文库制备到测序再到分析的整个工作流程提供卓越支持。我们经验丰富的团队为您的设备和软件提供全面的服务覆盖、验证计划和实施指导，使您能快速轻松地将工作流程投入运行。