Circulating cell-free DNA

조직 생검이 여전히 진단의 표준이기는 하지만 이는 한 시점만을 나타내고 반복성, 비용 및 시간의 제한을 받습니다. ccfDNA는 간단한 혈액 검사로 암 및 기타 질병의 바이오마커를 검출하고 모니터링하는 데 사용할 실시간 돌연변이 정보를 제공함으로서 이를 극복합니다.
ccfDNA는 희귀 돌연변이와 함께 낮은 농도에서 발견되거나 단편화된 상태로 발견되는 경우가 많기 때문에, 검출하는 신호에 대한 확신을 주는 신뢰성 있는 도구가 필요합니다. 바이오마커 발견, 이식 또는 NIPT 연구의 어느 분야에서 종사하든지 당사는 최고의 품질 보증과 함께 ccfDNA 샘플 준비 및 분석에 대한 최고 표준 솔루션을 제공합니다.

일반 사항

ccfDNA란 무엇인가요?

많은 연구에 따르면 ctDNA로도 알려진 ccfDNA의 수치 증가가 다양한 질병, 특히 암을 앓고 있는 환자의 혈액에서 발견될 수 있다는 것을 보여주었다. ccfDNA는 체세포 돌연변이가 있다는 점에서 정상 cell-free DNA와 다르며, 이는 치료 반응을 결정하고 치료 결정을 안내하는 유전적 마커로 사용할 수 있습니다. 돌연변이 ccfDNA의 수준은 암 환자를 추적 관찰하고 최소 잔여 질병을 검출하는 데에도 유용할 수 있습니다.

ccfDNA 분리 시의 문제를 어떻게 극복할 수 있나요?

당사의 QIAamp MinElute ccfDNA Kit 및 EZ1 ccfDNA Kit는 고유한 비드 및 컬럼 기반 방법을 사용하여 단편화된 DNA의 효율적인 회수, 1-10 ml의 확장 가능한 샘플 투입량, 유기 추출 또는 에탄올 침전 없음, 오염 물질 및 억제제의 효과적인 제거를 제공함으로써 연구 목적으로 인간 혈장 또는 혈청으로부터 고품질 물질을 신뢰성 있게 제공합니다.

하나의 샘플로부터 하나 이상의 분석물을 분리할 수 있나요?

QIAamp ccfDNA/RNA Kit는 동일한 혈장 샘플에서 ccfDNA와 ccfRNA를 함께 분리하여 동일한 용리액에서 두 분석물의 우수한 수율과 품질을 제공합니다.
이를 통해 동일한 액체 생검 샘플에서 DNA와 RNA 돌연변이를 모두 분석하거나 검출 민감도를 높여 빈도가 낮은 종양 돌연변이를 발견할 수 있습니다.

샘플 채취

채혈할 혈액의 최소량은 얼마인가요?

시판되는 대부분의 키트에서 혈장과 ccfDNA를 추가로 처리하려면 각 채혈 시 8–10 ml의 혈액이 필요합니다. PAXgene Blood ccfDNA Tube와 유사하게, 10 ml의 채혈이 필요합니다. 이 측정치는 진공 튜브가 올바르게 채워졌을 때 혈액 1 ml당 세포 안정화 첨가제의 비율이 0.15 ml가 되도록 하기 위한 것입니다.

혈액 채취란 전혈, 혈청, 혈장 중 무엇의 채취를 의미하나요?

샘플 채취를 위해 PAXgene Blood ccfDNA Tube는 인간의 전혈을 수집합니다. 그런 다음 튜브와 함께 프로토콜을 사용하여 혈장을 처리할 수 있습니다. ccfDNA는 QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit를 사용하여 수동으로 정제하거나 QIAsymphony PAXgene Blood ccfDNA Kit를 사용하여 자동으로 정제할 수 있습니다.

PAXgene Blood ccfDNA 튜브로 채혈할 때 나비 바늘을 사용할 수 있나요?

예,  PAXgene Blood ccfDNA Tube는 표준 혈액 채취 기구와 함께 사용할 수 있습니다. 또한, 샘플 채취 절차에 대한 자세한 내용은 PAXgene Blood ccfDNA Tube 핸드북을 참조할 수 있습니다.

샘플 안정화 및 준비

PCR을 이용한 분석 및 DNA 추출을 위해 어떤 종류의 혈액 안정화를 사용해야 하나요?

혈액 안정화는 가교 결합 시약(crosslinking reagent)에 의한 DNA 변형을 방지할 수 있는 경우 바람직합니다. PAXgene Blood ccfDNA Tube는 가교 결합(crosslinking)을 포함하지 않는 안정화에 대한 대체 독점 솔루션을 사용합니다. 이 솔루션을 사용하면 gDNA의 방출을 줄이고 용혈을 최소화하여 샘플의 무결성을 효과적으로 보존하는 동시에 PCR 결과를 복잡하게 할 수 있는 DNA 변형을 방지할 수 있습니다.

DNA 메틸화 상태가 혈액 내에서 유지되나요?

예, PAXgene Blood ccfDNA 시스템으로 정제된 ccfDNA는 중아 황산염(bisulfite) 처리가 필요한 메틸화 특정 분석에 사용할 수 있습니다. 이 포스터에서는 Agilent Bioanalyzer를 사용하여 0일 및 6일의 두 시점에서 EDTA, Streck 및 PAXgene Blood ccfDNA Tube의 성능 또한 비교했습니다. 6일 후에 Streck 샘플의 주요 ccfDNA 피크에서 7-8 bp 이동이 있음을 확인했으며, 이는 포름알데히드 방출 시약에 의한 DNA 변형을 나타냅니다.

자세한 내용은 해당 지역 QIAGEN 담당자 또는 기술 서비스 부서에 문의하세요.