NGS workflows

Procédures de NGS

Grâce aux avancées permises par le séquençage à haut débit (NGS), le RNA-seq est devenu essentiel dans une gamme variée d’études des nombreux types d’ARN différents. Les technologies actuelles vont bien au-delà de la simple expression de l’ARNm et comprennent le séquençage de miARN et de transcriptomes entiers. Plusieurs techniques ont été développées récemment pour surmonter les principales difficultés et améliorer les résultats, par exemple par déplétion de l’ARNr et par ciblage d’ensembles spécifiques de transcrits à l’aide du RNA-seq digital.
Améliorez le RNA-seq grâce à une élimination efficace de l’ARNr
Pendant la préparation de banques de séquences ARN, les ARN très abondants de faible valeur scientifique, comme l’ARNr et/ou l’ARNm de globine, peuvent utiliser une capacité de séquençage précieuse, compromettant la possibilité d’obtenir des lectures d’expression génique sur cible. L’élimination efficace de l’ARN indésirable est une étape essentielle avant le RNA-seq.
La nouvelle technologie QIAseq FastSelect d’élimination de l’ARNr élimine les ARNr indésirables en une seule étape de pipetage dans les échantillons d’ARN provenant de mammifères, de bactéries, de plantes et même de levures. Que vous souhaitiez éliminer l’ARNr cytoplasmique et mitochondrial pour l’analyse de transcriptomes entiers, ou l’ARNm de globine pour la recherche sur l’expression génique avec des échantillons sanguins, cette nouvelle technologie peut maximiser les lectures.
Webinaire sur l’élimination de l’ARNr de nouvelle génération :
Notre équipe de R&D a décrit la façon dont nous avons développé et testé nos QIAseq FastSelect rRNA Removal Kits pour les échantillons provenant d’êtres humains, de mammifères, de bactéries, de plantes et de levures à l’aide d’ARN total de haute qualité et d’ARN fortement fragmenté.
Webinar] Next-generation rRNA removal: Evolution of new technologies for mammalian, bacterial, plant and yeast samples
Élimination de l’ARN ribosomique : L’étape la plus sous-estimée dans l’optimisation de RNA-seq
Lisez le témoignage du Dr Fabienne Desmots-Loyer, de l’hôpital de Rennes, et apprenez comment la gamme QIAseq FastSelect l’a sauvée en fournissant des banques de haute qualité à partir d’échantillons de cancer FFPE, que deux laboratoires commerciaux avaient refusé de traiter en raison d’un haut degré de dégradation et de trop faibles quantités d’ARN.
Ribosomal RNA removal: The most underestimated step in RNA-seq optimization

Solutions QIAseq

QIAseq Stranded RNA Library Kits
QIAseq Stranded RNA Library Kits
Les QIAseq Stranded mRNA Select Kits comprennent un protocole d’enrichissement de l’ARNm optimisé pour la création de banques de séquences ARN spécifiques aux brins et de haute qualité. Leur association avec la technologie QIAseq FastSelect permet d’éliminer l’ARN avant la préparation des banques spécifiques aux brins afin d’obtenir plus de lectures de séquences ARN ciblées.
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QIAseq FastSelect RNA Removal Kits
QIAseq FastSelect RNA Removal Kits
Explorez toute la gamme de produits QIAseq FastSelect. Quelle que soit l’origine des échantillons de RNA-seq avec lesquels vous travaillez – mammifères, plantes, bactéries ou levures –, nous avons une solution dédiée d’élimination de l’ARNr. Parcourez également les exemples de réussites dues à QIAseq FastSelect provenant de la communauté des chercheurs.
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Solutions QIAseq RNA pour les échantillons FFPE
Solutions QIAseq RNA pour les échantillons FFPE
Le degré élevé de dégradation et les rendements faibles font partie des difficultés à surmonter lorsque l’on travaille avec de l’ARN d’échantillons FFPE. Lisez cette note d’application pour découvrir comment les ARN à faible RIN dans les échantillons FFIP ont été récupérés pour un meilleur séquençage de l’ARN.
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Solutions Sample to Insight pour optimiser la découverte de biomarqueurs miARN
Les solutions de séquençage QIASeq miRNA pour l’analyse d’expression des miARN, des piARN et des petits ARN, ainsi que pour la découverte de nouveaux petits ARN, permettent la préparation de banques NGS de petits ARN ainsi que le contrôle qualité de la préparation d’échantillons et des performances du NGS.
QIAseq miRNA
Webinaire – « La vérité sur le séquençage de l’ARN »
L’une de nos meilleures spécialistes du domaine, Barbara R. Gould, vous fera bénéficier de son expertise et des nombreuses années d’expérience acquises par les services de génomique de QIAGEN. Ce webinaire portera sur les questions de la préparation de banques, des paramètres de séquençage, du contrôle qualité, de l’analyse des données et de la validation des résultats du NGS.
The truth about RNA sequencing

NGS pour la détection des microARN

Evaluation of methodologies for microRNA biomarker detection by NGS
Evaluation of methodologies for microRNA biomarker detection by NGS
Coenen-Stass et ses collègues ont testé des kits commerciaux pour le séquençage de petits ARN. Leur cohorte comprenait du plasma humain, du sérum humain, du cerveau de souris et une banque de référence. Ils émettent des directives pour choisir la préparation de banque sur des critères de sensibilité, de spécificité, d’exactitude et aussi de commodité.
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Compte rendu d’analyse des données de NGS des miARN
Compte rendu d’analyse des données de NGS des miARN
Les services de génomique de QIAGEN comportent un service de séquençage des miARN. Consultez cet exemple de compte rendu pour savoir à quelle procédure et à quelles sortes de résultats vous pouvez vous attendre lorsque vous faites appel au service de séquençage NGS des miARN.
Afficher le compte rendu
Avantages du séquençage 3’
L’utilisation du séquençage d'ARN 3’  a été importante dans la recherche sur les voies de signalisation cellulaire afin de répondre à la demande croissante en solutions haut débit qui garantissent également l’exactitude, la spécificité et la sensibilité. Ces témoignages d’utilisateurs expliquent comment ils ont réussi le NGS 3’ haut débit de transcriptomes à partir de quantités ultra-faibles d’ARN pour l’analyse de l’expression génique.
L’encapsulation renforce la signature des îlots de Langerhans dans les cellules souches pluripotentes induites humaines en cours de différenciation par l’intermédiaire de la signalisation des intégrines
« Pour nous, l’approche QIAseq UPX 3’ Transcriptome s’est avérée providentielle en permettant le séquençage à haut débit des quantités ultra-faibles d’ARN isolé à partir d’échantillons difficiles à traiter. Les résultats du projet pilote obtenus avec les services de génomique de QIAGEN ont dépassé nos attentes. À mon avis, c’est vraiment une approche à envisager lorsque la quantité d’ARN est inférieure au seuil minimal. » Simon Chera, maître de conférences, Université de Bergen.
Encapsulation boosts islet-cell signature in differentiating human induced pluripotent stem cells via integrin signaling
Webinaire – élucider les relations
« Le service UPX 3’ Transcriptome de QIAGEN nous a permis de générer une série de données de séquençage d’ARN à grande échelle ayant facilité la découverte de modifications essentielles dans l’expression génique qui déterminent notre modèle de maladie. » Matthew Dodson, postdoctorant, Université de l’Arizona.
[Webinar] Uncovering the connection between arsenic and type II diabetes

Produits à la une

QIAseq FastSelect RNA Removal Kits
QIAseq FastSelect RNA Removal Kits
Pour l’élimination rapide de l’ARNr dans la préparation de banques de séquences ARN à partir d’échantillons de RNA-seq de mammifères, bactéries, plantes et levures.
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QIAseq Stranded RNA Library Kits
QIAseq Stranded RNA Library Kits
Pour la préparation de banques de séquences ARN du transcriptome entier spécifiques aux brins dans les applications de NGS sur les instruments Ilumina.
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QIAseq UPX 3’ Targeted RNA Panels
QIAseq UPX 3’ Targeted RNA Panels
Pour l’analyse de l’expression génique ultraplex (UPX) à l’aide de la séquence ADN 3’ R à partir de cellules individuelles et d’échantillons à faible quantité d’ARN.
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Services de génomique
De la préparation de banques et du séquençage à l’analyse et à l’interprétation des données, nos experts sont toujours à votre disposition pour vous aider. Grâce à des années d’expérience et de technologies éprouvées, nous produisons des résultats de haute qualité auxquels vous pouvez vous fier.