Métatranscriptomique du SARS-CoV-2

Déchiffrez les interactions hôte-microbiome pour faire avancer la recherche sur la métatranscriptomique relative au coronavirus

En déchiffrant l’interaction complexe entre l’hôte et son microbiote, vous pouvez obtenir des informations détaillées sur l’hôte, le microbiome, le virus et les réponses des voies. Si vous utilisez un mélange d’échantillons humains et bactériens issus de tissus nasopharyngés, pulmonaires et autres pour la recherche sur la métatranscriptomique relative au SARS-CoV-2, un ARNr de l’hôte et bactérien très abondant peut être problématique et conduire à des résultats inexploitables.

Améliorez la sensibilité du séquençage d’ARN dans la métatranscriptomique du SARS-CoV-2

Plus votre stratégie d’extraction d’ARNr sera efficace, plus vous obtiendrez des résultats exploitables au séquençage d’ARN. Pour optimiser les résultats uniques de l’expression génique, extrayez > 95 % des ARNr de l’hôte et bactériens en 1 heure seulement, tout en conservant les ARN viraux grâce aux QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kits et aux QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kits, utilisés ensemble ou séparément. Vous passez ensuite à la préparation d’une banque brin spécifique de haute qualité à l’aide du QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit pour la détection sensible des molécules d’ARN de faible expression avec une complexité et une couverture de transcription accrues.

Bénéficiez de la spécificité et l’efficacité de la procédure QIAseq complète pour accélérer la recherche sur la métatranscriptomique relative au SARS-CoV-2.

QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit
QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

Pour l’extraction rapide d’ARNr et/ou d’ARNm de la globine pour la préparation de la banque de séquençage d’ARN à partir d’échantillons humains, de souris, de rat et d’autres échantillons mammaliens

En savoir plus
QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit
QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit

Pour l’extraction rapide d’ARNr 5S/16S/23S pour la préparation de la banque de séquençage d’ARN à partir d’échantillons d’ARN de bactéries

En savoir plus
QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
Pour la préparation de banques de séquençage d’ARN du transcriptome entier brin spécifique pour les applications de NGS sur les instruments Ilumina
En savoir plus
Demandez un kit d’essai

QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

Demander un Kit d’essai

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit

Demander un Kit d’essai

QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit

Demander un Kit d’essai
Optimisez les résultats du séquençage d’ARN utilisables dans la métatranscriptomique du SARS-CoV-2
Découvrez à quel point nos solutions rapides et efficaces d’extraction d’ARNr peuvent transformer vos travaux de recherche.
Découvrez le paysage mutationnel du SARS-CoV-2 avec la technologie QIAseq

Découvrez comment l’association des technologies QIAseq FastSelect et QIAseq FX pour générer des banques de NGS dépourvues d’ARNr humain a permis d’obtenir des données plus précises dans cette étude phylogénétique sur le SARS-CoV-2.

Référence : Hartley et al. (2020) Genomic surveillance of Nevada patients revealed prevalence of unique SARS-CoV-2 variants bearing mutations in the RdRp gene

Une réinfection au SARS-CoV-2 est-elle possible ?

Voyez comment cette étude a utilisé QIAseq FastSelect pour l’extraction d’ARNr et QIAseq FX pour l’amplification et le séquençage du génome viral afin de découvrir une différence génétique entre les isolats du SARS-CoV-2.

Référence : Tillett et al. (2020) Genomic evidence for a case of reinfection with SARS-CoV-2

Extraction d’ARNr pour les applications de séquençage d’ARN impliquant des virus, les réponses de l’hôte et la métatranscriptomique
Extraction d’ARNr pour les applications de séquençage d’ARN impliquant des virus, les réponses de l’hôte et la métatranscriptomique
Intervenant : Dr Samuel Rulli, directeur associé, profilage du séquençage d’ARN, technologies de dosages par NGS, QIAGEN
S’inscrire maintenant
Les panels d’ARN ciblé pour identifier le SARS-CoV-2 et étudier l’expression génique de l’hôte
Les panels d’ARN ciblé pour identifier le SARS-CoV-2 et étudier l’expression génique de l’hôte
Intervenant : Dr Samuel Rulli, directeur associé, profilage du séquençage d’ARN, technologies de dosages par NGS, QIAGEN
S’inscrire maintenant