QIAcuity Digital PCR System

Pour les applications de PCR numérique sur nanoplaque

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QIAcuity One, 2plex Device

N° de réf. / ID.   911001

Instrument de PCR digitale à une seule plaque permettant la détection de jusqu’à 2 colorants fluorescents, rouleau, clé USB et QIAcuity Software Suite : comprend 1 visite de maintenance préventive. Une garantie de 1 an couvrant pièces, main-d’œuvre et déplacement est également incluse.
Format
One
Four
Eight
Détection multicanal
2 channels (up to 4plex)
8 channels (up to 12plex)
Options de service
Device
System
System FUL-2
Le QIAcuity est destiné aux applications de biologie moléculaire. Ce produit n’est pas conçu pour le diagnostic, la prévention ou le traitement des maladies. Par conséquent, les caractéristiques de performances du produit dans un contexte clinique (diagnostic, pronostic, thérapie ou banque de sang) sont inconnues. Pour les applications diagnostiques de la PCR numérique, veuillez utiliser le QIAcuityDx Digital PCR System.
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Caractéristiques

  • Système entièrement intégré
  • Format évolutif (instruments à 1, 4 et 8 plaques)
  • Capacités de multiplexage avancées (jusqu’à 12-plex)
  • Jusqu’à six canaux standard plus deux canaux hybrides pour les colorants LSS
  • Cadence d’analyse flexible
  • Résultats complets en 2 heures environ

Détails produit

Le QIAcuity Digital PCR System est conçu pour produire des résultats précis de quantification multiplex pour la détection des mutations, les variations du nombre de copies (Copy Number Variation, CNV), les études d’expression génique, l’analyse d’édition génique, et bien plus encore. Ce système à base de nanoplaques intègre une méthode de dPCR classique de partitionnement, thermocyclage et imagerie dans une plateforme automatisée et autonome, réduisant au minimum le temps d’intervention.

Ce système s’utilise conjointement avec les nanoplaques, réactifs et dosages QIAcuity.

Explorez la démonstration virtuelle pour en savoir plus sur QIAcuity.

Performances

Le QIAcuity Digital PCR System rend la quantification absolue accessible et abordable pour tous les laboratoires. Permettant un fonctionnement autonome, l’automatisation intègre et simplifie toute la méthode de PCR numérique de partitionnement, thermocyclage et imagerie dans un seul instrument avec un temps d’intervention minimal. Il est également facile d’adapter vos dosages de qPCR actuels au QIAcuity Digital PCR System. La manipulation des plaques ne requiert aucune modification par rapport à la qPCR. La configuration des dosages est donc rapide et les résultats sont obtenus en 2 heures environ.

Instruments QIAcuity – fonctionnalités et caractéristiques

Fonctionnalité QIAcuity One 2plex QIAcuity One 5plex QIAcuity Four QIAcuity Eight
Plaques traitées 1 1 4 8
Canaux de détection 2 81)
(6+2 hybrid2)
81)
(6+2 hybrid2)
81)
(6+2 hybrid2)
Capacité de multiplexage  4 123)1) 123)1) 123)1)
Thermocycleur(s) 1 1 1 2
Délai d’obtention du résultat Environ 2 h

Environ 2 h

Première plaque en 2 h environ

Une plaque supplémentaire toutes les ∼80 min env.

Première plaque en 2 h environ

Une plaque supplémentaire toutes les ∼40 min env.

Débit (échantillons traités au cours d’une journée)

Jusqu’à 384 (96 puits)

Jusqu’à 96 (24 puits)

Jusqu’à 384 (96 puits)

Jusqu’à 96 (24 puits)

Jusqu’à 672 (96 puits)

Jusqu’à 168 (24 puits)

Jusqu’à 1248 (96 puits)

Jusqu’à 312 (24 puits)

1) Nécessite l'utilisation du kit PCR QIAcuity High Multiplex Probe en cas de multiplexage > 5plex 
2) Des canaux hybrides sont utilisés pour les colorants Long Stokes Shift (LSS)
3) La détection de 12 cibles en parallèle peut être réalisée en utilisant le multiplexage d’amplitude dans les six canaux standard. En combinant des canaux hybrides pour les colorants LSS monoplex et le multiplexage d’amplitude, le multiplexage total possible peut être augmenté à 14. Cependant, cette combinaison n’est pas recommandée en raison de la demande d’optimisation pour tous les dosages utilisés dans un mélange réactionnel et de leur compensation de diaphonie correspondante.

Principe

Vous pouvez obtenir, en seulement 3 étapes simples, le résultat de dPCR que vous voulez en 2 heures environ : pipettez et chargez, effectuez l’expérience, puis analysez les résultats.

Vous trouverez ici une description du principe de la réaction de dPCR sur nanoplaque.

Procédure

Comme dans les expériences de qPCR, la préparation des échantillons comprend le transfert du master mix, des sondes et des amorces sur une nanoplaque de 96 ou 24 puits, suivi de l’addition des échantillons. Le système intègre le fractionnement, le thermocyclage et l’imagerie dans un seul instrument entièrement automatisé qui permet aux utilisateurs d’obtenir des résultats en moins de 2 heures. Il est possible d’effectuer l’analyse à l’aide de la suite logicielle, qui donne la concentration de la séquence cible en copies par microlitre et permet le contrôle qualité pour les échantillons positifs ou NTC. Cette analyse peut également être effectuée sur des ordinateurs à distance au sein du même réseau local (Local Area Network, LAN).

Applications

Associés aux QIAcuity Nanoplaques et aux QIAcuity PCR Kits, les instruments QIAcuity facilitent les applications de PCR numérique telles que :

  • La détection des mutations rares
  • L’analyse des variations du nombre de copies
  • L’analyse de l’expression génique
  • La détection des agents pathogènes
  • Le génotypage
  • La recherche sur les miARN
  • La thérapie génique et cellulaire

 

Logiciel

La QIAcuity Software Suite fournie avec l’instrument et installée sur un ordinateur distinct contrôle un ou plusieurs instruments QIAcuity, soit via une connexion directe, soit via un réseau local (Local Area Network, LAN) existant. À l’aide de la QIAcuity Software Suite, les expériences, échantillons et mélanges réactionnels de PCR numérique peuvent être définis, attribués à des nanoplaques et transférés sur l’instrument QIAcuity. Après le cycle d’exécution, il est possible d’analyser les données, de créer des rapports et d’exporter les données pour une analyse externe. Le logiciel offre de multiples fonctionnalités de modèles pour faciliter la réutilisation de plans de plaque ou de paramètres de cycle d’exécution de plaques, transformant encore davantage votre pratique de la PCR numérique.

Lorsqu’il est intégré à un réseau local, l’ordinateur héberge la fonction QIAcuity Software Suite en tant que serveur accessible via LAN aux ordinateurs clients. Cela permet à plusieurs utilisateurs d’accéder au logiciel depuis d’autres pièces ou bureaux et d’analyser les données dans un navigateur classique, sans devoir installer le logiciel sur plusieurs ordinateurs ni utiliser de connexions internet pour accéder aux données et pour les transmettre.

Services

Protégez votre instrument grâce aux diverses solutions de service QIAGEN. Renseignez-vous sur un contrat de service spécifique pour répondre à vos besoins.

Données et illustrations utiles

Kits & Consumables

dPCR Kits
dPCR Assays
dPCR Accessories
QIAcuity RCL Quant Kit image
Cat. No.: 250322

Plans des services

QIAcuity One 2plex Full Agreement

N° de réf. / ID.   9245362

Une réparation d’instrument QIAcuity One 2plex sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de deux jours ouvrables. Comprend une visite de maintenance préventive pendant la période couverte par le contrat complet.

QIAcuity One 2plex Core Agreement

N° de réf. / ID.   9245358

Une prestation de réparation sur site et une visite de maintenance préventive sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de cinq jours ouvrables. Comprend une remise de 10 % sur une prestation de réparation supplémentaire en cours de période contractuelle.

QIAcuity One 5plex Core Agreement

N° de réf. / ID.   9245359

Une prestation de réparation sur site et une visite de maintenance préventive sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de cinq jours ouvrables. Comprend une remise de 10 % sur une prestation de réparation supplémentaire en cours de période contractuelle.

QIAcuity Four Core Agreement

N° de réf. / ID.   9245360

Une prestation de réparation sur site et une visite de maintenance préventive sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de cinq jours ouvrables. Comprend une remise de 10 % sur une prestation de réparation supplémentaire en cours de période contractuelle.

QIAcuity Eight Core Agreement

N° de réf. / ID.   9245361

Une prestation de réparation sur site et une visite de maintenance préventive sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de cinq jours ouvrables. Comprend une remise de 10 % sur une prestation de réparation supplémentaire en cours de période contractuelle.

QIAcuity One 5plex Full Agreement

N° de réf. / ID.   9245363

Une réparation d’instrument QIAcuity One 5plex sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de deux jours ouvrables. Comprend une visite de maintenance préventive pendant la période couverte par le contrat complet.

QIAcuity Four Full Agreement

N° de réf. / ID.   9245364

Une réparation d’instrument QIAcuity Four sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de deux jours ouvrables. Comprend une visite de maintenance préventive pendant la période couverte par le contrat complet.

QIAcuity Eight Full Agreement

N° de réf. / ID.   9245365

Une réparation d’instrument QIAcuity Eight sur site, comprenant déplacement, pièces et main-d’œuvre pendant un an. Délai de réponse de deux jours ouvrables. Comprend une visite de maintenance préventive pendant la période couverte par le contrat complet.

FAQ

Is it possible to change voltage set-up from 110V to 230V on the QIAcuity instruments?

This is not needed. The QIAcuity is equipped with a flexible power supply technology and operates within a range of 100–240V AC, 50/60 Hz, 1500 VA (max). 

FAQ-3761
Can I see error codes on the instrument touchscreen?

The instrument software GUI shows error codes including a description and information how to resolve the error. The instrument touchscreen shows an alarm icon in the upper right corner that turns red in case of an instrument failure. Accessing the System Status in the Tool tab allows users to clear errors. Rebooting of the instrument is required to complete the removal of the error.  Please do not skip this step. You may always contact QIAGEN Technical Services in case of any question. 

FAQ-3763
What is the scope of a regular maintenance of the QIAcuity?

The user manual contains instructions on how to perform a regular cleaning and decontamination, and how to replace air filters on the QIAcuity instruments. A regular maintenance reduces the dust in the instrument and therefore minimizes the presence of dust particles on the nanoplate, which might interfere with the plate analysis.

FAQ-3765
What is the impact of not applying the latest VPF? Can I reanalyze previously obtained results after installing the latest VPF?

If you had run a nanoplate for which the installed VPF misses the specific factor, the software will notify you. If you then analyze without the specific VPF, the impact depends on the variation of the partition volume of the new Nanoplate batch compared to the latest. Typically this variation is ±6–7% (approx. 5% CV over the entire plate). The analysis may be repeated after updating the VPF file. After installing the latest VPF and re-analysis of the run, a copy of the plate is generated in the QIAcuity Software Suite including the new results. 

FAQ-3769
Can I see on the QIAcuity Software Suite report file if the VPF (Volume Precision Factor) has been used or not?

Yes, the report includes a notification if the matching VPF was missing and, therefore, not applied to the analysis. If the matching VPF was applied there is no notification on the report. 

FAQ-3770
Is it necessary to reanalyze a plate with VPF (Volume Precision Factor) that was already processed using a QIAcuity instrument that was purchased in 2020?

If you had analyzed your nanoplates without VFP, the impact depends on the variation of the partition volume of the new nanoplate batch compared to the latest. The VPF reduces the CV from approximately 5% to 2%. We recommend to reanalyze results in case the data originated from different wells (e.g., copy number variations or gene expression data sets for which the reference sample was measured in a different well). Results obtained across different plates should also be r-analyzed. A reanalysis is not required for assay data that were analyzed within the same well (e.g., mutation rate determination using two channels within the same well).

FAQ-3771
Can I prepare a dPCR reaction directly in QIAcuity Nanoplate?

A standard PCR plate is required to set up dPCR reaction before transferring it to the nanoplate to ensure a proper mixing of the reaction mix before partitioning. 

FAQ-3774
Can I use a custom master mix instead of a QIAGEN master mix?

QIAGEN master mixes are optimized for nanoplate microfluidics and are recommended to be used with our dPCR system. They also include an optimized reference dye required for proper analysis.

FAQ-3777
How to prepare DNA prior to dPCR?

All DNA samples used in reaction mixes should show similar quality and quantity, which can easily be assessed using UV spectrophotometry. DNA samples with an average length of ≥20 kb (e.g., genomic DNA purified via spin column with silica membrane) should be fragmented by restriction digestion before partitioning. Enzymatic fragmentation of larger DNA ensures an even distribution of template throughout the QIAcuity Nanoplate, which in turn leads to an accurate and precise quantification.

FAQ-3778
What are the storage conditions and expiry date of QIAcuity consumables?

The QIAcuity Probe PCR Kit should be stored immediately upon receipt at –30 to –15°C in a constant-temperature freezer and protected from light. The QIAcuity Probe PCR master mix can also be stored protected from light at 2–8°C. Components are stable for 12 months, unless otherwise indicated on the label. 
The QIAcuity EG PCR Kit should be stored immediately upon receipt at –30 to –15°C in a constant-temperature freezer and protected from light. The QIAcuity EG PCR master mix can also be stored protected from light at 2–8°C. Components are stable for 6 months, unless otherwise indicated on the label. 
The QIAcuity Nanoplates does not have expiry date and are stable for at least 1 year when stored at RT. 

FAQ-3780
Can I use the QIAcuity Nanoplate in more than one runs?

The plate is designed for a single use run. For example, even if only 30 samples are loaded into the 96-well plate, a whole plate will be sealed by the roller. It can't be unsealed and used for another run. The QIAcuity Software won’t allow to set up a separate experiment for the same nanoplate to avoid that previously processed plates being not partitioned a second time.

FAQ-3781
Can I optimize a dPCR assay on the QIAcuity using gradient temperature?

An essential temperature gradient functionality was introduced with software version 2.5. When updating older software versions to 2.5, each QIAcuity instrument will offer the temperature gradient and may be used to find the best cycling temperature for new dPCR assays. When running a QIAcuity Four or a QIAcuity Eight, all plates may have their own temperature profile, including the option for a temperature gradient.

FAQ-3783
What is the VPF (Volume Precision Factor)?

The VPF provides a set of well-specific and molding form-specific factors used to specify the exact reaction volume of a nanoplate, thus increasing the concentration calculation of each well. 

FAQ-3784
When and how often do I need a new VPF (Volume Precision Factor)?

 In general, nanoplates provide partitions of fixed sizes that enable a very precise way of sample concentration calculation. If a new molding form is used for nanoplate manufacturing, potential variation of partition sizes can be addressed by applying the molding form-specific VPF. Thus, each time a new molding form is used, a new VPF is created and made available. Currently, the VPF is updated once every 3–6 months.

FAQ-3785
Is a standard curve needed in dPCR?

In dPCR we measure the absolute concentration of targets at endpoint reaction. Concentrations of unknowns can be determined based on dPCR results observed (number of negatives, number of positives, and partition volume analyzed).

FAQ-3786