Verogen MiSeq FGx Sequencing System

• Séquenceur sur paillasse haute performance avec écran tactile intuitif et réactifs prêts à charger
• Fonctionnalité avancée de traitement d’échantillons d’ADN difficiles.
• Interrogation de centaines de marqueurs en une même procédure
• Flexibilité optimisée pour les applications d’identification humaine

Le MiSeq FGx Sequencing System est le premier et le seul instrument de séquençage à haut débit (NGS) conçu, développé et validé pour la génomique en criminalistique. Associant une qualité de données éprouvée à la facilité d’utilisation, le système est au cœur d’une solution à plate-forme unique dotée d’une technologie de NGS de pointe. Préparez et séquencez des banques puis analysez les données dans une même procédure conçue pour s’adapter à une gamme croissante d’applications, incluant de nouveaux outils tels que la généalogie génétique en criminalistique (FGG). Des kits de réactif dédiés et les logiciels d’analyse correspondants vous aident dans toutes vos recherches en identification humaine.

Le système MiSeq FGx fait partie d’une procédure validée spécifiquement conçue pour les laboratoires de criminalistique. Il bénéficie de qualifications de performances et d’une maintenance régulière qui répondent aux exigences d’un laboratoire de criminalistique. Grâce à la vitesse et à la précision de la technique de séquençage par synthèse (SBS) d’Illumina, le système MiSeq FGx intègre la finesse incomparable de la génomique en criminalistique au NGS, et devient un précieux allié en matière de justice criminelle.

• Une analyse supérieure des mélanges d’ADN complexes et de l’ADN dégradé
• Une procédure de séquençage intégrée facilite la préparation de banque, le séquençage et l’analyse
• Capacité avancée avec longueurs de lecture ajustables, deux modes d’exécution et deux Flow Cells

Le système MiSeq FGx est le premier et le seul instrument capable d’interroger jusqu’à 96 banques de SNP et STR combinés au cours d’un même cycle. Le système MiSeq FGx préserve les échantillons précieux tout en affichant des performances remarquables, en développant des profils ADN plus complets et détaillés à partir de divers types d’échantillons, de molécules biologiques, et sur toute la gamme, de l’ADN génomique (ADNg) de grande qualité aux échantillons dégradés, mélangés et limités.

Deux modes d’exécution facilitent diverses applications de génomique en criminalistique et permettent de conserver la flexibilité du travail dans un environnement de recherche. Alternez facilement entre deux kits de séquençage afin de définir le résultat de l’application en cours ou la taille du lot d’échantillons. Basée sur la technique de SBS d’Illumina leader sur le marché, le système MiSeq FGx satisfait aux exigences strictes de performances pour des résultats exhaustifs et concluants. Vous supprimez quasiment les erreurs contextuelles, même dans des régions à séquences répétitives ou homopolymères, et répondez à de nombreuses questions en un dosage ciblé avec multiplexage. Une interface intuitive avec écran tactile simplifie l’utilisation de l’instrument et le système surveille les données de qualité et de performances en cours de cycle. Au terme du séquençage, l’analyse démarre automatiquement et se termine en moins d’une heure.

Comparé à l’analyse basée sur la taille des répétitions en tandem (STR) par électrophorèse capillaire (CE), le NGS détecte tout le spectre de variation génétique dans un échantillon d’ADN plus rapidement que n’importe quelle autre technologie. Dotée d’une sensibilité inhérente, la technologie de NGS de Verogen va au-delà de la taille de fragment pour identifier la variation de séquence sous-jacente. Vous obtenez rapidement et facilement des résultats complets, qui indiquent les séquences base par base pour une interprétation facile et optimale. Basé sur les capacités des STR, le NGS offre aujourd’hui d’autres avantages à la génomique en criminalistique, notamment l’analyse des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) nucléaires, de l’ADN mitochondrial (ADNmt), de l’ARN messager (ARNm) et des marqueurs épigénétiques. Grâce à cette technologie, les affaires nécessitant une identification humaine sont facilitées et il n’est plus nécessaire de mettre en balance les limitations techniques et les informations éventuellement obtenues. Vous obtenez de meilleurs résultats au cours d’un seul cycle de séquençage.

Le système MiSeq FGx offre une qualité de données exceptionnelle en appliquant une méthode brevetée, basée sur des terminateurs réversibles, capable de détecter les bases individuelles lorsqu’elles sont incorporées aux brins d’ADN massivement parallèles. Les colorants de terminateurs fluorescents sont capturés lorsque chaque désoxynucléotide triphosphate (dNTP) est ajouté puis clivé pour permettre l’incorporation de la base suivante. Avec les quatre dNTP liés aux terminateurs réversibles présents à chaque cycle de séquençage, la concurrence naturelle parmi les bases limite le biais d’incorporation. Le logiciel recherche les bases directement à partir des mesures d’intensité du signal au cours de chaque cycle d’incorporation, cela réduit le taux d’erreur brut comparé à d’autres technologies. Le résultat est un séquençage base par base particulièrement précis qui limite les erreurs contextuelles dans les séquences, même dans des régions à séquences répétitives ou homopolymères.

Les banques séquencées sur le système MiSeq FGx suivent fondamentalement la même procédure de NGS : préparation de banque, séquençage et analyse. La première étape consiste à utiliser un kit de préparation de banque pour ajouter des amorces à un ADN génomique (ADNg), un ADNmt ou un ARNm extrait d’échantillons de criminalistique pour capturer et amplifier simultanément des centaines de régions cibles, générant ainsi des banques doublement indexées prêtes pour le séquençage. Après la préparation de banque, les réactifs prêts à charger simplifient la configuration du cycle d’exécution. Il vous suffit de décongeler la cartouche de réactif préremplie, d’ajouter les banques à la cartouche puis d’insérer celle-ci dans l’instrument. D’un simple appui sur un bouton, le logiciel du système accepte les paramètres du cycle et démarre le séquençage.

Le système MiSeq FGx est adapté à toutes les molécules biologiques et à un nombre croissant d’applications, y compris la recherche de parenté proche et lointaine. Les longueurs de lecture ajustables, les options de Flow Cell et divers modes d’exécution offrent une flexibilité incomparable pour obtenir des données pertinentes en identification humaine, une discipline toujours plus exigeante. Le système MiSeq FGx permet d’analyser sans difficulté un ADN dégradé, un ADN en faible quantité, des mélanges d’ADN complexes et d’autres échantillons difficiles qui peuvent compliquer voire compromettre une enquête. Les petites tailles d’amplicon sont parfaitement adaptées à l’interrogation d’un ADN dégradé, tandis qu’un grand nombre de marqueurs, dont beaucoup sont hautement polymorphes, améliorent la capacité du système à distinguer les composants mineurs de base que la CE ne détecte pas toujours. De surcroît, un cycle de séquençage permet d’interroger des centaines de marqueurs génétiques pertinents en criminalistique, plus besoin de choisir entre des kits de STR basés sur la longueur de fragment et des produits similaires pour s’adapter aux échantillons difficiles.

Le système MiSeq FGx comprend une interface intuitive avec écran tactile qui offre un guidage pas à pas à chaque étape d’un cycle de séquençage, du chargement des consommables à la configuration et à la surveillance du cycle. La création de groupes à bord et le lancement automatique de l’analyse permettent de limiter le temps de manipulation. En complément du logiciel intégré, le système est doté d’un logiciel d’analyse universel (UAS), une plate-forme d’analyse entièrement optimisée qui contient une suite puissante de fonctionnalités dédiées à la criminalistique, notamment la détection automatique d’échantillons mélangés, la création de statistiques de population, de rapports compatibles avec les bases de données et bien plus encore. L’UAS est préinstallé sur un serveur dédié indépendant de l’instrument, plus besoin de matériel auxiliaire et autres ressources informatiques, et l’empattement de l’instrument se limite à seulement 0,4 mètre carré.

Nous proposons une assistance optimale tout au long de la procédure, de la préparation de banque au séquençage en passant par l’analyse. Notre équipe d’experts offre un service complet pour vos équipements, logiciels et plans de validation, et vous guide pour l’installation pour que vous puissiez utiliser vos procédures rapidement et facilement.