Sample to Insight workflow
마이크로바이옴

Sample to Insight 워크플로우

완벽한 마이크로바이옴 연구 워크플로우 작성

마이크로바이옴 연구는 다양한 샘플의 분석을 요구합니다. 신뢰성 있는 결과와 의미 있는 통찰력을 얻기가 어려울 수 있습니다. 핵산 분리에서 데이터 분석 및 해석에 이르기까지 전체 워크플로우에 있어 QIAGEN의 고유한 솔루션을 사용하여 귀중한 샘플을 최대한 활용하세요. 광범위한 솔루션과 어플리케이션을 탐색하는 데 도움이 되도록 전체 워크플로우에 대한 단계별 가이드를 마련했습니다.

microbiome diagram
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Powerlyzer_Tissuelyzer_II

마이크로바이옴 샘플은 용해하기 어렵기 때문에 까다롭습니다. 미생물은 단단한 세포외 기질을 포함할 수 있습니다. 미생물 군집이 불완전하게 용해되면 샘플의 미생물 함량이 부정확하게 표시됩니다.

세포용해 과정에서 편향(bias)이 발생하지 않도록 기계적 균질화가 권장됩니다. QIAGEN의 샘플 파쇄 솔루션은 재현성 있는 결과를 위한 전제 조건인 빠르고 강력하며 효율적인 균질화를 보장합니다.

제품군 
마이크로바이옴 샘플 파쇄를 위한 균질화 제품을 알아보세요

Vortex Adapters
instruments and automation accessories
Vortex Adapters
For maximizing homogenization with the Vortex-Genie 2 Vortex
Human biomedical research

인체 생물의학 연구

물질의 여러 출처는 DNA와 RNA를 분리하는 데 대해 다양한 문제를 제시합니다. 인체 생물의학 연구를 위한 QIAGEN 키트는 장, 대변, 면봉 등과 같은 특정 샘플 유형에 최적화되어 있습니다. 특허받은 Inhibitor Removal Technology®(IRT)는 정제 과정에서 억제제를 제거합니다. 그 결과로 까다로운 다운스트림 어플리케이션에서도 바로 사용할 수 있는 높은 수율의 순수 핵산을 얻습니다.

인간 생물의학 샘플 준비
하이라이트

대변 샘플에서 DNA 정제
QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit는 강력한 억제제를 제거하고 모든 다운스트림 어플리케이션에 즉시 사용할 수 있는 깨끗한 DNA를 제공합니다. DNA 준비는 QIAcube Connect에서 수동으로 또는 자동화를 통해 수행할 수 있습니다.
QIAsymphony에서 대변으로부터 DNA 정제 자동화
QIAsymphony PowerFecal Pro DNA Kit를 사용하면 대변 및 토양 샘플에서 억제제가 없는 DNA를 자동화, 시간 절약, 표준화된 추출이 가능합니다. 이 키트는 QIAsymphony에서 24개 샘플 배치를 지속적으로 로딩하는 192개 샘플용으로 설계되었습니다.
QIAcube HT에서 배설물 샘플로부터 DNA 정제 자동화
DNeasy 96 PowerSoil Pro QIAcube HT Kit는 24~96개 샘플 동시 처리를 위해 QIAcube HT를 사용하여 배설물 샘플에서 고품질 유전체 DNA를 간단하고 완전 자동으로 정제합니다.
면봉 및 체액으로부터 DNA 정제
QIAamp DNA Microbiome Kit는 정제 과정에서 숙주 DNA의 효과적인 고갈을 촉진하고 NGS 분석에서 박테리아 DNA 커버리지를 극대화합니다.
생물막 샘플로부터 DNA 정제
DNeasy PowerBiofilm Kit는 화학적 및 기계적 용해 기술과 억제제 제거 기술(Inhibitor Removal Technology, IRT)을 결합하여 가장 까다로운 생물막에서의 비효율적인 세포용해를 극복합니다. 이 키트를 사용한 DNA 정제는 QIAcube Connect에서 자동화될 수 있습니다.
생물막 샘플로부터 RNA 정제
RNeasy PowerBiofilm Kit로 비효율적인 세포용해를 극복하세요. 기계적 및 화학적 용해는 Inhibitor Removal Technology와 결합되어 순수하고 억제제가 없는 RNA를 분리합니다. 그 결과 얻은 RNA는 다운스트림 어플리케이션으로 추가 분석할 수 있습니다.
배설물 샘플로부터 DNA와 RNA 정제
AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit 프로토콜을 사용하면 한 샘플의 분리된 용출액에서 DNA와 RNA를 동시에 분리할 수 있습니다. 이 키트는 차세대 염기서열 분석(next-generation sequencing, NGS)을 사용한 메타유전체(metagenomic) 및 메타전사체(metatranscriptomic)분석에 최적화되어 있습니다.
배설물 샘플로부터 바이러스 또는 박테리아 DNA와 RNA 정제
AllPrep PowerViral DNA/RNA Kit는 PCR 억제제 함량이 높은 샘플에서도 바이러스 및 박테리아 총 핵산을 빠르고 쉽게 정제할 수 있도록 설계되었습니다. 그 결과 가장 까다로운 다운스트림 어플리케이션에서도 바로 사용할 수 있는 바이러스 및 박테리아의 DNA 및 RNA를 얻게 됩니다.
대변 및 장 물질로부터 RNA 정제
대변, 건조 분변, 장 물질, 오염된 구강점막세포 도말 및 분비물에서 총 RNA를 정제하도록 설계된 RNeasy PowerMicrobiome Kit는 까다로운 다운스트림 어플리케이션에서도 바로 사용할 수 있는 RNA를 분리합니다.

제품군
인간 생물의학 마이크로바이옴 샘플 준비를 위한 제품을 알아보세요

QIAamp PowerFecal Pro DNA Kits
dna purification genomic dna
QIAamp PowerFecal Pro DNA Kits
For the isolation of microbial DNA from stool and gut samples
DNeasy 96 PowerSoil Pro QIAcube HT Kit
dna purification genomic dna
DNeasy 96 PowerSoil Pro QIAcube HT Kit
For the isolation of microbial genomic DNA from soil and stool on the QIAcube HT
QIAsymphony PowerFecal Pro DNA Kit
dna purification microbial dna
QIAsymphony PowerFecal Pro DNA Kit
For the isolation of microbial genomic DNA from stool and soil on the QIAsymphony
AllPrep PowerViral DNA/RNA Kit
dna purification microbial dna
AllPrep PowerViral DNA/RNA Kit
For isolating viral or bacterial total nucleic acids from waste water and stool samples
AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit
dna rna purification multianalyte and virus
AllPrep PowerFecal DNA/RNA Kit
For simultaneous purification of genomic DNA and total RNA from stool samples
Rneasy PowerMicrobiome Kit
rna purification microbial rna
Rneasy PowerMicrobiome Kit
For the isolation of total RNA from stool and gut material
AllPrep PowerFecal Pro DNA/RNA Kit
dna rna purification multianalyte and virus
AllPrep PowerFecal Pro DNA/RNA Kit
For simultaneous purification of microbial DNA and total RNA from the same stool sample
RNeasy PowerFecal Pro Kit
rna purification microbial rna
RNeasy PowerFecal Pro Kit
For the isolation of microbial RNA from stool and gut samples, sludge, or wastewater
Sample preparation ENV AGR

환경 및 농업 연구

물질의 여러 출처는 DNA와 RNA를 분리하는 데 다양한 문제를 제시합니다. 환경 및 농업 연구를 위한 QIAGEN 키트는 토양, 물, 생물막, 식물 등과 같은 특정 샘플 유형에 대해 최적화되었습니다. 특허받은 억제제 제거 기술(Inhibitor Removal Technology, IRT)은 정제 과정에서 억제제를 제거합니다. 그 결과로 가장 까다로운 다운스트림 어플리케이션에서도 바로 사용할 수 있는 높은 수율의 고품질 순수 핵산을 얻습니다.

환경 및 농업 샘플 준비
하이라이트

모든 토양 유형으로부터 DNA 정제
DNeasy PowerSoil Pro는 퇴비, 점토 및 표토를 포함한 모든 토양 유형에서 높은 수율의 순수 미생물 DNA를 분리합니다. DNeasy PowerSoil Pro Kit를 사용한 DNA 추출은 QIAcube Connect에서 자동화될 수 있습니다.
QIAcube HT에서 토양으로부터 DNA 정제
DNeasy 96 PowerSoil Pro QIAcube HT Kit는 토양 샘플에서 고품질 유전체 DNA를 간단하게 완전 자동으로 정제합니다. QIAcube HT에서는 24~96개 샘플이 동시에 처리됩니다.
물로부터 DNA 정제
DNeasy PowerWater Kit는 염분, 금속, 부식성 물질 및 기타 유기 물질이 없는 여과된 물 샘플에서 유전체 DNA를 분리합니다. 이 키트는 높은 수준의 오염 물질이 포함된 물에서도 고품질 DNA를 분리할 수 있습니다. QIAcube Connect에서 정제가 자동화될 수 있습니다.
생물막 샘플로부터 DNA 정제
DNeasy PowerBiofilm Kit는 화학적 및 기계적 용해 기술과 특허받은 억제제 제거 기술(Inhibitor Removal Technology, IRT)을 결합하여 가장 까다로운 생물막에서의 비효율적인 세포용해를 극복합니다. 이 키트를 사용한 DNA 정제는 QIAcube Connect에서 자동화될 수 있습니다.
식물 세포, 조직 및 종자로부터 DNA 정제
DNeasy Plant Pro Kit에는 딸기 잎, 포도나무 잎, 솔잎 및 다양한 종자 유형을 포함하여 가장 까다로운 샘플 유형에서 고품질 DNA를 회수할 수 있는 여러 혁신적인 기능이 있습니다. 이 키트는 QIAcube Connect에서 자동화될 수 있습니다.
토양 샘플로부터 RNA 정제
RNeasy PowerSoil Total RNA Kit를 사용하여 최대 2g의 토양에서 총 RNA를 쉽게 분리할 수 있습니다. 이 키트는 모든 토양 유형에서 작동하지만, 특히 분뇨, 침전물 또는 퇴비와 같은 부식 물질 함량이 높은 샘플에 사용할 수 있습니다.
여과한 물 샘플로부터 RNA 정제
RNeasy PowerWater Kit를 사용하여 환경 물 샘플에 존재하는 모든 미생물로부터 RNA 분리. 이 키트는 박테리아(그람 +/-), 조류 및 곰팡이로부터 RNA를 분리합니다. 그 결과로 얻는 RNA는 RT-PCR, qPCR, RNA-seq 및 기타 다운스트림 어플리케이션에서 사용할 수 있습니다.
생물막 샘플로부터 RNA 정제
RNeasy PowerBiofilm Kit로 RNA 분리를 향상하세요. 기계적 및 화학적 용해는 억재제 제거 기술(Inhibitor Removal Technology)와 결합되어 효율적인 용해를 통해 생물막에 일반적으로 존재하는 억제제가 없는 순수한 RNA를 분리합니다. 그 결과 얻은 RNA는 다운스트림 어플리케이션으로 추가 분석할 수 있습니다.
당사의 DNA 분리 서비스를 이용하여 모든 샘플 유형으로부터 DNA 정제
QIAGEN DNA 분리 서비스를 사용하면 수십 년에 걸친 전문 지식을 귀하의 샘플 정제에 적용됩니다. 귀하의 다운스트림 어플리케이션에 가장 적합한 키트를 저희가 선택할 것입니다. DNA 정량화 및 순도 데이터를 제공할 수 있습니다.

제품군
환경 및 농업 마이크로바이옴 샘플 준비를 위한 제품을 알아보세요

DNeasy PowerSoil Pro Kits
dna purification microbial dna
DNeasy PowerSoil Pro Kits
For the isolation of microbial genomic DNA from all soil types
DNeasy 96 PowerSoil Pro QIAcube HT Kit
dna purification genomic dna
DNeasy 96 PowerSoil Pro QIAcube HT Kit
For the isolation of microbial genomic DNA from soil and stool on the QIAcube HT
RNeasy PowerSoil Total RNA Kit
rna purification microbial rna
RNeasy PowerSoil Total RNA Kit
For the isolation of high quality total RNA from all soil types
DNeasy PowerMax Soil Kit
dna purification microbial dna
DNeasy PowerMax Soil Kit
For the isolation of microbial DNA from large quantities of soil with low microbial load
DNeasy PowerLyzer PowerSoil Kit
dna purification microbial dna
DNeasy PowerLyzer PowerSoil Kit
For the bead-based isolation of DNA from tough soil microbes
모든 샘플 유형에서의 DNA 분리 서비스
고급 기술을 사용하여 추출 및 정량화에서 NGS 및 분석에 이르기까지.
NGS analysis

차세대 염기서열 분석(Next-generation sequencing, NGS) 방법은 마이크로바이옴 연구를 근본적으로 바꾸었습니다. NGS는 미생물 군집 내 수천 종의 동시 분석을 가능하게 합니다.

시약 및 프라이머 선택은 편향(bias)을 최소화하고 판독 심도(read depth)를 최대화하는 적절한 NGS 라이브러리 생성에 큰 역할을 합니다. QIAGEN은 균일한 커버리지(coverage)와 높은 판독 품질을 달성하기 위해 다양한 증폭 및 염기서열 분석 요구 사항에 맞는 다양한 키트를 제공합니다.

마이크로바이옴에 대한 NGS
하이라이트

숙주 대비 미생물 DNA의 차별화
UCP SYBR® Green PCRUCP Probe PCR 키트를 사용하여 면봉 또는 체액으로부터 NGS 라이브러리를 작성하기 전에 미생물 DNA와 숙주 DNA를 정량화할 수 있습니다. 전체 UCP 제품군에 관한 자세한 정보는 여기를 클릭하세요.
샷건 균유전체학적(Shotgun metagenomic) 염기순서분석
The QIAseq FX DNA Library Prep Kit는 복잡성이 높은 DNA 염기서열 분석 어플리케이션을 위한 완전한 효소 NGS 라이브러리 작성을 하며 낮은 GC 편향(bias), 우수한 커버리지 분포 및 낮은 복제율을 가집니다.
16S/ITS 프로파일링
QIAseq 16S/ITS Region PanelsQIAseq 16S/ITS Screening Panel은 단계별 프라이머를 사용하여 Illumina 플랫폼에서 박테리아 16S 가변 영역(variable regions)과 곰팡이 ITS 영역의 모든 조합을 조사할 수 있는 유연성을 통해 박테리아 및 곰팡이 군집에 대한 포괄적이고 확실한 프로파일링을 제공합니다.
표적 염기서열 분석(Targeted sequencing)
UCP Multiplex PCR Kit를 사용하면 자체 프라이머 세트를 사용하여 표적 염기서열 분석을 위한 편향(bias) 없는 사전 증폭이 가능합니다. UCP HiFidelity PCR Kit는 오류 없는 NGS 분석을 위한 탁월한 정확도를 제공합니다. 라이브러리 준비를 위해 QIAseq 1-Step Amplicon Library Kit를 선택하여 균일한 커버리지 분포를 가진 높은 수율의 라이브러리 DNA를 얻을 수 있습니다.
5S/16S/23S rRNA 제거 + 메타전사체학(Metatranscriptomics)
QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kits는 대량으로 존재하는 박테리아 5S/16S/23S rRNA를 RNA-seq 라이브러리로부터 제거합니다. 이 키트는 복잡한 군집 미생물 샘플용으로 설계되었습니다. QIAseq Stranded RNA Library Kits는 총 RNA 또는 mRNA가 풍부한 샘플에서 Illumina에 사용할 수 있는 RNA 염기서열 분석 라이브러리를 생성하는 우수한 방법을 제공합니다.
박테리아 및 곰팡이 군집의 포괄적인 프로파일링을 위한 유전체 서비스
귀하를 위해 저희가 해드리겠습니다. 16S/ITS 마이크로바이옴 프로파일링 서비스를 사용하면 까다로운 샘플에서 통찰력으로 빠르고 확실하게 옮겨갈 수 있습니다. 16S 가변 영역(variable region)과 ITS 영역의 조합을 조사할 수 있습니다.

제품군
마이크로바이옴에 대한 NGS 제품을 알아보세요 

QIAseq FX DNA Library Kit
next generation sequencing metagenomics
QIAseq FX DNA Library Kit
All-enzymatic whole genome and hybrid capture library preparation for Illumina instruments with minimal bias
까다로운 샘플를 위한 마이크로바이옴 프로파일링 서비스
첨단 기술을 사용하는 차세대 염기서열 분석 및 16S/ITS 영역 조사.
Digital insights
우수한 소프트웨어 패키지는 균유전체학(metagenomics) 데이터 해석을 지루한 작업에서 즐거움으로 바꾸는 데 큰 도움이 됩니다. 분류에서 다형성(polymorphism) 분석에 이르기까지 모든 요구 사항을 충족하는 도구와 기능을 통해 복잡한 데이터에서 귀중한 통찰력을 얻을 수 있습니다. 마이크로바이옴를 위한 QIAGEN의 생물정보학 솔루션은 사용하기 쉽습니다. 직관적인 인터페이스로 연구자가 정말 중요한 것에 집중할 수 있도록 도와줍니다.

제품군
마이크로바이옴 분석을 위한 디지털 통찰력을 알아보세요

QIAGEN CLC Genomics Workbench Professional
최첨단 생물정보학을 이용한 미생물 프로파일링, 병원체 유형 식별 및 발병 유행 분석
더 자세히 알아보기
QIAGEN CLC Genomics Workbench
차세대 염기서열 데이터 분석, 비교 및 시각화
더 자세히 알아보기

마이크로바이옴 연구 방법에 관한 자주 묻는 질문

16S 및 ITS rRNA 염기서열 분석이란 무엇인가요?

미생물 군집을 프로파일링하는 데 사용되는 가장 일반적인 방법은 박테리아와 곰팡이에 대해 각각 16S 리보솜 RNA(rRNA) 유전자와 내부 전사 스페이서(Internal Transcribed Spacer, ITS) 영역을 염기서열 분석하는 것입니다. 보편적인 분포와 보존된 특성으로 인해 16S rRNA 및 ITS 유전자는 박테리아 및 곰팡이 식별 및 분류에 사용되는 잘 확립된 유전 마커입니다.

16S rRNA 유전자는 고도로 보존된 영역과 초가변 영역으로 구성됩니다. 보존된 영역은 가변 영역의 PCR 증폭을 위한 프라이머 결합 부위 역할을 하고 가변 영역은 박테리아 식별 및 분류에 사용할 수 있는 서열을 포함합니다.

샷건 균유전체학적 염기순서분석(Shotgun Metagenomic Sequencing)이란 무엇인가요?

16S rRNA 및 ITS 염기서열 분석과 달리 샷건 균유전체학적 염기순서분석은 샘플에 존재하는 모든 유기체의 전체 유전체를 다룹니다.

샷건 균유전체학적 염기순서분석은 샘플의 모든 유전 정보를 다룹니다. 따라서 데이터는 메타유전체 조립 및 구간화(binning), 대사 기능 프로파일링 및 항생제 내성 유전자 프로파일링과 같은 다양한 분석에 사용할 수 있습니다.

메타전사체학(Metatranscriptomics)이란 무엇인가요?

메타전사체학은 자연 생활 환경에서 미생물 군집의 전체 유전자 발현 프로파일을 연구합니다. 메타전사체학으로 유전자 발현 수준 그리고 다양한 조건(예: 유기체의 생리적 대비 병리학적 상태)에서 반응의 변화의 정량화가 가능합니다.