REPLI-g SensiPhi DNA Polymerase, Buffers, and Reagents for parallel 12 x 60 µl whole genome amplification reactions and 12 x 60 µl whole transcriptome amplification reactions (typical yield: 20 µg from each reaction)
JP¥160,000
Kit
REPLI-g Cell WGA & WTA Kit (12)
REPLI-g Cell WGA & WTA Kit (48)
REPLI-g Cell WGA & WTA Kit 旨在用于分子生物学应用。该产品不能用于疾病诊断、预防和治疗。
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特点
同时扩增基因组DNA和RNA(总RNA或富集mRNA)
基因组状态与转录模式轻松关联
MDA技术实现了无偏差的扩增
直接从细胞或组织中扩增gDNA和RNA
适用于包括NGS在内的所有下游应用
产品详情
REPLI-G Cell WGA & WTA Kit是唯一能够同时均一地扩增全基因组扩增和全转录组的产品,并且使得基因组与来源于非常小量样本(25–1000个细胞)的转录组具有直接相关性。专用的缓冲液和试剂经过独特的、可控的净化步骤处理,避免REPLI-g扩增污染核酸。创新的裂解液可以有效地稳定细胞核酸,从而确保基因组DNA和RNA水平准确表现。基因组DNA和总RNA或mRNA(poly A +)的无偏差扩增采用创新的多重置换扩增(MDA)技术和新颖的REPLI-g SensiPhi DNA聚合酶来实现。不同于基于PCR的扩增技术,MDA具有增加高达1000倍的高保真率,避免了假阳性或阴性结果出现。
新颖的REPLI-g SensiPhi DNA Polymerase可以用于多重置换扩增。它是新开发的高亲和力酶,可以更有效地结合DNA,特别是在DNA浓度在反应混合物中较低时。此外,对比基于PCR的方法,REPLI-g SensiPhi DNA Polymerase具有较强的校对活性,可以将错配率减少1000倍。它还具有很强的链置换活性,通过稳定的发夹结构使DNA得以复制,该结构对以Taq酶为基础的全基因组和全转录本扩增步骤具有抗性。
细胞裂解:在5分钟内将样本(含有25–1000个细胞)有效地裂解,同时保持RNA或DNA的完整性。裂解的细胞被分为相等体积的两等份。第一等份试样用于WGA,而第二等份试样用于总RNA的WTA,或富集mRNA(poly A +)RNA。
全基因组扩增 :细胞裂解之后,一等份试样中的DNA被修饰用于高效的连接反应。由于该连接反应的性质,DNA片段并未按照它们原本存在于生物体中的顺序组装。然而,这并不影响下游应用中的核酸序列检测(例如,基因多态性),例如NGS、芯片分析或者qPCR。连接反应后,使用MDA技术和新颖的、高亲和力REPLI-g SensiPhi DNA Polymerase进行扩增。
REPLI-g Cell WGA & WTA Kit允许从一个非常小量的样本开始对全部转录物和基因组进行均一的平行扩增。利用该试剂进行的gDNA和cDNA平行扩增非常适用于二代测序技术(包括DNA-Seq和RNA-Seq*)、芯片分析、基因分型检测应用、或定量PCR。
REPLI-g Cell WGA & WTA Kit适用于扩增:
转录组(RNA):
带有poly A+尾巴的mRNA
总RNA
RNA转录本的所有片段
mRNA的3’端
Lnc和linc RNAs
基因组(DNA):
基因组DNA
线粒体DNA
不适用于小核酸(例如):
tRNAs和miRNAs
高度降解的DNA或RNA
* 如果要进行二代测序,则应了解超过90%的片段来自于rRNA;因此,转录组测序前必须进行总RNA扩增。如扩增富集mRNA(poly A +)RNA时省略反应中的随机引物,rRNA的扩增反应则不会发生。
辅助数据和图表
REPLI-g amplified cDNA and gDNA perform like gDNA in downstream experiments.
REPLI-g Kits amplify genomic DNA or RNA from a wide variety of sample types, generating amplified DNA and cDNA that performs just like gDNA and is highly suited for numerous downstream experiments.