Metatranscriptómica del SARS-CoV-2

Desentrañe las interacciones de microbiomas huéspedes para avanzar en las investigaciones metatranscriptómicas del coronavirus

Comprender la compleja forma en la que interactúan el huésped y la microbiota puede ayudarle a obtener información detallada en las respuestas de vías, virus, microbiomas y huéspedes. Si trabaja con una combinación de muestras humanas y bacterianas de nasofaringe, pulmón y otros tejidos para tareas de investigación metatranscriptómica del SARS-CoV-2, los grandes volúmenes de rARN de huésped y bacteria pueden resultar problemáticos y desperdiciar sus lecturas.

Mejore la sensibilidad de la secuenciación de ARN en la metatranscriptómica del SARS-CoV-2

Cuanto más eficaz sea la estrategia de eliminación de rARN, mejor será su capacidad para obtener lecturas útiles en la secuenciación de ARN. Para maximizar las lecturas de expresión genética, se debe eliminar más del 95 % del rARN huésped y bacteriano en menos de 1 hora y mantener los ARN víricos mediante QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kits y QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kits, por separado o combinándolos. Así podrá poner en marcha la preparación de genotecas catenarias de alta calidad con el QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit, que permite una detección sensible de moléculas de ARN de baja expresión con complejidad alta y cobertura de transcripción.

Consiga la eficiencia y la especificidad del flujo de trabajo completo de QIAseq para impulsar la investigación metatranscriptómica del SARS-CoV-2.

QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit
QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

Para eliminar el mARN de globina o rARN de cara a la preparación de genotecas de secuenciación de ARN de humano, ratón, rata y otras muestras de mamífero

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QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit
QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit

Para eliminar rápidamente el rARN 5S/16S/23S de cara a la preparación de genotecas de secuenciación de ARN a partir de muestras de ARN de bacterias

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QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
Para la preparación de genotecas de secuenciación de ARN de transcriptoma completo para aplicaciones de NGS en equipos Illumina
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QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

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Maximice la utilidad de las lecturas de secuenciación de ARN en la metatranscriptómica del SARS-CoV-2
Descubra la velocidad y eficiencia de las soluciones de eliminación de rARN y cómo pueden transformar su investigación.
Descubra el panorama mutacional del SARS-CoV-2 con la tecnología de QIAseq

Analice cómo se consiguió obtener más información sobre los estudios filogenéticos del SARS-CoV-2 mediante una combinación de las tecnologías de QIAseq FastSelect y QIAseq FX para generar genotecas de NGS sin rARN humano.

Referencia: Hartley et al. (2020) Genomic surveillance of Nevada patients revealed prevalence of unique SARS-CoV-2 variants bearing mutations in the RdRp gene

¿Es posible volver a contagiarse del SARS-CoV-2?

Vea cómo se emplearon en este estudio las tecnologías QIAseq FastSelect para eliminar el rARN y QIAseq FX para la amplificación del genoma vírico y la secuenciación para detectar discordancias genéticas entre unidades aisladas de SARS-CoV-2.

Referencia: Tillett et al. (2020) Genomic evidence for a case of reinfection with SARS-CoV-2

Paneles de ARN diana para identificar el SARS-CoV-2 y estudiar la expresión genética del huésped
Paneles de ARN diana para identificar el SARS-CoV-2 y estudiar la expresión genética del huésped
Orador: Dr. Samuel Rull, Associate Director, RNA-seq profiling, NGS Assay Technologies, QIAGEN
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