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Séquençage à haut débit

Séquençage de cellules individuelles

Image reproduite avec l’aimable autorisation de Namocell

Optimisez les informations obtenues à partir de faibles quantités d’échantillon

Travailler avec des cellules uniques, des populations cellulaires ou de l’ADN ou de l’ARN en faibles quantités ne devrait pas limiter votre capacité à découvrir plus en profondeur le génome ou le transcriptome. Les kits QIAseq Single Cell Library Kits UDI peuvent vous aider à découvrir les détails génomiques et transcriptomiques de cellules uniques et de quantités limitées d’acides nucléiques. Préparez des banques complexes de génomes entiers ou de transcriptomes entiers avec un flux de travail à un seul tube et un temps de manipulation minimal. Vous vous inquiétez des biais ? Le protocole sans PCR signifie que vous pouvez éviter un impact négatif sur la diversité de la banque, que ce soit la perte des transcrits de faible abondance ou les biais de GC et de longueur. L’inclusion d’indices doubles uniques (UDI) minimise les artefacts de séquençage dus aux « sauts d’indices » sur les instruments de NGS Illumina.

Relevez le défi QIAseq pour le séquençage NGS des cellules uniques et des échantillons à faibles quantités d’ARN

QIAseq Single Cell DNA Library Kits UDI
  • Banques de génomes entiers à partir de cellules uniques
    en moins de 4 heures.
  • Analysez les variations du nombre de séquences et de copies n’importe où dans le génome
  • Fournit des banques NGS sans PCR et de l’ADNg amplifié pour les tests de suivi
  • L’amplification à déplacement multiple (MDA) par l’ADN polymérase MDA REPLI-g fournit une amplification haute fidélité et réduit les faux positifs
  • Comprend des indices doubles uniques pour minimiser les artefacts de séquençage dus aux “sauts d’indice” sur les instruments de NGS Illumina
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QIAseq Single Cell RNA Library Kits UDI
  • Commencez avec des cellules uniques, des populations cellulaires ou procédez à un enrichissement pour de petits génomes d’ARN ou virus
  • Choisissez de vous concentrer sur les ARNm ou d’étudier le transcriptome
  • L’amplification de l’ARN REPLI-g et le protocole sans PCR réduisent les biais et offrent une plus grande reproductibilité
  • Comprend des indices doubles uniques qui garantissent des données de haute qualité avec NovaSeq et des cuves à circulation à motifs
  • Banques de séquençage NGS à partir de cellules individuelles prêtes en 5 heures 30
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Intitulé : Exploitation des flux de travail du séquençage de l’ARN et de l’ADN PLATE pour la génomique à une seule cellule en quantités de départ rares ou faibles

Intervenants : Felix Alonso-Valenteen Ph.D., chercheur en applications de terrain, Namocell et Ioanna Andreou, Ph.D., directrice associée en R&D, Développement d’applications NGS, QIAGEN

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Optez pour le moyen le plus rapide d’accéder aux cellules uniques avec la technologie d’isolement de cellules uniques de Namocell†.
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Commencez à préparer des banques de génome entier avec des cellules individuelles à l’aide des kits QIAseq Single Cell DNA Library Kits UDI.
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Commencez le séquençage de l’ARN de cellules individuelles à l’aide des kits QIAseq Single Cell RNA Library Kits UDI.
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Solution Sample to Insight pour le séquençage à cellule unique et à faibles quantités de départ

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Les 4 points principaux à prendre en compte pour le séquençage NGS avec des cellules individuelles et de faibles quantités de départ

1. Importance de la méthode d’isolement
La viabilité des cellules et une manipulation en douceur sont obligatoires pour révéler des informations correctes à partir de cellules individuelles
2. Conditions préalables à l’isolement cellulaire
Le type de cellule, l’échantillonnage, la méthode d’isolement et l’analyse qui suit sont des caractéristiques importantes d’un flux de travail complet, et à ce titre elles doivent être optimisées
3. Amplification REPLI-g.
L’amplification QIAseq Single Cell REPLI-g est une technologie plus performante que la PCR pour l’étude du génome et du transcriptome à partir de cellules uniques et d’ADN ou d’ARN en faibles quantités
4. Enrichissement spécifique avec les composants QIAseq
Les kits QIAseq Single Cell Library Kits UDI bénéficient d’une nouvelle composition du tampon qui permet l’enrichissement spécifique des petits génomes

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