Importance de l’extraction d’ARNr dans l’optimisation du séquençage d’ARN

Découvrez l’ingrédient manquant dans votre flux de travail de séquençage d’ARN

QIAseq FastSelect permet un séquençage d’ARN de haute qualité à partir d’un mélange d’échantillons humains et bactériens

Le Dr Marie Adams, responsable génomique au Van Andel Institute, explique comment la technologie QIAseq FastSelect a permis de générer des données de séquençage d’ARN de haute qualité pour les études de co-expression humaine et bactérienne d’après un même échantillon d’ARN.

QIAseq FastSelect ouvre la voie à un meilleur traitement du cancer

« QIAseq FastSelect s’est montré un atout précieux pour le séquençage d’ARN dans mon projet. L’ARN était dégradé, presque inutilisable, mais QIAseq FastSelect a véritablement éliminé l’ARN ribosomique de ces échantillons dégradés et amélioré nos banques de séquençage. »

Brandon Mistrella, département de biologie et biochimie de l’université de Houston

Les chercheurs sur le cancer de l’université de Houston ont souvent fait l’expérience de difficultés liées à la dégradation de l’ARN lors de la manipulation d’échantillons FFPE. La présence d’espèces d’ARN indésirables telles que l’ARN ribosomique et l’ARNm de la globine dans l’échantillon d’ARN de faible rendement est venue compliquer davantage encore le séquençage de l’ARN. Découvrez comment QIAseq FastSelect a transformé leurs travaux de recherche, en leur permettant d’obtenir des données précieuses de séquençage d’ARN d’après un ARN FFPE.

QIAseq FastSelect permet de créer des banques de séquençage d’ARN à partir d’ARN FFPE de qualité médiocre

« La procédure est très simple et rapide. Compte tenu de la qualité médiocre des échantillons et de leur faible quantité, j’avoue que je ne m’attendais pas aux résultats obtenus. »

Dr Fabienne Desmots-Loyer, chercheuse en hématologie, CHU de Pontchaillou, Rennes, France

Étant donné l’importance de la dégradation et les faibles quantités, il peut être difficile d’utiliser de l’ARN issu d’échantillons FFPE. Lisez l’histoire du Dr Fabienne Desmots-Loyer, de l’hôpital de Rennes, et découvrez comment QIAseq FastSelect l’a sauvée en fournissant des banques de haute qualité à partir d’échantillons de cancer FFPE, que deux laboratoires commerciaux avaient refusé de traiter en raison d’une importante dégradation et de trop faibles quantités d’ARN.

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Une extraction d’ARNr nettement plus rapide et facile

Tandis que d’autres méthodes d’extraction d’ARNr prennent plusieurs heures, nécessitent de nombreuses étapes, fonctionnent seulement sur un ARN non fragmenté ou n’extraient simplement pas suffisamment d’ARNr, la méthode FastSelect vous offre une procédure nettement plus rapide et plus pratique, et des résultats exceptionnels même avec des échantillons FFPE et d’ARN fragmenté.