Cree un flujo de trabajo completo para investigación de microbioma
En la investigación del microbioma, es necesario analizar muestras de diferentes orígenes, muy diversas y a menudo muy contaminadas. Esto implica que puede ser difícil obtener resultados en los que pueda confiar. Para obtener la mayor información posible de su muestra de microbioma o para detectar elementos diana microbianos específicos hemos desarrollado un completo flujo de trabajo. Desde la rotura de muestras y la preparación de ácidos nucleicos hasta el análisis de la secuencia por NGS o la cuantificación por PCR digital; explore las siguientes secciones para encontrar una solución adecuada para cada paso del flujo de trabajo del microbioma
Estabilización de muestras
Cuando toma una muestra de heces, los ácidos nucleicos y los microbios reaccionan a cualquier variación en el contenido de oxígeno o de agua así como de la temperatura. Esto, junto con un tiempo de almacenamiento prolongado antes de la extracción de ácido nucleico, podría provocar un aumento o disminución de determinadas especies y un cambio en la composición microbiana.
Por tanto, un paso crucial es la estabilización de los microbios y sus ácidos nucleicos de las muestras para poder obtener la información más precisa. Nuestras soluciones de protección de ADN/ARN mantienen sus muestras intactas y conservan la integridad microbiana.
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Rotura de la muestra
Descubra los productos de disrupción y homogeneización para la disrupción de muestras del microbioma
Muestras de microbioma humano
Características destacadas de la preparación de muestras biomédicas humanas
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Muestras del entorno
Elementos destacados de la preparación de muestras ambientales y agrícolas
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Menor tiempo de intervención gracias a los sistemas de preparación de muestras automatizados
La preparación de las muestras es un factor muy importante en el flujo de trabajo de microbioma correcto y su reproducibilidad. Cuando diferentes personas extraen ácidos nucleicos de muestras, la posibilidad de error aumenta debido a las diversas intervenciones manuales. Esto puede conllevar una variación en la calidad del ácido nucleico en el resultado como la degradación, la concentración o la presencia de contaminantes la muestra. Por lo tanto, la automatización de la extracción de ácidos nucleicos es una manera de garantizar la reproducibilidad. Obtenga más información sobre las soluciones automatizadas de QIAGEN para una preparación de muestras estandarizada y fiable.Análisis de muestras
Análisis por NGS, dPCR y qPCR
Análisis del genoma completo y de secuencias específicas con la secuenciación de siguiente generación (NGS)
Elementos destacados de la NGS para la detección y caracterización de microbioma y de microbios
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Digital Insights
Descubra la información digital para el análisis de microbioma
Preguntas frecuentes sobre métodos de investigación de microbioma
¿Qué es la secuenciación de ARNr 16S e ITS?
El método más común utilizado para la elaboración de perfiles de comunidades microbianas es la secuenciación del gen de ARN ribosomal (ARNr) 16S y las regiones de espaciador transcrito interno (Internal Transcribed Spacer, ITS) para bacterias y hongos, respectivamente. Debido a la distribución universal y la naturaleza conservada, el ARNr 16S y los genes ITS son marcadores bien establecidos que se usan para la identificación y la clasificación bacteriana y fúngica.
El gen ARNr 16S consta de regiones muy conservadas y también hipervariables. Las regiones conservadas sirven como ubicaciones de unión de cebador para la amplificación por PCR de las regiones variables, y las regiones variables contienen secuencias que pueden usarse para la identificación y la clasificación bacteriana.
¿Qué es la secuenciación metagenómica indiscriminada?
En contraste con la secuenciación de ARNr 16S e ITS, la secuenciación metagenómica indiscriminada cubre todo el genoma de todos los organismos presentes en una muestra.
La secuenciación metagenómica indiscriminada cubre toda la información genética de una muestra; por lo tanto, los datos pueden usarse para varios análisis, por ejemplo, los conjuntos y la agrupación metagenómica, la elaboración de perfiles de funciones metabólicas y de genes con resistencia antibiótica.
¿Qué es la metatranscriptómica?
La metatranscriptómica estudia el perfil completo de expresión genética de las comunidades microbianas en entornos naturales vivos. Permite la cuantificación de los niveles de expresión genética y sus cambios en respuesta a distintas condiciones, por ejemplo, condiciones fisiológicas frente a patológicas en un organismo.