Fabienne Desmots-Loyer
Séquençage à haut débit

Importance de l’extraction d’ARNr dans l’optimisation du séquençage d’ARN

QIAseq FastSelect : augmentez vos résultats uniques, découvrez mieux encore la biologie

Saviez-vous que l’extraction d’ARNr efficace est une étape primordiale de l’optimisation du séquençage d’ARN ? La quantité d’ARNr extraite est directement proportionnelle au nombre de résultats uniques de gènes obtenus de la banque. L’extraction d’ARNr efficace, quasiment complète, avant la synthèse de l’ADNc de l’échantillon vous garantit de ne pas faire d’ADNc ribosomique indésirable. Intégrez notre technologie QIAseq FastSelect révolutionnaire à votre procédure de séquençage d’ARN et bénéficiez d’une élimination des ARNr particulièrement efficace en 14 minutes seulement. Concrètement, les échantillons traités avec QIAseq FastSelect ne nécessitent pas d’amplification par PCR préalable au séquençage. Il vous suffit d’utiliser votre banque telle quelle : vous gagnez encore plus de temps et obtenez un nombre plus important de résultats uniques de gènes. Appliquez FastSelect à votre échantillon avant d’utiliser votre kit de préparation de la banque et découvrez encore plus de biologie.

Découvrez l’ingrédient manquant dans votre flux de travail de séquençage d’ARN

Gamme de produits

Les 5 raisons principales pour lesquelles QIAseq FastSelect doit faire partie de votre flux de travail de séquençage d’ARN
  1. Il est extra rapide (élimination de l’ARNr en 14 min ou < 1 heure, selon l’organisme)
  2. Il élimine > 95 % d’ARNr/ARNm de globine
  3. Il améliore la sensibilité du séquençage d’ARN
  4. Il permet d’obtenir des informations plus détaillées sur l’expression génique
  5. Il peut être utilisé avec des kits de banques de séquençage d’ARN multibrin de plusieurs fournisseurs
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Exemples de réussite avec QIAseq FastSelect

L’inspiration en direct du laboratoire
QIAseq FastSelect permet un séquençage d’ARN de haute qualité à partir d’un mélange d’échantillons humains et bactériens

Le Dr Marie Adams, responsable génomique au Van Andel Institute, explique comment la technologie QIAseq FastSelect a permis de générer des données de séquençage d’ARN de haute qualité pour les études de co-expression humaine et bactérienne d’après un même échantillon d’ARN.

Houston lab, people
Département de biologie et biochimie de l’université de Houston
QIAseq FastSelect ouvre la voie à un meilleur traitement du cancer
« QIAseq FastSelect s’est montré un atout précieux pour le séquençage d’ARN dans mon projet. L’ARN était dégradé, presque inutilisable, mais QIAseq FastSelect a véritablement éliminé l’ARN ribosomique de ces échantillons dégradés et amélioré nos banques de séquençage. »

Brandon Mistrella, département de biologie et biochimie de l’université de Houston

Les chercheurs sur le cancer de l’université de Houston ont souvent fait l’expérience de difficultés liées à la dégradation de l’ARN lors de la manipulation d’échantillons FFPE. La présence d’espèces d’ARN indésirables telles que l’ARN ribosomique et l’ARNm de la globine dans l’échantillon d’ARN de faible rendement est venue compliquer davantage encore le séquençage de l’ARN. Découvrez comment QIAseq FastSelect a transformé leurs travaux de recherche, en leur permettant d’obtenir des données précieuses de séquençage d’ARN d’après un ARN FFPE.

Lire le témoignage
FABIENNE DESMOTS-LOYER
Dr Fabienne Desmots-Loyer, chercheuse en hématologie, CHU de Pontchaillou, Rennes, France
QIAseq FastSelect permet de créer des banques de séquençage d’ARN à partir d’ARN FFPE de qualité médiocre
« La procédure est très simple et rapide. Compte tenu de la qualité médiocre des échantillons et de leur faible quantité, j’avoue que je ne m’attendais pas aux résultats obtenus. »

Dr Fabienne Desmots-Loyer, chercheuse en hématologie, CHU de Pontchaillou, Rennes, France

Étant donné l’importance de la dégradation et les faibles quantités, il peut être difficile d’utiliser de l’ARN issu d’échantillons FFPE. Lisez l’histoire du Dr Fabienne Desmots-Loyer, de l’hôpital de Rennes, et découvrez comment QIAseq FastSelect l’a sauvée en fournissant des banques de haute qualité à partir d’échantillons de cancer FFPE, que deux laboratoires commerciaux avaient refusé de traiter en raison d’une importante dégradation et de trop faibles quantités d’ARN.

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QIAseq FastSelect
Une extraction d’ARNr nettement plus rapide et facile

Tandis que d’autres méthodes d’extraction d’ARNr prennent plusieurs heures, nécessitent de nombreuses étapes, fonctionnent seulement sur un ARN non fragmenté ou n’extraient simplement pas suffisamment d’ARNr, la méthode FastSelect vous offre une procédure nettement plus rapide et plus pratique, et des résultats exceptionnels même avec des échantillons FFPE et d’ARN fragmenté.

QIAseq FastSelect et SARS-CoV-2

Déchiffrez les interactions hôte-microbiome pour faire avancer la recherche sur la métatranscriptomique relative au coronavirus

Vous utilisez un mélange d’échantillons humains et de microbiome issus de tissus nasopharyngés, pulmonaires et autres pour les études de métatranscriptomique du coronavirus ? Afin d’optimiser les résultats uniques de l’expression génique/ARNm, utilisez ensemble ou séparément les QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kits et les QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kits, pour une élimination rapide, efficace et ciblée des ARNr de l’hôte et bactériens, tout en conservant les ARN viraux.

Publications récentes sur le SARS-CoV-2 utilisant QIAseq FastSelect :

Toutes les photos ont été prises avant le COVID-19