two scientists in a laboratory working on computer screens

Séquençage à haut débit

Solutions de NGS pour la surveillance génomique du SARS-CoV-2

Les heures et les minutes comptent, dans la cadre de la course contre les nouveaux variants viraux

La pandémie de COVID-19 prend une nouvelle tournure avec l’émergence alarmante de nouveaux variants inquiétants (VOC) du SARS-CoV-2, notamment les lignées alpha, bêta, gamma, delta, mu et omicron. La menace de voir ces nouveaux variants échapper à la réponse immunitaire, diminuant ainsi l’efficacité des vaccins, est réelle. Les laboratoires sont donc sous pression pour séquencer les échantillons le plus vite possible afin d’identifier de nouveaux variants du SARS-CoV-2 et les variants existants qui circulent dans la population. Pour vous soutenir dans votre surveillance génomique du SARS-CoV-2, nous avons conçu deux solutions sur mesure pour l’amplification du virus et la préparation de la banque de NGS.

Trouvez la solution de surveillance génomique qu’il vous faut

Plus le séquençage des échantillons est rapide, plus l’aperçu exhaustif des variants en circulation est rapide, ainsi vous avez toujours un coup d’avance. Découvrez comment nos solutions de surveillance génomique peuvent vous aider.

Solution de NGS rapide et améliorée

Le QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit fonctionne avec tous les variants préoccupants connus, y compris Omicron

Accélérez le séquençage du variant du SARS-CoV-2 avec une solution de NGS 50 % plus rapide. Le QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit fournit une couverture du génome viral supérieure avec un flux de travail automatisable de 4 heures, avec une réduction de 50 % du plastique utilisé, ainsi que la prise en charge du multiplexage d’un maximum de 768 échantillons dans une lignée cellulaire à flux unique. Le recouvrement d’amplicons à plus forte densité du QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit assure une performance solide sur tous les VOC, y compris la détection des variants Omicron et Delta, sans nécessiter des stratégies de modification d’amorce ou de kits d’amélioration d’amorce.

Nouveau ! QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit

Le QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit permet d’augmenter encore la couverture génomique tout en simplifiant votre procédure lorsqu’il est associé au QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit.

Profitez des éléments suivants :

Procédure simplifiée : Pas besoin de normalisation/quantification avant l’amplification de la bibliothèque
Amélioration de la couverture et de l’uniformité du génome : Couverture > 95 % même pour des nombres de copies du génome viral extrêmement faibles
Une exigence de lecture plus faible : Réduction par 4 du nombre de clusters recommandés par échantillon, ce qui permet d’économiser sur les coûts de séquençage et d’augmenter le multiplexage.

Obtenez le QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit sans frais supplémentaires lorsque vous achetez le QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit. Soumis aux conditions générales.^†

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Articles de blog et ressources

Détecter les variants du SARS-CoV-2 dans les eaux usées avec le NGS

Dr Davida Smyth explique comment le NGS du génome complet l’a aidé à détecter les variants du SARS-CoV-2 en circulation et même à révéler de nouvelles mutations d’échantillons d’eaux usées.

Lire l’article de blog

Livre blanc : Identification des VOC à partir d’échantillons COVID du monde réel

Découvrez comment Nicolò Musso et son équipe de l’Université de Catane ont analysé 250 échantillons COVID-positifs de qualité d’ARN variable à l’aide du kit QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 et ont détecté plusieurs des VOC circulant dans la population locale à ce moment-là, notamment les variants Alpha, Gamma et Delta.

Télécharger le livre blanc

Corona virus, COVID-19, virus with antibodies

Variants, surveillance et efficacité des vaccins : les rebondissements de la pandémie de COVID-19

Alors que la pandémie de COVID-19 continue d’évoluer avec l’émergence du variant Omicron, découvrez comment le NGS, en particulier le séquençage du génome entier, permet de déterminer la prévalence des variants en circulation. Notre article de blog aborde la détection des variants du SARS-CoV-2, les tests sur les eaux usées, les mutations qui échappent au vaccin, etc.

Consulter

Pourquoi choisir le QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit ?

Optez pour notre solution de NGS compacte et ultra-rapide si vous souhaitez accroître votre efficacité, améliorer vos capacités de séquençage et assurer une couverture supérieure pour accélérer la détection des variants. Vous pouvez désormais profiter du QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Enhancer Kit, une nouveauté qui – quand elle est utilisée avec le QIAseq DIRECT SARS-CoV-2 Kit – simplifie davantage le flux de travail et améliore la couverture, tout en nécessitant moins de lectures par échantillon.

Solution de NGS optimisée basée sur la conception ARTIC

QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel

Accélérez la détection des variants du SARS-CoV-2 et la surveillance génomique en temps réel avec notre procédure modulable d’une journée, elle est plus rapide et nécessite des quantités de départ moindres par rapport aux solutions Hybrid Capture. Basé sur les conceptions ARTIC V3 optimisées déjà disponibles, le QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel permet l’enrichissement ciblé du génome viral entier, ce qui vous permet de :

Obtenir une couverture importante, même avec un faible nombre de copies compte tenu de la réduction de l’effet des décrochages et des dimères d’amorces
Multiplexer jusqu’à 384 échantillons en un seul cycle sur les plates-formes Illumina à haut débit
Identifier et visualiser la diversité phylogénétique avec des pipelines d’analyse avec bio-informatique intégrée

Une combinaison gagnante pour une plus grande variabilité

Associez le QIAseq SARS-CoV-2 Primer Panel au QIAseq FX DNA Library UDI Kit pour multiplexer jusqu’à 384 échantillons en un seul cycle.

Demandez un kit d’essai

Automatisez et accélérez la préparation de votre banque

Dans quelle mesure la préparation automatisée de la banque NGS peut-elle être avantageuse pour votre laboratoire ?

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Article vedette

Genomics, QIAseq NGS Solutions, Dr. Mette Christiansen, Aarhus University hospital, COVID-1

Séquencer les mutations du COVID-19 d’après la transmission inter-espèces

L’année dernière, on pensait qu’avant novembre 2020 plus de 200 individus au Danemark auraient attrapé le COVID-19 par l'intermédiaire de visons. Entre temps, le virus avait muté chez les animaux, donnant naissance à une multitude de variants. Le Dr Mette Christiansen, à la tête du Centre de NGS diagnostique en médecine moléculaire (MOMA) à l’hôpital universitaire d’Aarhus, explique comment le séquençage de chaque cas positif a permis d’avoir un aperçu précis des variants en circulation. Voyez comment les technologies de NGS QIAGEN ont facilité cette tâche.

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Publications

Nous appelons à accroître le séquençage du virus, avec toujours une surveillance et un contrôle de chaque instant et la réalisation de tests

Directeur général de l’Organisation mondiale de la Santé (OMS)

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Développez vos connaissances de la métatranscriptomique du SARS-CoV-2

Découvrez comment nos solutions de NGS innovantes peuvent accroître la sensibilité du séquençage d’ARN dans la recherche sur la métatranscriptomique du SARS-CoV-2.

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Toutes les photos ont été prises avant le COVID-19

^†L’offre est basée sur le prix catalogue. Offre non valable là où la loi l’interdit et non cumulable avec d’autres promotions. Offre valable dans certains pays uniquement. Les frais de transport et de livraison ne sont pas inclus. L’offre est limitée dans le temps et soumise à certaines restrictions énoncées dans le présent document. Il incombe au client de s’assurer que l’acceptation de cette offre n’enfreint aucune politique interne de l’organisation du client ni aucune loi ou réglementation applicable.