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디지털 PCR

PCR의 새로운 절댓값 – 디지털 PCR

알아보기 - 디지털 PCR(Digital PCR, dPCR)

건초더미에서 바늘 찾기

복제 수 변이 및 희귀 표적 검출 등 민감한 애플리케이션을 실험하는 연구자들은 흔히 강력한 배경 신호에 비해 약한 유전자 신호를 식별하는 데 어려움을 겪습니다(특히 음성이 집중된 풀에 단일 양성 신호가 소실된 경우). 희귀한 대립 유전자 또는 돌연변이 시퀀스를 찾은 것은 전형적인 건초더미에서 바늘을 찾는 문제입니다! 디지털 PCR(Digital PCR, dPCR)은 검체를 다수의 개별 반응으로 분할하는 기술입니다. 이 접근 방법을 사용하면 단일 양성을 매우 쉽게 검출할 수 있습니다. 그러한 경우 real-time PCR에서 낮은 검출 한계로 인해 실행하지 못했던 실험에 대한 해결책이 될 수 있습니다.

QIAGEN의 사명은 real-time 및 디지털 PCR 연구에서의 난제를 극복하는 데 필요한 모든 것을 제공하는 것입니다. 결국, 건초더미에서 바늘 찾기가 그렇게 어려운 문제가 아니게 될 수 있습니다.

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미래가 디지털이라면, PCR의 미래도 마찬가지 아니겠어요? qPCR의 친숙성과 용이성은 유지하면서 과학적 통찰을 얻는 데 걸리는 시간을 연장하지 않고 디지털 PCR의 높은 민감도와 정밀도를 얻는다고 생각해 보세요. QIAGEN에서 제공하는 완전 통합된 나노플레이트 기반 디지털 PCR 시스템인 QIAcuity는 연구의 요구 사항과 현재 제공되는 방법의 한계를 염두에 두고 설계되었습니다. 이제는 qPCR에서 전환하는 작업을 단순화하고 디지털 PCR의 변화하는 환경에 맞는 중요한 연구 애플리케이션을 준비해야 할 때입니다.

미세방울(droplet) 디지털 PCR 기술 대비 장점

나노플레이트 기반 기술은 디지털 미세방울 PCR (Digital Droplet PCR, ddPCR)에 비해 상당한 이점을 제공합니다. 이는 다음과 같습니다.

• 고정된 분획물로 사이즈 변이 및 병합이 방지됩니다
• 밀봉된 나노플레이트로 웰 간 오염이 방지됩니다
• 검체의 모든 분획물의 동시 측정으로 보다 신속한 판독이 가능합니다
• 사용자 친화적, 친숙한 플레이트 방식은 qPCR과 마찬가지로 피펫팅하기가 용이합니다
• 플레이트는 front-end 자동화가 가능합니다

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참고 문헌

Huggett JF et al. (2013). The digital MIQE guidelines: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments. Clin Chem. 59(6):892-902.

dMIQE Group, Huggett JF. (2020). The Digital MIQE Guidelines Update: Minimum Information for Publication of Quantitative Digital PCR Experiments for 2020. Clin Chem. 66(8):1012-1029.

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