therascreen NRAS Pyro Kit
基于测序的方法定量检测NRAS基因中癌症相关的突变
基于测序的方法定量检测NRAS基因中癌症相关的突变
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将载有编码子12和13 GGT->GAT和编码子61 CAA->CGA的突变的质粒和野生型基因的质粒混合测量其线性(参见"Linearity of GGT->GAT mutation")。这些质粒以四种不同的突变质粒比例(5、10、30、50%)混合。每种质粒混合物用三种不同量的therascreen NRAS Pyro Kit使用焦磷酸测序技术进行分析,重复分析三次。
检测5–50%突变范围时,含有5%的容许非线性度的结果是线性的。检测编码子13 GGT->GAT和编码子61 CAA->CGA的突变获得同样的结果。
精密度用于检测这些试验的总的差异,对如上所述的质粒混合物进行三个不同水平的分析,每个混合物重复测量三次以获得精密度数据。
重复性(批内和批间差)基于线性测定数据计算得出(用不同的therascreen NRAS Pyro Kit在同一天测定三次)。中间精密度(实验室内部差异)由同一实验室三次检测得出,这三次检测分别由不同的操作者用不同的PyroMark Q24实时定量焦磷酸序列分析仪以及不同的therascreen NRAS Pyro Kit在不同的三天进行。重现性(实验室之间的差异)由使用不同的therascreen NRAS Pyro Kit在两个不同的实验室分别进行检测得出。
在5–50%的突变测量范围内,编码子12 GGT>GAT的突变检测的重复性、中间精密度和重现性分别为1.2–1.9%、1.0–2.0%、1.3–3.1%。检测编码子13 GGT->GAT和编码子61 CAA->CGA的突变获得同样的结果。
% 突变质粒 | 重复性(SD) | 中间精密度(SD) | 重现性(SD) |
---|---|---|---|
5 | 7.5, 1.2 | 7.3, 1.0 | 6.7, 1.3 |
10 | 14.6, 1.3 | 13.5, 1.1 | 13.7, 1.3 |
30 | 37.8, 1.9 | 37.9, 1.5 | 36.1, 2.9 |
50 | 59.8, 1.7 | 60.4, 2.0 | 57.5, 3.1 |
therascreen NRAS Pyro Kit用于实时定量检测人NRAS基因编码子12、13和61的突变,在PyroMark Q24实时定量焦磷酸序列分析仪上使用焦磷酸测序技术检测。NRAS基因编码一种GTPase,该酶是成神经细胞瘤RAS病毒(v-ras)原癌基因同源物。 在所有恶性黑素瘤中,有将近13–25%发生NRAS基因突变,通常在编码子12、13和61突变。这些突变激活了NRAS信号通路。
可检测以下种类的突变:
使用针对编码子12/13和编码子61的引物对两个片段PCR扩增后,将扩增子固定在高性能链霉素亲和琼脂糖上。将单链DNA和相应序列的引物退火处理得到DNA。然后在PyroMark Q24实时定量焦磷酸序列分析仪上设置程序和运行程序对样品进行分析。运行后可以通过调节"Sequence to Analyze"来检测稀有突变(参见"Pyrogram trace of a GGT to AGT mutation in base 1 of codon 12"和"Pyrogram trace after reanalysis of the sample in the previous figure")。
therascreen NRAS Pyro Kit用于定量检测人NRAS基因编码子12、13和61的突变。该试剂盒用于辅助鉴定癌症,然后采用特异性作用于NRAS基因或NRAS基因起关键作用的信号通路的治疗方法进行治疗。
可检测以下种类的突变: