SARS-CoV-2 宏转录组学

揭示宿主-微生物组交互作用,推进冠状病毒宏转录组研究

解密宿主与其微生物群之间的复杂交互作用能够揭示有关宿主、微生物组、病毒和通路反应的深层机理。如果您在处理来自鼻咽、肺和其他组织的人类和细菌混合样本以进行 SARS-CoV-2 宏转录组学研究,高丰度宿主和细菌 rRNA 可能会带来麻烦,造成数据浪费。

改善 SARS-CoV-2 宏基因组学中 RNA-seq 灵敏度

您的 rRNA 去除策略越有效,您在 RNA-seq 中获得可用数据的能力就越强。要获得尽可能多的有效数据,使用 QIAseq FastSelect –rRNA HMR Kits 和 QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kits 两者中任何一个或两者的组合,在 1 小时内即可去除 95% 以上的宿主和细菌 rRNA,同时可保留病毒 RNA。接下来,使用 QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit 进行高品质文库制备,以对低表达的具有更高复杂性和转录物覆盖度的 RNA 分子进行高灵敏检测。

利用该完整 QIAseq 工作流程的特异性和效率,可让您加速 SARS-CoV-2 宏转录组学研究。

QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit
QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

适用于在制备人、小鼠、大鼠和其他哺乳动物样本 RNA-seq 文库时快速去除 rRNA 和/或Globin mRNA

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QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit
QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit

适用于在制备细菌样本 RNA-seq 文库时快速去除 5S/16S/23S rRNA

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QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit
适用于针对Illumina 仪器上进行的 NGS 应用时的链特异性全转录组 RNA-seq 文库制备,
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QIAseq FastSelect –rRNA/Globin Kit

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QIAseq FastSelect –5S/16S/23S Kit

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QIAseq Stranded Total RNA Lib Kit

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最大化 SARS-CoV-2 宏基因组学中的可用 RNA-seq 数据
发现我们的快速高效的 rRNA 去除解决方案如何改变您的研究。
使用 QIAseq 技术揭示 SARS-CoV-2 的突变全景

了解联合使用 QIAseq FastSelect 和 QIAseq FX 技术以生成不含人 rRNA 的 NGS 文库如何在 SARS-CoV-2 系统发生学研究中辅助了更深入的数据解析。

参考文献Hartley et al.(2020) Genomic surveillance of Nevada patients revealed prevalence of unique SARS-CoV-2 variants bearing mutations in the RdRp gene

可能会发生 SARS-CoV-2 再感染吗?

了解该研究如何使用 QIAseq FastSelect 去除 rRNA 和 QIAseq FX 进行病毒基因组扩增并测序以揭示 SARS-CoV-2 不同毒株之间的基因不一致性。

参考文献Tillett et al.(2020) Genomic evidence for a case of reinfection with SARS-CoV-2

病毒、宿主应答和宏转录组学相关 RNA-seq 应用中的 rRNA 去除
病毒、宿主应答和宏转录组学相关 RNA-seq 应用中的 rRNA 去除
讲者:Samuel Rulli,博士,QIAGEN NGS 检测技术 RNA-seq 分析副总监
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用于鉴定 SARS-CoV-2 和研究宿主基因表达的靶向 RNA panel
用于鉴定 SARS-CoV-2 和研究宿主基因表达的靶向 RNA panel
讲者:Samuel Rulli,博士,QIAGEN NGS 检测技术 RNA-seq 分析副总监
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