까다로운 검체에서 후성 유전적(epigenetic) 메커니즘을 밝힘

DNA 염기서열 이상의 정보가 있습니다

유전자 염기서열만으로는 유전자 발현이나 세포 기능의 전체적인 정보를 나타내지 못합니다. DNA 메틸화를 포함한 후성 유전학적(epigenetic) 메커니즘은 DNA 염기서열을 변경하지 않고도 유전자 활성에 영향을 미칠 수 있습니다. DNA 메틸화는 주로 CpG 디뉴클레오티드에서 발생하지만 CpG가 아닌 부위에서도 발견되는 안정적이고 유전 가능한 DNA 공유결합 변형입니다. 메틸화는 정상적인 발달 과정뿐만 아니라 종양억제 유전자 또는 DNA 복구 유전자의 유전자 침묵과 같은 다른 병리학적 과정 및 종양형성 동안 관찰할 수 있는 변화와 관련이 있습니다. FFPE 및 액상 생검 검체에서 DNA 메틸화 정도를 조사하는 것은 어려울 수 있으며, 이는 저투입 검체로 가능한 강력하고 신뢰성 있는 솔루션의 필요성을 증대 시킵니다. 후성 유전학(epigenetics) 애플리케이션을 위한 QIAGEN의 Sample to Insight 솔루션은 이러한 문제를 해결하여 신뢰성 있는 데이터와 강력한 통찰력을 제공합니다.

진정한 변이체인가요 아니면 위양성인가요?

중아 황산염 처리된 각 DNA 분자는 증폭 전에 고유한 분자 색인(unique molecular index, UMI)으로 표시됩니다. 분석하는 동안 PCR 중복 및 위양성이 제거되어 정확한 메틸화 프로파일을 제공합니다.

GC 함량이 높은 모든 영역을 포함하여 모든 영역을 커버할 수 있나요?

단일 프라이머 확장(Single primer extension, SPE)은 기존의 2-프라이머 접근 방식과 달리 각 앰플리콘에 대해 단 하나의 특정 프라이머와 범용 프라이머를 사용합니다.

이는 다음을 의미합니다.

• 프라이머 이합체(dimer) 및 탈락 위험 감소
• 더 높은 균일성
• 더 높은 라이브러리 복잡성
• 프라이머의 단일 풀만 필요

타겟 패널 컨텐츠를 확장하시나요? SPE를 사용하면 프라이머 재설계가 필요하지 않습니다!

하나의 튜브로 하루 안에 gDNA에서 메틸놈(methylome) 통찰력까지

• 소중한 검체 절약: 적은 투입량이 필요하기 때문에 제한된 검체 보호
• 시간 절약: 단일 튜브 프로토콜을 사용하여 하루 안에 유전체 DNA에서 NGS 라이브러리까지
• 신뢰할 수 있는 결과: 메틸화되지 않은 시토신을 우라실로 전환하기 위한 매우 특이적이고 균일한 중아 황산염 처리
• 통합된 데이터 분석: 모든 연구자를 위한 사전 제작 및 맞춤형 생물정보학 워크플로우

당사의 QIAseq Targeted Methyl 및 Custom Panel을 살펴보세요.

Illumina 호환 가능한 패널에는 다음 패널들이 포함됩니다.

• Human Breast Cancer Panel
• Human Colorectal Cancer Panel
• Immuno-Oncology Panel
• Human T-cell Infiltration Panel

파이로시퀀싱 분석의 완전 자동화

파이로시퀀싱은 염기서열 검출 및 정량화를 통합하고 유전자 발현 조절에서 후성 유전학적(epigenetic) DNA 메틸화를 조사하는 연구 응용 분야에서 중요한 역할을 합니다. 사용자의 매뉴얼 작업 없이 단일 가닥 DNA 검체를 준비하는 사용하기 쉬운 자동화 프로토콜에 대해 알아보세요.