Adición de marcadores internos o marcajes en los extremos
Existen dos maneras de etiquetar ADN con enzimas: en los extremos o internamente a lo largo de la molécula. Los marcadores detectables tales como fluoróforos o nucleótidos modificados pueden ser introducidos mediante de la adición de grupos de 5’ y 3’ a través de la acción enzimática, y también mediante la introducción de marcadores internos a través de técnicas de incorporación directa o postetiquetado con una enzima adecuada.
Estrategias enzimáticas para añadir etiquetas a los ácidos nucleicos
Se requiere el marcaje por acción de una enzima en muchos estudios destinados a dilucidar las funciones y la dinámica de los ácidos nucleicos in vitro y en las células. Por cada sitio donde pueden añadirse nucleótidos marcados al ADN o ARN, hay una enzima adecuada que puede catalizar la adición.
Nombre del producto | DNA Polymerase I | Klenow Fragment | Klenow (3'-5'exo-) Fragment |
Mako DNA Polymerase |
T4 DNA Polymerase |
T7 DNA Polymerase |
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Descripción | ADN polimerasa mesofílica |
Producto truncado de E. coli DNA polymerase I |
Derivado de E. coli DNA polymerase I |
Polimerasa con deficiencia de exonucleasa |
Extensión de un molde de ADN cebado en la dirección 5'➞3' |
ADN polimerasa altamente procesiva |
Características | • Síntesis de ADN 5'➞3' |
• Polimerasa 5'➞3' |
• Polimerasa 5'➞3' |
• Sin actividad de desplazamiento de la cadena |
• Pulido 5' y 3' de los extremos • Sin desplazamiento de la cadena |
• Tasa excepcionalmente alta de síntesis y fidelidad de replicación |
Aplicaciones | Marcado de ADN mediante desplazamiento de mellas, síntesis de ADNc |
Reducción de ADN mediante llenado de la saliente 5’, síntesis de ADNc bicatenario, secuenciación y mutagénesis específica del sitio |
Adición de nucleótido “A” para secuenciación NextGen , amplificación de desplazamiento de cadenas, marcado de ADN |
Secuenciación | Marcado de ADN bicatenario |
Mutagénesis específica del sitio altamente procesiva, síntesis de ADNc bicatenario |
Actividad de exonucleasa |
Actividad de exonucleasa 3'➞5' y 5'➞3' |
Actividad de exonucleasa 3'➞5', sin actividad de exonucleasa 5'➞3' |
Deficiente en las actividades de nucleasa de detección de errores (3'➞5') y desplazamiento de mellas (5'➞3') |
Sin actividad de exonucleasa 3'➞5' o 5'➞3' |
Potente actividad de exonucleasa 3'➞5', sin actividad de exonucleasa 5'➞3' |
Actividad de exonucleasa 3'➞5' |
Listo para liofilización, libre de glicerol |
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Preguntas frecuentes sobre el marcaje de ácidos nucleicos
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