암 연구

FFPE 자료 센터

FFPE 포커스 시리즈

QIAGEN 과학자들이 그들의 전문지식을 공유합니다

전 세계에 보관된 포르말린 고정(Formalin-fixed), 파라핀 분해 조직 절편(paraffin-embedded) FFPE 조직 절편의 아카이브는 생물 의학 연구를 위한 가치있고 방대한 재료 공급원이 됩니다. FFPE 조직은 소중하기는 하지만 분석물 정제 및 다운스트림 분자 분석을 위해 매우 효율적인 방법을 필요로 하는 까다로운 검체 유형이며, 이는 FFPE 검체의 특성을 다룰 수 있습니다. 당사에 팁과 요령 시리즈에 로그인하여 QIAGEN 과학자들의 전문지식을 활용하세요.

웨비나, 동영상 및 그 이상

핵산 준비

분석 전 고려사항

Martin Schlumpberger: FFPE 검체 – 기본 사항

Martin은 FFPE 샘플로부터 분자 분석에 영향을 주는 다양한 요인 그리고 소중하면서도 까다로운 이 샘플 유형으로 작업할 때의 주요 난제와 고려사항을 강조하면서 웹 세미나 시리즈를 시작합니다.

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Daniel Groelz: 분석 전 고려사항 – 표준 및 검사실에서의 이행 방법

Daniel은 FFPE 샘플로부터의 핵산 분석에 영향을 주는 분석 전 요인, 국제적 이니셔티브, 그리고 분석 전 워크플로를 표준화하기 위한 요건과 검사실에서 이러한 표준을 이행하는 방법에 관해 논합니다.

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Martin Schlumpberger: 핵산 준비 – DNA, RNA 및 동일한 FFPE 샘플로부터 둘 다 회수

Martin은 효율적인 파라핀 제거, 크로스링크(crosslink) 및 인공물 제거(artifact removal), DNA/RNA 무결성 조절 및 다운스트림 분석에 대한 이의 영향 등과 같은 FFPE 샘플로부터 높은 수율과 고품질의 DNA와 RNA를 획득하고 확인하기 위한 주요 고려사항을 논의합니다.

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트렌드를 보기 위한 투표

암 연구에서의 트렌드를 인식하는 것은 우리의 지식을 가속화하고 이 분야를 발전시키는 데 도움이 될 수 있습니다. 관심 주제에 대한 귀하의 의견을 공유하고 라이브 투표에서 그 결과를 알아보세요. 커뮤니티 페이지에서 이를 찾아보고 새로운 투표에 대한 아이디어가 있으면 의견을 보내주세요.

아이디어 공유하기

DNA 메틸화

Ioanna Andreou: FFPE 샘플로부터의NGS 에서 메틸 마커 검출

Ioanna는 표적 메틸화 염기서열 분석에 의한 FFPE 샘플로부터의 DNA 메틸화 분석에 관해 논의합니다. Ioanna는 고유 분자 지표(unique molecular index, UMI) 및 단일 프라이머 연장(single primer extension, SPE) 기술을 이용하여 1일이 소요되는 시퀀싱 워크플로우를 논의합니다.

Norbert Hochstein: 파이로염기서열 분석에 의한 메틸화 분석 – 앰플리콘 길이 및 DNA 주입량의 영향

Norbert는 메틸화 분석을 위한 파이로시퀀싱 워크플로우에 대한 개요와 FFPE 샘플을 이용한 자신의 파이로시퀀싱 연구에서의 주요 발견사항과 결과에 대한 앰플리콘 길이와 DNA 주입량이 결과에 미치는 영향을 이야기합니다.

miRNA 발현

Francesca Di Pasquale: PCR에 의한 miRNA 분석

Francesca는 FFPE 샘플로부터의 miRNA로 작업할 때 흔히 접하는 난제 그리고 qPCR에 의한 miRNA 발현을 위한 프라이머 설계, 품질 관리, 데이터 정규화에 대한 주요 고려사항에 대해 논의합니다.

Marie-Louise Lunn: 암 바이오마커 개발에서의 miRNA FFPE ISH

Marie-Louise는 고정 핵산(locked nucleic acid, LNA)을 이용한 위치 파악 연구를 위하여 최적화된 miRNA in situ hybridization에 대해 논의합니다. 또한 ISH 프로토콜 최적화를 위하여 최적화된, 비독성, 1일 프로토콜 그리고 필요한 대조물질에 대해 논의합니다.

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RNA 염기서열 분석(RNA-seq) 및 멀티모달 NGS

Jonathan Shaffer: FFPE 샘플의 전체 전사체(Whole transcriptome) NGS

Jon은 유전자 및 검출된 유전자에 맵핑된 판독을 확연히 증가시키는 전장 전사체 RNA 염기서열 분석 동안 FFPE 샘플로부터 효율적으로 rRNA를 제거하여 강력한 차등 발현 분석을 유도하는 새 기술을 소개합니다.

Jonathan Shaffer: FFPE 샘플로부터의 멀티모달 NGS 분석

Jon은 DNA 변형과 RNA 융합 둘 다 동시 프로파일링을 위한 새로운 워크플로우인 멀티모달 NGS에 대해 설명합니다. 그는 예를 들어 이 솔루션을 사용하여 FFPE 샘플로부터 통합된 DNA와 RNA 표적 라이브러리 제작이 가능하게 하는 방법을 예를 들어 논의합니다.

Leif Schauser: QIAGEN CLC Genomics Workbench를 사용한 NGS 데이터 분석

Leif는 NGS 데이터 분석을 위한 QIAGEN CLC Genomics Workbench 그리고 FFPE에 관련된 주요 기능을 소개합니다. 라이브 데모에서 DNA 염기서열 분석(DNA-seq)과 RNA 염기서열 분석(RNA-seq) 데이터 분석 워크플로의 주요 단계를 설명합니다.

기술 가이드라인

FFPE 샘플로부터의 성공적인 바이오마커 프로파일링

FFPE 조직 절편은 소중하기는 하지만 분석물 정제 및 다운스트림 분자 분석을 위해 매우 효율적인 방법을 필요로 하는 까다로운 샘플 유형입니다.
FFPE 샘플 준비에 대한 최신 방법과 중요한 고려사항 그리고 분자 분석을 위한 분석 전 워크플로우 단계에 대해 알아보세요.

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제품

FFPE 샘플의 실제 잠재력을 발견하세요

샘플 준비부터 데이터 분석까지, NGS, 디지털 PCR, PCR 또는 qPCR에 의한 분자 분석 – FFPE 샘플로부터의 성공적인 분자 분석을 위한 QIAGEN의 Sample to Insight 솔루션에 대해 알아보세요

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포커스 제품:

QIAamp DNA FFPE Advanced Kit

FFPE 조직 샘플로부터 DNA를 분리하는 이 차세대 키트를 이용하여 증폭 가능한 DNA 수율을 높일 수 있습니다. 또한 자일렌 프리(xylene-free), 무세척 파라핀 제거, 이중 용해 프로토콜은 자동화될 수 있습니다.

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