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SÉQUENÇAGE À HAUT DÉBIT

Microbiomes et métagénomique

La recherche sur les microbiomes nous aide à mieux comprendre comment nos vies et nos environnements sont affectés par les bactéries, les champignons, les archées et les virus. Dans le passé, la recherche sur le microbiome se limitait à notre capacité à cultiver des microbes pour caractériser notre monde microbien. Avec le séquençage haut débit (NGS), nous sommes en mesure de mieux comprendre les microbes qui vivent en nous, sur nous et autour de nous. Le séquençage du génome entier et le séquençage 16S/ITS peuvent fournir de nouvelles informations sur la santé humaine et sur les maladies et peuvent aider au développement de nouveaux diagnostics et de nouveaux traitements.
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Séquençage métagénomique entier ou séquençage 16S ?
Lors de la planification de votre expérience de métagénomique, comment choisir entre le séquençage 16S/ITS ou le séquençage du génome entier ? Quelle est la méthode la mieux adaptée à votre situation ? Lisez nos trucs et astuces pour le savoir.
Webinaire : Éclairage sur les communautés microbiennes à l’aide de nouvelles solutions de séquençage NGS
Le séquençage 16S/ITS et le séquençage métagénomique microbien du génome entier sont bien adaptés à l’analyse du microbiome, mais ces deux technologies offrent des avantages différents. Découvrez ces technologies et parcourez les données de performance des solutions QIAseq afin de pouvoir choisir celle qui convient le mieux à votre flux de travail métagénomique.
webinar image Dylan Barbera Novel NGS Tools for human microbial profiling
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Six questions sur le profilage taxonomique
Pour vous aider à choisir les bons outils pour votre recherche, nous vous proposons les réponses aux six questions les plus fréquemment posées de notre webinaire sur le profilage taxonomique, concernant le profilage des communautés microbiennes et la métagénomique.
Vous ne savez pas par où commencer ?
Contactez un spécialiste des applications génomiques !
Développer un profilage cohérent et précis du microbiome basé sur la métagénomique
Le Dr Dieter Tourlousse, de l’Institut national des sciences et technologies industrielles avancées (AIST) de Tsukuba au Japon décrit une étude de référence visant à établir des procédures opérationnelles normalisées à l’aide du kit QIAseq FX DNA Library Kit pour l’analyse du microbiome d’échantillons fécaux humains basée sur la métagénomique.
image for on demand webinar Standarize microbial profiling
Comment fonctionne la fragmentation enzymatique ?
L’ADN doit être fragmenté pendant la préparation de la banque de séquençage du génome entier. Quelle est la différence entre la fragmentation enzymatique, la fragmentation mécanique et la tagmentation ? Découvrez les avantages et les inconvénients de chacune.
Pourquoi choisir QIAseq FX pour la métagénomique du génome entier ?
En savoir plus sur ce flux de travail toutes enzymes de 2 heures 30, facile à automatiser.
Séquençage génétique ARNr 16S/ITS

Avantages de la technologie QIAseq 16S/ITS

  • Les « amorces phasées » augmentent la diversité des bases et la qualité de lecture.
  • Les réactifs à faible charge biologique minimisent la contamination de fond.
  • Il est possible d’utiliser un apport d’ADN pas plus important que 1 pg pour profiler les échantillons à faible masse biologique.
  • Interrogez uniquement vos régions d’intérêt en choisissant de profiler toutes les régions 16S/ITS ou concevez des panels.
Female scientist watching an instrument
Préparation de la banque automatisée ou manuelle ?
Si votre laboratoire traite des centaines, voire des milliers d’échantillons, la préparation manuelle de la banque peut ralentir votre accès aux informations et compliquer les résultats en raison des erreurs liées à la manipulation manuelle et des incohérences entre lots. Découvrez comment l’automatisation peut accélérer votre recherche.
Rationalisation des études métagénomiques grâce à l’automatisation
Le Dr Fan Li et Sara Zabih du laboratoire Aldrovandi de l’UCLA discutent de l’automatisation de la préparation de banques à haut débit pour les banques de séquençage métagénomique shotgun compatibles avec les instruments Illumina au moyen du kit QIAseq FX DNA Library Kit.