Geeignete Biomarker sind ein Schlüssel zur Verbesserung von Krebs-Screening, -Diagnose und -Überwachung. Welcher Biomarker wird sich als der beste herausstellen?
Die Entdeckung von RNA-Biomarkern und ihre Weiterentwicklung für den klinischen Einsatz ist eine Herausforderung. Wir müssen diese Herausforderung meistern, denn das wichtigste Ziel ist die Verbesserung der Früherkennung, der Prognose und der Unterstützung für Menschen, die an Krebs erkrankt sind. Gemeinsam können wir Ihnen den Weg zur Entdeckung von Krebs-Biomarkern erleichtern und relevante Ergebnisse erzielen.
Unser Portfolio an „Sample to Insight“-Workflows für die Untersuchung von Krebs-miRNA sowie Krebs-Genexpressions-, -Transkriptom- oder -Funktionalitätsstudien ist umfassend. Hier geben wir Ihnen einen Einblick in die einzelnen Schritte der häufigsten Workflows und erleichtern Ihnen die Suche nach den Informationen und Produkten, die Sie benötigen. Von formalinfixierten, in Paraffin eingebetteten (FFPE) und Flüssigbiopsieproben bis hin zur RNA-Seq und Entdeckung neuer Krebs-Stoffwechselwege bieten wir Ihnen die geeigneten Lösungen zur Steigerung Ihrer Effizienz und Beschleunigung Ihrer RNA-Biomarkerforschung. Wir haben ein gemeinsames Ziel. Arbeiten wir daran, Krebs zu besiegen. Gemeinsam.
Probenvorbereitung
RNA-Stabilisierung und -Isolierung
Wenn Sie RNA aus Flüssigbiopsie- oder FFPE‑Proben isolieren, wissen Sie, dass das Verfahren viele Herausforderungen mit sich bringt. Spezifische Lagerbedingungen, die nötige Vorbehandlung und die Fragilität von RNA erfordern, dass wir genau planen und geeignete Vorbereitungen treffen, um bestmögliche Ergebnisse zu erzielen. Wir haben einige nützliche Ressourcen zusammengestellt, um Ihnen den Einstieg in die Arbeit mit RNA-Biomarkern zu erleichtern oder Sie in die Details einzuführen, die bei der Probenvorbereitung von entscheidender Bedeutung sind.
Handbücher und Poster
Qualitätskontrolle
Handbücher und Poster
Next Generation Sequencing
RNA- und miRNA-Sequenzierung
Next Generation Sequencing (NGS) ist eine leistungsstarke Methode für den Nachweis und die Charakterisierung von RNA-Biomarkern, doch die Einrichtung in Ihrem Labor kann kompliziert und anspruchsvoll sein. Wenn Sie einen hohen Probendurchsatz haben, können wir Ihnen helfen. Wir arbeiten daran, NGS so einfach wie möglich zu machen: Unser Ziel ist es, dass NGS genauso einfach wie eine PCR werden soll. Damit wäre NGS für alle verfügbar und könnte auch kleinere Krebsforschungslabore dabei unterstützen, hervorragenden Ergebnissen einen Schritt näher zu kommen. Wir helfen Ihnen, mit NGS-Lösungen die Entdeckung von RNA-Biomarkern zu beschleunigen – ganz gleich, ob Sie Genexpression oder Fusionsgene analysieren, und unabhängig von der Probenanzahl.
RNA-Seq-Datenanalyse
Jetzt, da Sie im Rahmen Ihres Projekts zur Entdeckung von Biomarkern mittels NGS ein Genexpressionsprofil erfasst haben, stellt sich die Frage, wie Sie im nächsten Schritt am besten die Rohdaten analysieren können. Eine Möglichkeit ist ein Online-Datenanalyse-Tool
Digitale PCR
miRNA-Profiling
MicroRNAs (miRNAs) sind maßgeblich an der Krebsprogression und -unterdrückung beteiligt, da sie tausende krebsassoziierte Gene regulieren. Zirkulierende zellfreie miRNAs haben vor Kurzem neue Möglichkeiten für einen nichtinvasiven Test zur frühzeitigen Krebserkennung eröffnet.
Allerdings mangelt es bei der miRNA-Quantifizierung in Serum oder Plasma noch immer an Konsistenz und Standardisierung. Versuchen Sie es mit digitaler PCR, wenn Sie analytische Schwierigkeiten bei der miRNA-Quantifizierung überwinden möchten. Die digitale PCR (dPCR) ermöglicht eine absolute Quantifizierung ohne Standardkurven und mit höherer Präzision als die qPCR. Dies ist besonders wichtig beim Nachweis von in geringer Menge vorliegenden miRNAs im Vergleich zur qPCR. Durch die genaue Messung der Konzentration zirkulierender miRNAs stellt die dPCR ein wertvolles Tool auf dem Weg zur Entwicklung von Biomarkern für den Nachweis von Krebs dar.
Genexpressionsanalyse
Änderungen der Genexpression sind ein äußerst wertvoller Indikator, der unser Verständnis vieler biologischer Funktionen deutlich erweitert hat. Mit der dPCR können Sie diesen Ansatz auf die nächste Stufe heben und bisherige Grenzen überschreiten. Welche Bedeutung haben zum Beispiel in niedriger Konzentration vorliegende Targets oder sehr geringe Expressionsunterschiede von 2-fach oder weniger? Mit dPCR können Sie es jetzt herausfinden.
Die dPCR‑Methode liefert dank Endpunktmessung und absoluter Quantifizierung präzisere und reproduzierbarere Daten ohne Notwendigkeit von Standardkurven. Dies hat deutliche Auswirkungen, besonders bei der Quantifizierung von sehr niedrig konzentrierten Targets, die entweder aufgrund eines hohen Gehalts an Inhibitoren und Kontaminanten in der Probe verdünnt wurden oder sehr geringe Expressionslevel aufweisen.
Datenanalyse
QIAGEN Digital Insights bietet leistungsstarke Bioinformatik-Tools, die Ihnen helfen, die in Ihren Genexpressionsdaten verborgenen biologischen Informationen zu verstehen. Mit QIAGEN OmicSoft können Sie Genexpressionsmuster vergleichen und visuell Gene finden, die herauf- oder herunterreguliert sind, um potenzielle Biomarker zu identifizieren. Verwenden Sie den webbasierten Land Explorer QIAGEN OmicSoft und greifen Sie auf Hunderttausende kuratierte Datensätze zu, um den Expressions- oder Mutationsstatus eines Targets in Hunderten Krankheitskategorien zu untersuchen.
Die QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA) hilft Ihnen, Ursache und Wirkung von Genexpressionsänderungen zu verstehen und potenzielle Targets für die weitere Erforschung zu identifizieren. Sagen Sie voraus, welche vorgelagerten Regulatoren verantwortlich sind und ob sie aktiviert oder inhibiert werden. Visualisieren Sie nachgelagerte Effekte, um herauszufinden, welche Gene wahrscheinlich eine Verstärkung oder Abschwächung nachgelagerter biologischer Prozesse bewirken.
