困難なサンプルのエピジェネティックメカニズムを明らかにする

DNAシークエンスだけでは’ありません

遺伝子配列だけでは、遺伝子発現や細胞機能の全体像を表すことはできません。DNAメチル化を含むエピジェネティックなメカニズムは、DNA配列を変化させることなく遺伝子活性に影響を与えることができます。DNAメチル化は、安定した、遺伝性の、DNAに対する共有結合修飾で、主にCpGジヌクレオチドで生じますが、CpG以外の部位でも見られます。メチル化は、正常な発生過程だけでなく、発がんや、腫瘍抑制遺伝子やDNA修復遺伝子の遺伝子サイレンシングなどの他の病理学的過程で観察される変化にも関連しています。DNAメチル化度の調査は、FFPEやリキッドバイオプシー サンプルでは困難な場合があり、低インプットサンプルで機能する堅牢で信頼性の高いソリューションの必要性が高まっています。エピジェネティクスアプリケーション向けのQIAGEN’のSample to Insightソリューションは、このような課題に対応し、信頼できるデータと強力な洞察を提供します。

見ているのは真の変異体ですか、それとも偽陽性ですか？

増幅前に、バイサルファイト処理した各DNA分子に、独自の分子インデックス（UMI）でタグ付けします。分析中に、PCR重複や偽陽性を除去し、正確なメチル化プロファイルを提供します。

GC含有率の高い領域も含めて、すべての領域をカバーできますか？

シングルプライマーエクステンション（SPE）技術は、従来の2プライマーアプローチに比べ、各アンプリコンに対してひとつの特異的プライマーとユニバーサルプライマーだけを使用します。

すなわち：

• プライマーダイマーと脱落のリスクが低い
• 高い均一性
• 高いライブラリ複雑性
• 必要なプライマーのプールはひとつだけ

ターゲットパネルコンテンツをスケールアップしますか？ SPEはプライマーの再設計が不要です!

1本のチューブで1日でgDNAからメチロームの洞察まで

• 貴重なサンプルを節約：少量のインプット量で限られたサンプルを保護
• 時間を節約：シングルチューブプロトコールを使用して、ゲノムDNAからNGSライブラリまで1日で完了
• 信頼性の高い結果：メチル化されていないシトシンをウラシルに変換する高度に特異的で均一なバイサルファイト処理
• 統合されたデータ分析：すべての研究者向けの事前に作成されたカスタマイズ可能なバイオインフォマティクスワークフロー

当社のQIAseqターゲットメチルおよびカスタムパネルをご覧ください。

当社には、以下のイルミナ対応パネルがあります。

• ヒト乳がんパネル
• ヒト結腸直腸がんパネル
• 免疫-腫瘍パネル
• ヒトT細胞浸潤パネル

パイロシークエンシングを完全自動化

パイロシークエンシングは、配列検出と定量を統合し、遺伝子発現調節におけるエピジェネティックなDNAメチル化を調べる研究アプリケーションで重要な役割を果たします。ユーザーによる手動操作なしで一本鎖DNAサンプルを調製する、使いやすい自動化プロトコールをご覧ください。