Eine Komplettlösung zur Erforschung adaptiver Immunreaktionen
Next Generation Sequencing (NGS) kann ein nie dagewesenes, hochauflösendes Abbild des T-Zell-Rezeptor(TCR)-Repertoires liefern. Die Automatisierung von NGS-Workflows zu diesem Zweck kann jedoch eine Herausforderung darstellen, da bei der zum Abzielen auf verschiedene V- oder J-Regionen erforderlichen Multiplex-PCR beträchtliches Bias auftreten kan.
Unsere praktischen Immune Repertoire Profiling Services verwenden eine hocheffiziente, TCR-spezifische cDNA-Synthesereaktion, bei der mit genspezifischen Primern, die auf die konstanten TCR-Regionen abzielen, und einem universellen Primer, der komplementär zum ligierten Adapter ist, die komplette variable TCR-Region angereichert wird. Die Einheitlichkeit der Amplifikation ist der Amplifikation mit multiplexierten V- und J-Primer-Pools überlegen. Amplifikationsbias wird durch die Verwendung von Unique Molecular Indices (UMI) weiter reduziert. Das Ergebnis dieser kombinierten Technologien ist eine genaue und sensitive Beurteilung von TCR-Klonotyp und -Repertoire-Diversität.
Das haben unsere Immune Repertoire Profiling Services zu bieten:
- Lückenloser Service: Wir kümmern uns um jeden Schritt, von der Probenvorbereitung bis zur Datenanalyse
- Beratung und Flexibilität: Wir unterstützen Sie bei der Entwicklung Ihres Projekts und helfen Ihnen, die richtigen Entscheidungen zu treffen
- Optimierte Anreicherung variabler TCR-Regionen: Wir verwenden Unique Molecular Indices, um Amplifikationsbias zu reduzieren und bieten so eine genaue und sensitive Beurteilung von Klonotyp- und Repertoire-Diversität
- Publizierbare Daten: Wir stellen umfassende Berichte und Datenpakete bereit – einschließlich Häufigkeit und Identität für jeden einmaligen Klonotyp, V- und J-Segmentnutzung, CDR3-Längenverteilung und Diversitätsmesszahlen
Unser umfassender Workflow für das Immunrepertoire-Profiling