two scientists in a laboratory working on computer screens
下一代测序

SARS-CoV-2 基因组监测 NGS 解决方案

在与新病毒突变的赛跑中，每小时、每分钟都是宝贵的

COVID-19 大流行的演进均源自新型 SARS-CoV-2 关切变异株 (VOC) 的出现，比如阿尔法、贝塔、伽马、德尔塔、Mu 和奥密克戎。这些新突变可能会逃逸免疫反应，降低疫苗的有效性，这一点仍构成威胁。实验室因此面临尽快对样本进行测序以鉴定在人群中流传的新的和已知的现有 SARS-CoV-2 变异株的压力。为了加速您的 SARS-CoV-2 基因组监测工作，我们开发了两款量身定制的解决方案以用于病毒扩增和 NGS 文库制备。

NGS solutions for Omicron bubble

针对您的需求获得适宜的监测解决方案

您越快完成样本测序，就能越快地了解流行突变株的综合情况，从而做到领先一步。了解我们的基因组监测解决方案可为您做些什么。

增强型、高通量 NGS 解决方案

Product Kitbox
QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit 适用于所有已知的关切变异株，包括奥密克戎

使用速度提升 50% 的高通量 NGS 解决方案加速 SARS-CoV-2 变异株测序。QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit 通过 4 小时的自动化工作流程提供了卓越的病毒基因组覆盖度，塑料器具的使用减少 50%，并支持在单个Flow cell 中进行多达 768 个样本的多重检测。QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit 的更高密度扩增子覆盖确保了针对所有 VOC 的稳健性能，包括检测奥密克戎和德尔塔变异株，无需重新设计或额外添加引物。

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新推出！QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit

QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit 与 QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit 结合使用，可进一步提高基因组覆盖度，同时精简工作流程。

优势源自：

  • 精简的工作流程：文库扩增前无需均一化/定量
  • 提高了基因组覆盖度和均一性：覆盖度 >95%（即使在病毒基因组拷贝数极低的情况下）
  • 较低的读长要求：每份样本需要的测序数据量减少 4 倍，节省了测序成本并允许更多样本的多重检测

购买 QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit 时，可免费获得 QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit。条款和条件适用。†

立即申请免费的增强型试剂盒

 

文章和资源

Davida Dmyth working in lab
使用 NGS 检出废水中的 SARS-CoV-2 变异株

Davida Smyth 博士讨论了全基因组 NGS 如何帮助她从废水样本中检测流行 SARS-CoV-2 变异株，甚至揭示新的突变。

阅读文章
白皮书：从真实世界 COVID 样本中鉴定 VOC

了解卡塔尼亚大学的 Nicolò Musso 及其团队如何使用 QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit 对 250 份具有不同 RNA 质量的 COVID 阳性样本进行分析，并检测当时在当地人群中流行的多种 VOC，包括阿尔法、伽马和德尔塔变异株。

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Coronavirus poster
Corona virus, COVID-19, virus with antibodies
变异株、监测和疫苗效力：COVID-19 疫情的演进
随着奥密克戎变异株的出现，COVID-19 疫情继续发展，了解 NGS（特别是全基因组测序）如何用于测定流行变异株的流行率。我们的文章深入探讨了 SARS-CoV-2 变异株检测、废水检测、疫苗逃逸突变等。
查看相关详情
为什么选择 QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit？

如果您想要实现最大化的效率、提升您的测序能力且确保优异的覆盖度以加速突变检测，请使用我们的超快速、高通量、单试剂盒 NGS 解决方案。现在，您可以利用我们新开发出的辅助试剂盒——QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit，它与 QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit 结合使用时，可进一步精简工作流程，提高覆盖度，同时减少了每份样本需要的测序数据量。

4 小时
可自动化的富集和文库制备工作流程帮您轻松实现从纯化 RNA 到获得序列——无需片打断、转座酶片段化或连接步骤。
~250 bp
扩增子具有优越的均一性，与最广为使用的基于扩增子的方案相比，具有更好的全 SARS-CoV-2 基因组覆盖度和更好的测序性能。
至多 768 个
样本可进行多重检测，以提高测序通量和效率。
50%
塑料用具使用量减低。

经过优化的基于 ARTIC 的 NGS 解决方案

QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel

使用我们的可扩展、单日工作流程进行快速的 SARS-CoV-2 变异株检测和实时基因组监测；该工作流程比杂交捕获解决方案更快，且所需的投入量更低。QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel 基于经过优化的公开的 ARTIC V3 设计，可用于对完整的病毒基因组进行靶向富集，从而使您：

  • 即使在低拷贝数的情况下也可以降低 Dropouts 和引物二聚体的不利影响，实现高度覆盖，
  • 在高通量 Illumina 平台上以单次运行对最多 384 份样本进行多重检测
  • 使用整合的生物信息学分析流程对病毒演化进行追踪和可视化
一个扩展性更好的所向无敌的组合

将 QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel 与 QIAseq FX DNA Library UDI Kit 结合使用可让您在单次运行中对最多 384 份样本进行多重检测。

QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel
QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel
SARS-CoV-2 靶向全基因组文库制备用于基因组监测和突变检测
了解更多
QIAseq FX DNA Library UDI Kit
QIAseq FX DNA Library UDI Kit
全酶法的全基因组文库制备及杂交捕获文库制备方案，偏倚率低，适用于 Illumina 平台
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申请试用装，开始使用

QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel Kit

申请试用装

QIAseq FX DNA Library UDI Kit

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自动化并加速您的文库制备
NGS 文库制备自动化对您的实验室有什么益处？
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特色故事

Genomics, QIAseq NGS Solutions, Dr. Mette Christiansen, Aarhus University hospital, COVID-1
跨物种传播后的 COVID-19 突变测序

截至 2020 年 11 月，在丹麦境内，有 200 多人被认为从水貂染上了 COVID-19。同时，病毒一直在动物界进行着变异，出现了数个变种。奥胡斯大学医院分子医学系 (MOMA) 诊断 NGS 核心设施负责人 Mette Christiansen 博士讨论了对所有阳性案例进行测序如何有助于对正在流行中的突变获得清晰的了解。了解 QIAGEN NGS 技术如何协助这方面的工作。

阅读全文

文献

急性 SARS-CoV-2 阿尔法变异株感染导致胎盘功能不全和胎儿窘迫

在一项关于急性 SARS-CoV-2 阿尔法变异株感染与胎盘功能不全及胎儿窘迫之间联系的研究中，了解使用 QIAseq Direct SARS-CoV-2 Kit 进行 SARS-CoV-2 全基因组测序如何帮助识别 SARS-CoV-2 阿尔法变异株的突变。

参考文献：Dumont, S., Balduyck, J., Reynders, M., Vanwalleghem, L. and Lebbe, B. (2021) Acute SARS-CoV-2 alpha variant infection leading to placental insufficiency and fetal distress.

研究表明，QIAseq 技术是最有效的 SARS-CoV-2 全基因组测序技术之一

一项近期的对不同 SARS-CoV-2 全基因组测序方法进行评估的研究显示，QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel 可将 SARS-CoV-2 基因组的优先扩增提高 100 倍，且可确保高覆盖度。

参考文献：Liu et al.(2020) A benchmarking study of SARS-CoV-2 whole-genome sequencing protocols using COVID-19 patient samples.

使用 QIAseq 技术追踪 SARS-CoV-2 RNA 中的突变

阅读这篇来自印度东部的研究，了解研究者如何在 QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel 的协助下揭露出 SARS-CoV-2 基因组中的突变累积全貌。

参考文献：Maitra, A. et al.(2020) Mutations in SARS-CoV-2 viral RNA identified in Eastern India: Possible implications for the ongoing outbreak in India and impact on viral structure and host susceptibility

COVID-19 患者的 microRNA 表达谱改变可用于识别 SARS-CoV-2 感染

了解 QIAseq miRNA Library Kit 和 QIAseq miRNA NGS 48 Index IL 如何帮助确定 COVID-19 患者的 miRNA 表达谱改变，从而开发出 COVID-19 的可靠 miRNA 生物标志物。

参考文献：Farr, R. et al.(2021) Altered microRNA expression in COVID-19 patients enables identification of SARS-CoV-2 infection
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我们呼吁加大病毒测序力度，以补充正在进行的监测和检测工作
世界卫生组织总干事

查看我们的网络研讨会

超越 SARS-CoV-2 监测：下一代测序如何支持基于废水的流行病学研究？
超越 SARS-CoV-2 监测：下一代测序如何支持基于废水的流行病学研究？
讲者：Davida Smyth，博士，德克萨斯农工大学（德克萨斯州圣安东尼奥）微生物学副教授
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使用新的高通量 NGS 解决方案加速 SARS-CoV-2 基因组监测
使用新的高通量 NGS 解决方案加速 SARS-CoV-2 基因组监测
讲者：Brian Dugan，硕士，QIAGEN 全球产品管理基因组学副主任；Fernando Spilki，博士，巴西新汉堡费维尔大学
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为新的 SARS-CoV-2 毒株 B.1.1.7 和 B.1.351 的高通量基因组监测赋能
为新的 SARS-CoV-2 毒株 B.1.1.7 和 B.1.351 的高通量基因组监测赋能
讲者： Brian Dugan，硕士，QIAGEN 全球产品管理基因组学副主任；Shawn Prince，学士，QIAGEN 生物信息学高级现场应用科学家
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拓展 SARS-CoV-2 宏转录组学数据分析
了解为什么说我们的创新性 NGS 解决方案可提高 SARS-CoV-2 宏转录组学研究中的 RNA-seq 灵敏度。
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深入了解

SARS-CoV-2 Whole Genome Sequencing Services
SARS-CoV-2 Whole Genome Sequencing Services
通过利用我们的综合性 SARS-CoV-2 Whole Genome Sequencing Services 加快 SARS-CoV-2 基因组监测工作。利用来自 QIAGEN 的专识和定制服务扩展您的内部资源。
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轻松分析 SARS-CoV-2 序列数据
轻松分析 SARS-CoV-2 序列数据
使用整合的生物信息学解读您的 SARS-CoV-2 测序数据直观易用的 QIAGEN CLC Genomics Workbench 可让您对多个读长和突变同时进行可视化和比较。新推出的QIAGEN CoV-2 Insights Service提供了一套基于云平台的低成本、高扩展性系统，用于SARS-CoV-2变异位点和谱系的分布式处理、分析和报告。从系统发生学到宏基因组学分析，使用我们的适用于 SARS-CoV-2 基因组监测的集成生物信息学解决方案，加速有效数据的挖掘。
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所有照片均摄于 COVID-19 疫情爆发前
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