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次世代シークエンシング

シングルセルシークエンシング

画像提供: Namocell

最小限のサンプルから最大限の洞察を得る

シングルセル、細胞集団、または低インプットDNAやRNAを扱う場合でも、ゲノムやトランスクリプトームをより深く理解する能力が制限されてはなりません。QIAseq Single Cell Library Kits UDIは、シングルセルや限られた量の核酸からゲノムやトランスクリプトームの詳細を解明するお手伝いをします。ワンチューブワークフローを使用して、最小限の実践時間で非常に複雑な全ゲノムまたは全トランスクリプトームライブラリーを調製します。バイアスのことが心配ですか? PCRフリープロトコールとはすなわち、量が少ない転写産物の損失やGCおよび長さのバイアスによるライブラリーの多様性への悪影響を回避できることを意味します。Unique Dual Index(UDI)を含めることで、Illumina NGS装置での「インデックスホッピング」に起因するシークエンシングアーチファクトを最小限に抑えることができます。
QIAseq Single Cell DNA Library Kits UDI
  • シングルセルから全ゲノムライブラリーを
    4時間未満で作成
  • ゲノムのあらゆる場所のシークエンスとコピー数多型を分析
  • フォローアップ検査用のPCRフリーNGSライブラリーと増幅したgDNAを提供
  • REPLI-g DNAポリメラーゼMDAはハイフィデリティ増幅を提供し、偽陽性を低減
  • Illumina NGS装置での“インデックスホッピング”に起因するシークエンシングアーチファクトを最小限に抑えるUnique Dual Indexを含む
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QIAseq Single Cell RNA Library Kits UDI
  • シングルセル、細胞集団から開始、または低分子RNAゲノムやウイルスを濃縮
  • mRNAに焦点を当てるか、トランスクリプトームを探索するか選択
  • REPLI-g RNA増幅とPCRフリーのプロトコールによりバイアスが減り、再現性が向上
  • NovaSeqおよびパターン化フローセルからの高品質データを保証するUnique Dual Indexを含む
  • 5.5時間でシングルセルからNGS対応ライブラリー
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タイトル:低インプットまたは稀なシングルセルゲノミクス用のRNAおよびDNAプレートシークエンスワークフローの活用

講演者:Felix Alonso-Valenteen Ph.D., Field Application Scientist, Namocell and Ioanna Andreou, Ph.D., Associate Director R&D, NGS Applications Development, QIAGEN

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Namocellのシングルセル分離技術で、シングルセルを最速で取得。
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QIAseq Single Cell DNA Library Kits UDIを使用して、シングルセル全ゲノムライブラリー調製を始めましょう。
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QIAseq Single Cell DNA Library Kits UDIを使用して、シングルセルRNAシークエンスを開始しましょう。
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1. 単離方法の重要性
シングルセルから正確な情報を得るには、生存能力と穏やかな細胞の取り扱いが不可欠
2. 細胞単離の前提条件
細胞タイプ、サンプリング、単離方法、およびその後の分析は、完全なワークフローにおける重要な属性であり、最適化する必要があります
3. REPLI-g増幅
QIAseq Single Cell REPLI-g増幅は、PCRと比較して、シングルセルおよび低インプットDNAまたはRNA由来のゲノムとトランスクリプトーム研究の優れた技術です。
4. QIAseqケミストリーを用いる特異的濃縮
QIAseq Single Cell Library Kits UDIは、新しいバッファー組成を利用して、小さなゲノムの特異的濃縮を可能にします
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