GeneRead Link Software

GeneReader NGS System とLIMS (ラボ情報管理システム)間でのデータ自動転送

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GeneRead Link Software, Standard Implementation

Cat. No. / ID:   9025028

Standard package for the GeneReader NGS System, including GeneRead Link software license, assessment of laboratory infrastructure, alignment with LIMS provider for implementation of GeneRead Link interface in LIMS, on-site installation, configuration, post-installation testing, and user training
GeneRead Link is for Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures. Please note: The GeneReader NGS System is currently only available with proprietary new sequencing chemistry in the US. Legacy sequencing chemistry is only available ex-US.

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Features

  • データをLIMS からGeneReader NGS System へ、そして結果をLIMSに戻すというデータ自動転送
  • 結果をチェックするための労力および時間の削減
  • サンプルに関する全データの履歴管理
  • GeneReader NGS System で実証ずみのパフォーマンス

Product Details

GeneRead Link は、サンプル調製からデータ解析というGeneReader NGS System ワークフローにおけるサンプルの連続作業管理を完結するミドルウェア製品です。本製品は、FASTQファイル、変異コーリングファイル (VCF)、機器関連レポート、結果ファイル、ユーザーの注釈を含むGeneReader NGS System からのすべての関連データを検索可能なアーカイブとして提供します。GeneRead Link は、GeneRead QIAcube、GeneReader、QIAGEN Clinical Insight (QCI) バイオインフォマティクスプラットフォームを含むGeneReader NGS System とLIMS との間のデータ転送を自動化し、研究室でのワークフローの効率化および生産性を改善します。

Principle

ラボでのワークフローには異なる機器で実施した多くのステップが含まれています。それらの機器とLIMSとの間でのデータ転移が完全に統合されていない場合には、データを手作業で移行しなければならず、間違えが起きやすく、時間も経費もかかります。

この強力なGeneRead Link Software は、GeneReader NGS System とLIMS 間のデータ転送を自動化し、サンプルから結果までの効率的な自動化ワークフローを実現します。

 GeneRead Link は以下の事項を可能にします:
  • 標準化されたHL7 インターフェイスを経由してどのようなLIMS にも接続
  • 保留中のワークフローステップをトラッキング
  • ワークフローにおけるサンプルポジションを完全制御
  • プロセスデータの完璧な履歴管理
  • データ処理のための手作業を削減
  • 機器から得られた結果ファイルと接続された機器のレポートのすべてをアーカイブ
  • アーカイブされたデータを簡単に検索
  • 結果の状態およびQC スコアをベースにしたワークフローの制御
  • 無効なラン結果あるいはQC スコアが低いサンプルの再テスト

Procedure

どのようなLIMSにも接続可能で柔軟性を増大

GeneRead Link Software により、LIMS とGeneReader NGS System との間で両方向への接続を容易に実施できます。結果の自動エクスポートは、結果をチェックするために必要な時間と労力を削減し、ヒューマンエラーを排除します。本インターフェイスは、QIAGEN がお届けする仕様書を用いてお客様のLIM のプロバイダにより簡単に実装できます。
GeneRead Link ミドルウェアは、自動およびマニュアルの両ワークフローステップに対するワークフロー管理を認識し、GeneReader NGS System ワークフローを促進します。ソフトウェアへの接続、機器のランあるいは解析を開始するための情報提供、結果の収集および処理により、機器やバイオインフォマティクスパイプラインが統合されています。GeneRead Link は、ワークフローの開始から終了までのすべてのサンプル情報を一つのレポートに表示します。

自動データ処理

GeneRead Link は、前もって設定済みの機器インターフェイスを提供することにより、機器とGeneReader NGS System のソフトウェア間のデータ管理を促進し、その結果データ処理の手作業を減らすことができます。ソフトウェアへの接続、機器のランあるいは解析を開始するための情報提供、結果の収集および処理により、機器やバイオインフォマティクスパイプラインが統合されています。

プロセスデータの履歴管理

GeneRead Link は、ワークフローの開始から終了までのすべてのサンプル情報を連結した一つのプロセスレポートに表示し、連続作業管理をサポートます。使用したキットおよび機器に関する情報、得られたQS スコアとQC 結果、ワークフロー中に発生した可能性がある偏差、そしてサンプルの状態を提供します。
 
保留中のテスト順番およびプロセス待ちのサンプルのトラッキング

GeneRead Link は、GeneReader NGS System ワークフロー内で、保留中のワークフローステップおよび次の処理ステップを待っているすべてのサンプルに関する概要を提示し、実験室での作業を追跡するのに役立ちます。

より高い操作性

GeneRead Links はすべてのワークフローでユーザーのガイド役を務め、NGSワークフローの一般概要を提示し、現在進行中のワークフローステップがハイライト表示されます。さらに、操作説明書やワークフローステップに特化した機器説明書をロードしてユーザーに提供したり、試薬容量や希釈ファクターを計算することで、ユーザーをサポートします。

完全インストールサービスで迅速なスタートアップ

QIAGEN は、お客様のラボのインフラを解析し、GeneRead Link ソフトウェアをお客様のラボでのワークフローにスムーズに統合できるよう、お客様のLIMS プロバイダと緊密な共同作業を行います。専門知識を持つQIAGEN Field Service Specialist が、研究室でGeneRead Link Software をインストールし、環境設定や広範なテストを行ないます。研究室のスタッフはこのトータルシステムのオペレーションに関して十分にトレーニングされます。

Applications

GeneRead Link は、QIAGEN GeneRead QIAact 遺伝子パネルを用いるためのGeneReader NGS System からLIMS への自動データ転移を実現します。