在末端添加内标或标记
有两种方法可以使用酶对 DNA 进行标记:在分子末端或内部。可以通过酶作用添加 5’ 和 3’ 基团来引入可检测的标记物,例如荧光基团或经过修饰的核苷酸,以及使用合适的酶通过直接掺入或后标记技术引入内标。
对核酸添加标记的酶策略
许多旨在阐明核酸在体外和细胞内的功能和动力学的研究都需要通过酶的作用进行标记。对于每个可以将经过标记的核苷酸添加到 DNA 或 RNA 的位点,都有一种合适的酶可以催化这种添加反应。
酶 | 活性 | 标记作用 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|
末端 标记 |
直接 掺入 |
通过随机 引物 |
缺口标记 | 切口 平移 |
||
P7060L Klenow Fragment 即将推出 |
具有 5’→3’ |
✘ 否 | ✔ 是 | ✔ 是 | ✘ 否 | ✘ 否 |
P7010 Klenow (3’→5’ exo-) |
具有 5’→3’ 合成活性的 DNA 聚合酶 |
✔ 是 (3’ dsDNA) | ✔ 是 | ✔ 是 | ✘ 否 | ✘ 否 |
P7260L T7 DNA polymerase 即将推出 |
具有 5’→3’ 合成以及 3’→5’ ssDNA 和 dsDNA 核酸外切酶活性的 DNA 聚合酶。 [双链 DNA 核酸外切酶 活性需要硫氧还蛋白 的存在。] |
✔ 是 (5’ dsDNA) | ✔ 是 | ✘ 否 | ✔ 是 | ✘ 否 |
P7050L DNA polymerase I |
具有 5’→3’ 合成以及 5’→3’ 和 3’→ 5’ 核酸外切酶活性的 DNA 聚合酶 |
✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✔ 是 |
RP810 TaqNova Stoffel DNA Polymerase BLIRT |
Taq DNA 聚合酶的 Stoffel 片段衍生物(缺乏 5’→3’ 核酸外切酶活性) |
✘ 否 | ✔ 是 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 |
P7620L TaqIT DNA polymerase 即将推出 |
TaqIT 是 Taq DNA 聚合酶 的 5’→3’ 核酸外切酶 缺陷衍生物 (Stoffel) |
✘ 否 | ✔ 是 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 |
P7070L Terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) 即将推出 |
催化 dNTP 添加到 DNA 分子的 3' 羟基末端; 延伸带有 5’-突出平端的 ssDNA 和 RNA |
✔ 是 (3’ ssDNA) | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 |
P7180L T7 RNA polymerase 即将推出 |
按 DNA 模板的 5’→3’ 方向合成 RNA |
✘ 否 | ✔ 是 (RNA) | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 |
P7460L Poly(A) polymerase 即将推出 |
催化从 ATP 向 RNA 的 3’ 羟基添加 AMP, 形成带有 poly(A) 尾的 RNA |
✔ 是 (3’ RNA) | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 |
L6050L T4 RNA ligase 1 即将推出 |
连接 RNA 和 ssDNA 分子 |
3’(RNA 和 ssDNA) | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 |
Y9040L T4 polynucleotide kinase (PNK) |
催化 γ-磷酸酯从 ATP 转移到多核苷酸的 5´-端或转移到带有 5´-羟基的单核苷酸 |
5’(ssDNA、dsDNA 和 RNA) |
✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 | ✘ 否 |
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