QIAseqTargetedDNA
下一代测序

揭示困难样本中的表观遗传学机制

故事远不止于 DNA 测序

只有基因序列并不能反映基因表达或细胞功能的全景。包括 DNA 甲基化在内的表观遗传学机制可影响基因的活动,而不会改变 DNA 序列。DNA 甲基化是 DNA 上发生的稳定、可遗传的共价修饰,主要发生在 CpG 双核苷酸上,但也可见于非 CpG 位点。甲基化与正常发育过程相关,也与肿瘤发生及其他病理过程中观察到的改变相关,比如肿瘤抑制基因或 DNA 修复基因的基因沉默。对于 FFPE 和液体活检 样本,检测 DNA 甲基化程度可能是困难的,因此更加需要稳健、可靠且支持低样本投入量的解决方案。QIAGEN 适用于表观遗传学应用的 Sample to Insight 解决方案可克服这些困难,交付可靠的结果和深入的数据解析。

next gen sequencing Methylation epigenomics

靶向甲基化测序

工作流最快、样本投入量最低的甲基化分析
  • 可对组织、FFPE 和液体活检样本进行高性能检测,DNA 起始量仅需 1-10 ng
  • 可在单日内实现从 DNA 到数据分析
  • 对非生物信息学研究者适用的整合式分析流程
  • 可根据您的项目灵活定制或全面设计靶向 panels
自动化并加速您的文库制备
NGS 文库制备自动化对您的实验室有什么益处?
您看到的是真正的突变还是假阳性?

每个经亚硫酸氢盐处理的 DNA 分子都在扩增前被标上一个独特的分子条形码(UMI)。在分析期间,将去除 PCR 重复数据和假阳性结果,生成准确的甲基化图谱。

Qiagen diagram QIAact Lung
QIAseq
您的方案可以覆盖所有区域——即便是高 GC 含量区域吗?

与传统的双引物法相比,单端特异性引物延伸技术(SPE)仅使用一条特异性引物和一条通用引物进行扩增。

这意味着:

  • 更低的引物二聚体形成和扩增失败风险
  • 更高的均匀性
  • 更高的文库复杂度
  • 仅需要单管引物池

想要扩展您的靶向 panel 内容吗?对于 SPE,您不需要进行引物重新设计!

从 gDNA 到甲基化分析仅需一管反应和一天时间
  • 节省宝贵的样本:起始量要求低,保卫有限的样本
  • 节省时间:采用单管方案,可在单日内实现从基因组 DNA 到 NGS 文库
  • 可信赖的结果:高度特异和均匀的亚硫酸盐处理可将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶
  • 整合的数据分析流程: 可供每位研究者使用的预制和可定制生物信息学工作流程
探索我们的 QIAseq Targeted MethylCustom Panel.

我们适用于 Illumina 平台的 panels 包括:

  • Human Breast Cancer Panel
  • Human Colorectal Cancer Panel
  • Immuno-Oncology Panel
  • Human T-cell Infiltration Panel
Closeup of eppi tube
所有照片均摄于 COVID-19 疫情爆发前