RNA 生物标志物研究

合适的生物标志物对于改善癌症筛检、诊断和监测至关重要。哪个生物标志物将被证明是最佳标记物呢？

RNA 生物标志物的发现及其临床应用的发展具有挑战性。我们必须克服这些挑战，因为改善癌症患者筛检、预后和支持的最终目标才是最重要的。通过共同努力，我们能够让您的癌症生物标志物发现之旅更轻松并获得相应的结果。

我们在癌症 miRNA、癌基因表达、转录组或功能研究方面拥有全方位的 Sample to Insight 整体解决方案。在这里，您可以深入了解最常见工作流程的每一步，从而更容易找到所需的信息和产品。 我们为您提供经过验证的解决方案，从福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 和液体活检样本到 RNA 测序与发现新的癌症信号通路，以提高您的效率并加快 RNA 生物标志物研究。我们拥有共同的目标。我们共同努力攻克癌症。携手共进。

如果您正在从液体活检或 FFPE 样本中提取 RNA，您会知道其中存在很多挑战。储存条件、预处理和 RNA 的脆弱性意味着我们必须周密计划和充分准备，才能获得尽可能好的结果。我们汇集了一些有用的资源，帮助您开始或更深入地了解在从事 RNA 生物标志物相关工作时对样本制备相关的一些重要细节。

当您构建反应体系或将样本送往核心实验室时，如何确信自己的 RNA 分析是有效的？RNA 样本采集、储存和提取过程中的各种因素都会影响作为分析模板的 RNA。微小的质量差异就会对您的分析结果产生重大影响。这就是 RNA 质量控制的作用所在，让您高枕无忧。QC 方法可能有所不同，在网络研讨会以及我们在这里为您收集的其他资源中，对这个问题进行了探索和解释。

RNA 和 miRNA 测序

高通量测序 (NGS) 是 RNA 生物标志物发现和表征领域的一项强大技术，但在您的实验室中使用这种技术可能很复杂并且具有挑战性。如果您有大量的样本需要处理，我们可以提供帮助。我们正在努力使 NGS 尽可能简单易行——目标是使 NGS 像 PCR 一样容易，从而使 NGS 更加大众化，并支持较小的癌症研究实验室开始采用这项技术，以确保取得出色的分析结果。无论是分析基因表达还是分析融合基因，对于任意数量的样本，我们都将通过 NGS 解决方案加速您的 RNA 生物标志物发现。

RNA 测序数据分析

既然您已经成功地在生物标志物发现项目中使用 NGS 进行基因表达谱分析，那么您应该如何最好地分析原始数据才能继续前进呢？一种方法是使用在线数据分析工具

miRNA 表达谱分析

MicroRNA (miRNA) 通过调节数以千计的癌症相关基因广泛参与癌症的进展和抑制，而循环游离 miRNA 最近为早期癌症检测的非侵袭性检测开辟了新的机会。

然而，血清或血浆 miRNA 定量仍然缺乏一致性和标准化。如果您想克服 miRNA 定量方面的分析难题，请使用数字 PCR。数字 PCR (dPCR) 提供绝对定量，无需标准曲线，而且具有比 qPCR 更高的精确度。与 qPCR 相比，这在检测低丰度 miRNA 时尤为重要。通过准确测量循环 miRNA 水平，dPCR 成为发现癌症检测生物标志物的宝贵工具。

基因表达分析

基因表达变化是一个宝贵的指标，能够极大地扩展我们对许多生物学功能的理解。借助 dPCR，您可以将这种手段提升到一个新的水平，并克服以前的诸多限制。例如，低丰度靶标或 ≤2 倍的极小表达差异有何意义？您现在可以使用 dPCR 找到答案。

dPCR 方法的终点测量和绝对定量不需要标准曲线，因此它提供了比 qPCR 更精确和可重复的数据。这具有重大意义，尤其是对丰度极低的靶标进行定量时，这些靶标由于样本中的抑制剂和污染物含量过高而被稀释，或者表达水平非常低。

QIAGEN Digital Insights 拥有强大的生物信息学工具，可以帮助您理解隐藏在基因表达数据中的生物学意义。借助 QIAGEN OmicSoft，可以比较基因表达模式并直观地发现表达下调或上调的基因，以确定潜在的生物标志物。使用 QIAGEN OmicSoft，这个基于网络的 Land Explorer 能够访问数十万个精心整理的数据集，以检查数百种疾病类别的靶标表达或突变状态。

QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 有助于您了解基因表达变化的原因和影响，并确定需要进一步探索的潜在靶标。预测哪些上游调节因子为此负责，以及它们是被激活还是抑制。可视化展示下游效应以鉴定出哪些基因可能导致下游生物学过程的激活或抑制